More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2984 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2984  ABC transporter related  100 
 
 		 509 aa  1000    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.095171  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2191  ABC transporter related  61.04 
 
 		 516 aa  532  1e-150  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  39.64 
 
 		 504 aa  387  1e-106  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2604  ABC transporter related  44.29 
 
 		 522 aa  389  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.916852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  39.92 
 
 		 501 aa  387  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  42 
 
 		 497 aa  383  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2904  ABC transporter related  40.24 
 
 		 503 aa  379  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4658  ABC transporter related  42.89 
 
 		 497 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0580  ABC transporter related  41.12 
 
 		 508 aa  369  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.677056  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  44.1 
 
 		 504 aa  371  1e-101  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0289  ABC transporter related  42.77 
 
 		 506 aa  369  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2010  ABC transporter related  37.97 
 
 		 500 aa  366  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  40.28 
 
 		 517 aa  366  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1627  L-arabinose transporter ATP-binding protein  44.54 
 
 		 525 aa  366  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2401  ABC transporter related protein  43.35 
 
 		 505 aa  368  1e-100  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1800  ABC-type sugar transport system, ATPase component  39.76 
 
 		 492 aa  366  1e-100  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2159  ABC transporter related  41.34 
 
 		 500 aa  368  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.634503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  41.88 
 
 		 506 aa  368  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3310  ABC transporter related  43.36 
 
 		 505 aa  365  1e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156818  hitchhiker  0.00192862 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3207  L-arabinose transporter ATP-binding protein  44.76 
 
 		 515 aa  365  1e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0870889 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  43.42 
 
 		 512 aa  364  2e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1350  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  42.94 
 
 		 504 aa  363  4e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6710  ABC transporter, ATP binding subunit (putative high-affinity D-ribose transport)  42.94 
 
 		 507 aa  362  6e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11533  normal  0.0914748 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5601  ribose import ATP-binding protein RbsA  41.72 
 
 		 506 aa  362  6e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  41.35 
 
 		 497 aa  362  8e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2492  ABC transporter related protein  39.37 
 
 		 498 aa  362  9e-99  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3182  ABC transporter related  42.35 
 
 		 518 aa  361  2e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.868778  normal  0.140125 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  43.53 
 
 		 508 aa  360  3e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3569  ABC transporter related  40.67 
 
 		 516 aa  360  3e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.585388  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0291  ABC transporter related  42.32 
 
 		 514 aa  360  3e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06145  D-ribose transporter ATP binding protein  40.8 
 
 		 501 aa  360  3e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0046  L-arabinose transporter ATP-binding protein  43.32 
 
 		 522 aa  360  4e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.54995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2725  ABC transporter related  42.52 
 
 		 501 aa  360  4e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.92 
 
 		 501 aa  359  7e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.59 
 
 		 525 aa  358  9e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3264  ABC transporter  40.79 
 
 		 525 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000839316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  40.61 
 
 		 494 aa  358  9.999999999999999e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  38.99 
 
 		 494 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0501  ABC transporter related  39.52 
 
 		 511 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548503 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  39.92 
 
 		 501 aa  357  1.9999999999999998e-97  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0341  D-ribose transporter ATP binding protein  40.51 
 
 		 501 aa  357  1.9999999999999998e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6267  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  40.63 
 
 		 511 aa  357  2.9999999999999997e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4589  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.91 
 
 		 515 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173683 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  41.86 
 
 		 512 aa  356  5.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  41.86 
 
 		 512 aa  356  5.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4170  ABC transporter related  41.79 
 
 		 503 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.611876  normal  0.0273413 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  42.77 
 
 		 514 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  42.77 
 
 		 514 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  42.77 
 
 		 514 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1601  ABC transporter related  39.12 
 
 		 525 aa  355  1e-96  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1088  ABC transporter related  41.3 
 
 		 507 aa  354  2e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.117363 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0010  D-ribose transporter ATP binding protein  41.25 
 
 		 500 aa  354  2e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2266  ABC transporter related  38.05 
 
 		 499 aa  353  2.9999999999999997e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000122283  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  42.12 
 
 		 514 aa  354  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5318  ABC transporter related  41.48 
 
 		 508 aa  353  2.9999999999999997e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.398307  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1242  sugar ATP-binding ABC transporter protein  41.84 
 
 		 518 aa  353  4e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000341  ribose ABC transport system ATP-binding protein RbsA  40.32 
 
 		 501 aa  353  4e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1371  D-ribose transporter ATP binding protein  40.4 
 
 		 504 aa  353  5e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  42.33 
 
 		 513 aa  353  5e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4768  ABC transporter related  42.83 
 
 		 503 aa  353  5.9999999999999994e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957059  normal  0.347139 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2595  ABC transporter related  41.25 
 
 		 537 aa  352  5.9999999999999994e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.870253  normal  0.943264 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4030  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.45 
 
 		 507 aa  353  5.9999999999999994e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3235  ABC transporter related  39.17 
 
 		 506 aa  352  7e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.365394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4096  sugar transport ATP-binding protein  41.45 
 
 		 507 aa  352  7e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5219  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.6 
 
 		 515 aa  352  8e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  43.34 
 
 		 495 aa  352  8e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5640  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.6 
 
 		 515 aa  352  8e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.273168  normal  0.0496803 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0125  ABC transporter related  41.45 
 
 		 507 aa  352  8.999999999999999e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  42.59 
 
 		 513 aa  352  1e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3319  ABC transporter related  40.68 
 
 		 499 aa  351  1e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.612021  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3041  ABC transporter related  41.73 
 
 		 500 aa  351  2e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1508  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.13 
 
 		 496 aa  350  3e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.106354  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0211  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.64 
 
 		 517 aa  350  3e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40873  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  40.99 
 
 		 523 aa  350  3e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1612  ABC transporter related  39.13 
 
 		 496 aa  350  3e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  42.35 
 
 		 499 aa  350  4e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5475  L-arabinose transporter ATP-binding protein  43.51 
 
 		 520 aa  350  5e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0511877 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0426  ABC-type sugar (aldose) transport system, ATPase component  38.63 
 
 		 498 aa  349  5e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1760  ribose ABC transporter ATP-binding protein  39.13 
 
 		 496 aa  349  6e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.185473  hitchhiker  0.0000761209 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0343  ABC transporter related  41.24 
 
 		 497 aa  349  6e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3784  ABC transporter related  41.24 
 
 		 506 aa  349  7e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.915652  hitchhiker  0.00808443 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5597  ABC transporter related  40.16 
 
 		 503 aa  349  8e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.609428  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2304  ABC transporter related protein  40.87 
 
 		 505 aa  348  9e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2089  ABC transporter related protein  42.35 
 
 		 504 aa  348  1e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.558184  normal  0.156772 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3706  ABC transporter related  42.77 
 
 		 506 aa  348  1e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.594267  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2447  ABC transporter related protein  39.46 
 
 		 495 aa  348  1e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000548266  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  41.08 
 
 		 524 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  41.08 
 
 		 524 aa  348  2e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4920  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.71 
 
 		 519 aa  347  2e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.671617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  41.08 
 
 		 524 aa  348  2e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  37.42 
 
 		 496 aa  348  2e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  41.05 
 
 		 514 aa  347  3e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10500  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  42.91 
 
 		 499 aa  347  3e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3218  ribose import ATP-binding protein RbsA  38.03 
 
 		 501 aa  347  3e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0843  ABC transporter related  44.69 
 
 		 496 aa  347  3e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.896355  normal  0.0750454 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2370  ABC sugar transporter, ATPase subunit  44.07 
 
 		 518 aa  347  3e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3129  ABC transporter related  41.3 
 
 		 504 aa  347  3e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149382  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2808  ABC transporter ATP-binding protein  38.17 
 
 		 510 aa  347  3e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  45.25 
 
 		 508 aa  347  3e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2433  ribose import ATP-binding protein  40.04 
 
 		 510 aa  347  4e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>