More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_5942 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



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E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7251  Sodium-dicarboxylate symporter  94.53 
 
 		 402 aa  689    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6701  sodium:dicarboxylate symporter  94.76 
 
 		 412 aa  692    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.85411 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5578  sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 		 401 aa  771    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6444  sodium:dicarboxylate symporter  99.5 
 
 		 401 aa  769    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5942  sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 		 401 aa  771    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.482098 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0518  dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family protein  67 
 
 		 413 aa  525  1e-148  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1845  sodium:dicarboxylate symporter family protein  67 
 
 		 413 aa  525  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2103  sodium:dicarboxylate symporter family protein  67.5 
 
 		 413 aa  526  1e-148  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.151657  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0421  dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family protein  67 
 
 		 413 aa  525  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0832  dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family protein  66.75 
 
 		 413 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1463  sodium:dicarboxylate symporter family protein  66.75 
 
 		 413 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2148  sodium:dicarboxylate symporter family protein  66.75 
 
 		 413 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0112  sodium:dicarboxylate symporter  41.6 
 
 		 407 aa  286  4e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000289227  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2725  sodium:dicarboxylate symporter  33.76 
 
 		 429 aa  200  3.9999999999999996e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.074747  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1780  sodium:dicarboxylate symporter  32.21 
 
 		 435 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1380  sodium:dicarboxylate symporter  31.65 
 
 		 436 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1206  sodium:dicarboxylate symporter  33.33 
 
 		 421 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.350362  normal  0.678051 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0137  glutamate/aspartate:proton symporter  32.52 
 
 		 442 aa  196  7e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.926861 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2768  proton/glutamate symporter  32.26 
 
 		 430 aa  196  7e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1265  sodium:dicarboxylate symporter  32.99 
 
 		 433 aa  193  5e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.623713  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0153  glutamate/aspartate:proton symporter  33 
 
 		 442 aa  193  5e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.886104 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0155  glutamate/aspartate:proton symporter  32.6 
 
 		 442 aa  192  6e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1771  sodium:dicarboxylate symporter  30.4 
 
 		 437 aa  191  1e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.975695  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1664  sodium:dicarboxylate symporter  32.11 
 
 		 423 aa  191  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1613  proton/sodium-glutamate symport protein  31.99 
 
 		 423 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1846  proton/sodium-glutamate symporter  31.99 
 
 		 423 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00724946 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1648  proton/sodium-glutamate symport protein  31.99 
 
 		 423 aa  190  4e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5090  glutamate/aspartate:proton symporter  32.51 
 
 		 442 aa  190  4e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.293053  normal  0.123213 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1810  proton/sodium-glutamate symporter  31.99 
 
 		 423 aa  189  5e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3531  proton/sodium-glutamate symporter  31.99 
 
 		 423 aa  189  5e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1957  putative glutamate symport transmembrane protein  32.59 
 
 		 428 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0662435  normal  0.97409 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1920  proton/sodium-glutamate symporter  31.99 
 
 		 423 aa  189  7e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0764  sodium:dicarboxylate symporter  32.32 
 
 		 435 aa  189  8e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3259  sodium:dicarboxylate symporter  32.32 
 
 		 440 aa  189  8e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6277  glutamate/aspartate:proton symporter  31.76 
 
 		 444 aa  189  8e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3362  sodium:dicarboxylate symporter  32.32 
 
 		 440 aa  189  8e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0768  sodium:dicarboxylate symporter  32.76 
 
 		 444 aa  189  9e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3549  sodium:dicarboxylate symporter  32.76 
 
 		 444 aa  189  9e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0922  proton/glutamate symporter  32.38 
 
 		 424 aa  188  1e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1666  proton/sodium-glutamate symporter  31.74 
 
 		 423 aa  189  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3671  sodium:dicarboxylate symporter  32.76 
 
 		 444 aa  189  1e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1799  proton/sodium-glutamate symporter  31.74 
 
 		 423 aa  189  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6468  sodium:dicarboxylate symporter  31.77 
 
 		 442 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.955844  normal  0.0248013 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1555  proton/glutamate symporter family protein  32.75 
 
 		 423 aa  187  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000396651  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3086  Sodium/dicarboxylate symporter  31.86 
 
 		 434 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5604  sodium:dicarboxylate symporter  31.77 
 
 		 442 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72340  glutamate/aspartate:proton symporter  31.51 
 
 		 444 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5968  sodium:dicarboxylate symporter  31.77 
 
 		 442 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.431964  hitchhiker  0.00472549 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0174  glutamate/aspartate:proton symporter  32.26 
 
 		 443 aa  187  3e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0863  sodium:dicarboxylate symporter  32.64 
 
 		 443 aa  187  3e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1290  sodium:dicarboxylate symporter  32.41 
 
 		 443 aa  187  4e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3915  sodium:dicarboxylate symporter  33.61 
 
 		 437 aa  186  6e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1593  proton/glutamate symporter family protein  32.49 
 
 		 423 aa  186  7e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000481335  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1855  sodium:dicarboxylate symporter  33.08 
 
 		 414 aa  186  7e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03949  glutamate/aspartate:proton symporter  33.61 
 
 		 437 aa  186  8e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0233  proton/glutamate symporter  31.76 
 
 		 443 aa  186  8e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4633  glutamate/aspartate:proton symporter  33.61 
 
 		 437 aa  186  8e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4649  sodium:dicarboxylate symporter  30.26 
 
 		 437 aa  186  8e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03909  hypothetical protein  33.61 
 
 		 437 aa  186  8e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4322  glutamate/aspartate:proton symporter  33.61 
 
 		 437 aa  186  8e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3950  glutamate/aspartate:proton symporter  33.61 
 
 		 437 aa  186  9e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4540  glutamate/aspartate:proton symporter  33.61 
 
 		 437 aa  186  9e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5583  glutamate/aspartate:proton symporter  33.61 
 
 		 437 aa  186  9e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4598  glutamate/aspartate:proton symporter  33.61 
 
 		 437 aa  186  9e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1314  proton/sodium-glutamate symport protein  32.49 
 
 		 423 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000288738  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0042  glutamate/aspartate:proton symporter  31.51 
 
 		 443 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192783  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1153  sodium:dicarboxylate symporter  31.39 
 
 		 423 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000424647  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3480  sodium:dicarboxylate symporter  32.27 
 
 		 444 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5422  sodium:dicarboxylate symporter  32.28 
 
 		 427 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.747833  normal  0.94668 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3205  sodium:dicarboxylate symporter  31.65 
 
 		 435 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5060  sodium:dicarboxylate symporter  31.65 
 
 		 434 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.154454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6252  sodium:dicarboxylate symporter  31.54 
 
 		 442 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  normal  0.842573 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0480  Sodium:dicarboxylate symporter  31.77 
 
 		 433 aa  184  3e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.908174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1355  sodium:dicarboxylate symporter  32.49 
 
 		 424 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000159183  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0775  sodium:dicarboxylate symporter  31.71 
 
 		 432 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1450  proton/glutamate symporter family protein  31.99 
 
 		 423 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000273308  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1524  proton/glutamate symporter family protein  31.99 
 
 		 423 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.0675800000000005e-55 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3857  proton/glutamate symporter family protein  31.99 
 
 		 424 aa  182  7e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000638682  decreased coverage  0.00000000000134337 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0983  sodium:dicarboxylate symporter  30.33 
 
 		 422 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4628  glutamate/aspartate:proton symporter  31.46 
 
 		 436 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4537  glutamate/aspartate:proton symporter  31.46 
 
 		 436 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.94288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4677  glutamate/aspartate:proton symporter  31.46 
 
 		 436 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.844872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4628  glutamate/aspartate:proton symporter  31.46 
 
 		 436 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.740703 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4543  glutamate/aspartate:proton symporter  31.46 
 
 		 436 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.707717  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1315  proton/sodium-glutamate symport protein  31.74 
 
 		 423 aa  181  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.63752e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4295  sodium:dicarboxylate symporter  29.48 
 
 		 490 aa  181  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.19773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0008  sodium:dicarboxylate symporter  32.66 
 
 		 439 aa  181  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1487  proton/glutamate symporter family protein  31.74 
 
 		 424 aa  181  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000311717  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2248  sodium:dicarboxylate symporter  31.96 
 
 		 426 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.755377  normal  1 
 
 
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NC_012856  Rpic12D_1780  sodium:dicarboxylate symporter  33.6 
 
 		 422 aa  180  4e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.707685 
 
 
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NC_009092  Shew_0743  sodium:dicarboxylate symporter  31.11 
 
 		 433 aa  180  4e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0298  sodium:dicarboxylate symporter  32.98 
 
 		 438 aa  179  4.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000430577 
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_1904  sodium:dicarboxylate symporter  33.51 
 
 		 409 aa  180  4.999999999999999e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal  0.374206 
 
 
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NC_009436  Ent638_0277  glutamate/aspartate:proton symporter  32.09 
 
 		 437 aa  179  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.689217 
 
 
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NC_009253  Dred_0616  sodium:dicarboxylate symporter  33.6 
 
 		 413 aa  178  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013730  Slin_1737  sodium:dicarboxylate symporter  31.97 
 
 		 415 aa  179  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372635  normal  1 
 
 
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NC_013411  GYMC61_1379  C4-dicarboxylate transporter DctA  32.4 
 
 		 420 aa  178  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_010557  BamMC406_6139  sodium:dicarboxylate symporter  30.1 
 
 		 438 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007651  BTH_I2493  sodium:dicarboxylate symporter family protein  32.66 
 
 		 470 aa  177  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0585635  n/a   
 
 
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NC_007908  Rfer_3455  sodium:dicarboxylate symporter  29.35 
 
 		 433 aa  177  4e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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