35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1171 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1171  hypothetical protein  100 
 
 		 717 aa  1461    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00026816  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3707  P4 alpha zinc-binding domain protein  35.78 
 
 		 681 aa  121  4.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3548  P4 alpha zinc-binding domain protein  35.78 
 
 		 681 aa  121  4.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.88149  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1360  hypothetical protein  33.75 
 
 		 362 aa  117  6.9999999999999995e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.182349  hitchhiker  0.000473429 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3699  P4 alpha zinc-binding domain protein  35.34 
 
 		 678 aa  115  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.482092  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0343  ATPase-like protein  26.72 
 
 		 679 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0321483  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1087  AAA ATPase  32.44 
 
 		 590 aa  111  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2479  hypothetical protein  28.91 
 
 		 367 aa  107  9e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.285758 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1577  bacteriophage P4 DNA primease  31.58 
 
 		 466 aa  105  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0190049  hitchhiker  0.000349117 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4830  hypothetical protein  31.18 
 
 		 407 aa  101  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.73367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4941  hypothetical protein  34.55 
 
 		 736 aa  100  8e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.670147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3137  hypothetical protein  32.55 
 
 		 647 aa  99.8  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0396  hypothetical protein, putative phage gene  26.49 
 
 		 358 aa  96.3  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.468414  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7593  AAA ATPase  30.08 
 
 		 421 aa  92.8  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.176071  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6725  hypothetical protein  30.97 
 
 		 759 aa  85.1  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.453988 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3653  hypothetical protein  28.94 
 
 		 387 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4150  hypothetical protein  29.07 
 
 		 382 aa  79.7  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.927631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1507  hypothetical protein  32.07 
 
 		 370 aa  76.6  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.805531  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1994  hypothetical protein  28.44 
 
 		 404 aa  74.3  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.370525 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3980  hypothetical protein  29.17 
 
 		 728 aa  70.9  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2266  hypothetical protein  29.35 
 
 		 464 aa  69.3  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0961  hypothetical protein  27.8 
 
 		 375 aa  68.6  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0320178 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6524  hypothetical protein  27.16 
 
 		 454 aa  64.7  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1535  hypothetical protein  27.62 
 
 		 756 aa  60.1  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175883  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1629  ATPase  24.14 
 
 		 666 aa  60.1  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.789736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2797  P4 family phage/plasmid primase  25.78 
 
 		 782 aa  58.5  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3911  hypothetical protein  27.89 
 
 		 587 aa  55.1  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.239652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1493  TOPRIM  31.29 
 
 		 437 aa  52  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.268011  normal  0.0585011 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5751  putative helicase  27.16 
 
 		 569 aa  51.6  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2542  replication protein A  37.78 
 
 		 292 aa  51.2  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000605873 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15380  replicative helicase, RepA  32.39 
 
 		 292 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  4.83585e-16  unclonable  1.14965e-21 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2522  hypothetical protein  27.17 
 
 		 487 aa  48.5  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.694376  normal  0.231254 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2139  ATPase-like protein  23.88 
 
 		 642 aa  47  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.51863 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1825  putative DNA helicase  41.43 
 
 		 299 aa  47.4  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.315744 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0949  aminotransferase  26.04 
 
 		 816 aa  45.1  0.005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0482781  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>