67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2023 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_2023  hypothetical protein  100 
 
 
156 aa  305  2.0000000000000002e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1308  protein of unknown function DUF583  72.22 
 
 
162 aa  163  5.9999999999999996e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.677275  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0746  hypothetical protein  48.98 
 
 
223 aa  92  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0290  hypothetical protein  49.04 
 
 
185 aa  90.9  6e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4081  hypothetical protein  38.41 
 
 
186 aa  89.7  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1347  hypothetical protein  47.47 
 
 
221 aa  86.7  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3896  hypothetical protein  46 
 
 
184 aa  86.7  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5284  protein of unknown function DUF583  45 
 
 
171 aa  84.7  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0430  hypothetical protein  44 
 
 
183 aa  84.3  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0688488  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0579  protein of unknown function DUF583  46 
 
 
184 aa  84.3  6e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0600  hypothetical protein  46 
 
 
184 aa  84.3  6e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.927633  normal  0.296784 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2700  hypothetical protein  38.3 
 
 
224 aa  83.6  9e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.503004  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0798  hypothetical protein  44.44 
 
 
185 aa  83.6  9e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.188487  normal  0.0126197 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0151  hypothetical protein  43.24 
 
 
247 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1801  hypothetical protein  40.15 
 
 
185 aa  82.8  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.316822 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1225  protein of unknown function DUF583  41.58 
 
 
189 aa  74.7  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.933167  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2787  hypothetical protein  29.45 
 
 
191 aa  58.2  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.78265  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2564  hypothetical protein  32.32 
 
 
131 aa  57.4  0.00000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3691  hypothetical protein  33.67 
 
 
178 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.218067  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1928  hypothetical protein  28.3 
 
 
220 aa  53.9  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.238689  normal  0.284182 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3966  hypothetical protein  23.13 
 
 
168 aa  53.9  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.359315  normal  0.361845 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0024  hypothetical protein  31.25 
 
 
131 aa  52.4  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0202286 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3571  hypothetical protein  28.57 
 
 
137 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.885538  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3637  protein of unknown function DUF583  28.57 
 
 
122 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.914383  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3711  protein of unknown function DUF583  28.57 
 
 
122 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3692  hypothetical protein  28.57 
 
 
122 aa  50.8  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0882809  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3636  protein of unknown function DUF583  32.65 
 
 
179 aa  50.8  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.641699  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3710  protein of unknown function DUF583  32.65 
 
 
179 aa  50.8  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3570  hypothetical protein  32.65 
 
 
180 aa  50.4  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16081  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1545  hypothetical protein  30.53 
 
 
157 aa  47.4  0.00008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.353518  normal  0.46336 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0691  hypothetical protein  27 
 
 
161 aa  47.4  0.00008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1475  hypothetical protein  26.36 
 
 
149 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000135685  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1996  hypothetical protein  29.17 
 
 
228 aa  46.6  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.775695  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1511  hypothetical protein  26.36 
 
 
149 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0283593  normal  0.818291 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1480  hypothetical protein  26.36 
 
 
149 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000228441  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2872  protein of unknown function DUF583  26.36 
 
 
149 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000301369  hitchhiker  0.000000894597 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1890  hypothetical protein  28.12 
 
 
154 aa  46.2  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1716  hypothetical protein  26.53 
 
 
202 aa  46.2  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0478971  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2201  hypothetical protein  32.26 
 
 
109 aa  45.4  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0799  hypothetical protein  26.21 
 
 
166 aa  45.4  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000040318  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1585  protein of unknown function DUF583  23.58 
 
 
218 aa  45.1  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.397214  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1444  hypothetical protein  25.53 
 
 
141 aa  45.1  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000522592  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0923  protein of unknown function DUF583  28.09 
 
 
267 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.364799  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0933  hypothetical protein  28.09 
 
 
269 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.266977 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0899  hypothetical protein  28.09 
 
 
270 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23470  cell shape determination protein CcmA  25.53 
 
 
138 aa  44.3  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002252  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0548  hypothetical protein  23.71 
 
 
195 aa  43.9  0.0008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2478  hypothetical protein  31.07 
 
 
203 aa  43.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3438  hypothetical protein  28.09 
 
 
173 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0871  hypothetical protein  28.09 
 
 
262 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0250  hypothetical protein  23.47 
 
 
184 aa  42.4  0.002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3101  hypothetical protein  28.09 
 
 
262 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1402  protein of unknown function DUF583  28.28 
 
 
148 aa  42.4  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.937379  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01740  hypothetical protein  25.36 
 
 
196 aa  42  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0721  cell shape determination protein CcmA  27.66 
 
 
282 aa  41.6  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.511119 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1382  hypothetical protein  25.53 
 
 
137 aa  41.6  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1331  hypothetical protein  26.73 
 
 
139 aa  41.6  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0706  hypothetical protein  25.81 
 
 
171 aa  41.6  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000300244  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2923  protein of unknown function DUF583  20.39 
 
 
125 aa  41.6  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3256  hypothetical protein  26.6 
 
 
265 aa  41.2  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1431  hypothetical protein  25.53 
 
 
151 aa  41.2  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000096503  normal  0.140917 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3685  hypothetical protein  27 
 
 
143 aa  41.2  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.275009  normal  0.0102541 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1271  protein of unknown function DUF583  22.73 
 
 
158 aa  40.8  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.385232  normal  0.476408 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2189  hypothetical protein  26.85 
 
 
115 aa  40.8  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.841648  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3702  protein of unknown function DUF583  23.93 
 
 
154 aa  40.8  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0637  hypothetical protein  28.32 
 
 
131 aa  40.8  0.007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1454  protein of unknown function DUF583  22.32 
 
 
195 aa  40.4  0.01  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>