More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1117 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1117  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  100 
 
 
165 aa  335  1.9999999999999998e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0715  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  55.76 
 
 
164 aa  177  4e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1016  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  57.43 
 
 
168 aa  175  2e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.664946  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1356  NADH dehydrogenase subunit E  57.53 
 
 
157 aa  174  6e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3822  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  59.4 
 
 
154 aa  172  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.144781  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1124  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  58.09 
 
 
154 aa  169  2e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3129  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  59.7 
 
 
171 aa  169  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3424  NADH dehydrogenase subunit E  50.61 
 
 
166 aa  169  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.208277  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2829  NADH dehydrogenase subunit E  50 
 
 
166 aa  167  5e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0584484  normal  0.465649 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02210  NADH dehydrogenase subunit E  50 
 
 
166 aa  167  7e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1372  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  50 
 
 
166 aa  167  7e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00570397  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2434  NADH dehydrogenase subunit E  50 
 
 
166 aa  167  7e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2439  NADH dehydrogenase subunit E  50 
 
 
166 aa  167  7e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1367  NADH dehydrogenase subunit E  50 
 
 
166 aa  167  7e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.334565  normal  0.707376 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02170  hypothetical protein  50 
 
 
166 aa  167  7e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2578  NADH dehydrogenase subunit E  50 
 
 
166 aa  167  7e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.520034  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2661  NADH dehydrogenase subunit E  50 
 
 
166 aa  167  7e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0294149  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2509  NADH dehydrogenase subunit E  50 
 
 
166 aa  165  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.798131  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2671  NADH dehydrogenase subunit E  50 
 
 
166 aa  165  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.589813  normal  0.621084 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2564  NADH dehydrogenase subunit E  50 
 
 
166 aa  165  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.401608  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2464  NADH dehydrogenase subunit E  50 
 
 
166 aa  165  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.11895  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2553  NADH dehydrogenase subunit E  50 
 
 
166 aa  165  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.788767  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3305  NADH dehydrogenase subunit E  49.7 
 
 
183 aa  165  2.9999999999999998e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00437107  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28470  NADH dehydrogenase subunit E  53.29 
 
 
164 aa  163  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1563  NADH dehydrogenase subunit E  50 
 
 
187 aa  162  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.449918  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1495  NADH dehydrogenase subunit E  51.63 
 
 
181 aa  160  7e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.181853  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2769  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  49.67 
 
 
171 aa  159  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.217796  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0576  NADH dehydrogenase subunit E  49.68 
 
 
169 aa  158  3e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0587  NADH dehydrogenase subunit E  51.39 
 
 
169 aa  157  6e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1397  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  46.43 
 
 
176 aa  157  8e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.231323  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2547  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  46.34 
 
 
176 aa  155  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.15313  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29980  NADH dehydrogenase subunit E  47.37 
 
 
166 aa  154  4e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2567  NADH dehydrogenase subunit E  47.37 
 
 
166 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0332  NADH dehydrogenase subunit E  48.32 
 
 
157 aa  154  6e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1739  NADH dehydrogenase subunit E  57.25 
 
 
157 aa  153  8e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0103  NADH dehydrogenase subunit E  57.25 
 
 
157 aa  153  8e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0154  NADH dehydrogenase subunit E  46.31 
 
 
173 aa  153  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1692  NADH dehydrogenase subunit E  55.4 
 
 
157 aa  152  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175779  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0378  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  48.03 
 
 
167 aa  153  1e-36  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.320338  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1743  NADH dehydrogenase subunit E  47.37 
 
 
165 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.048618  normal  0.210443 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3606  NADH dehydrogenase subunit E  48.03 
 
 
165 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1870  NADH dehydrogenase subunit E  46.71 
 
 
165 aa  150  8e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.142581 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1696  NADH dehydrogenase subunit E  47.74 
 
 
170 aa  150  8.999999999999999e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.142144  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4122  NADH dehydrogenase subunit E  46.71 
 
 
165 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3694  NADH dehydrogenase subunit E  46.71 
 
 
165 aa  149  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0959076  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1018  NADH dehydrogenase subunit E  48.03 
 
 
180 aa  149  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1956  NADH dehydrogenase subunit E  46.94 
 
 
163 aa  148  3e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.131976  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2415  NADH dehydrogenase subunit E  47.37 
 
 
170 aa  147  9e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0144111  normal  0.147361 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3443  NADH dehydrogenase subunit E  45.64 
 
 
162 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3368  NADH dehydrogenase I, E subunit  47.62 
 
 
165 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3200  NADH dehydrogenase subunit E  46.94 
 
 
165 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.333269  normal  0.0237431 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1329  NADH dehydrogenase subunit E  49.67 
 
 
157 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.116663  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4740  NADH dehydrogenase subunit E  49.67 
 
 
162 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.871822  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0177  NADH dehydrogenase subunit E  42.48 
 
 
156 aa  144  6e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1350  NADH dehydrogenase subunit E  49.03 
 
 
157 aa  141  5e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.150858 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4068  NADH dehydrogenase subunit E  50.74 
 
 
157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.50582  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0207  NADH dehydrogenase subunit E  46.81 
 
 
162 aa  137  6e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0159  NADH dehydrogenase subunit E  43.79 
 
 
155 aa  134  4e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.458445 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2863  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  47.06 
 
 
179 aa  127  6e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.088948  hitchhiker  0.00474747 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0096  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.13 
 
 
162 aa  122  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000108902 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1339  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  38.96 
 
 
155 aa  122  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2253  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.22 
 
 
163 aa  121  5e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000369052 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2626  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.22 
 
 
163 aa  121  5e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.85829  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2701  NADH dehydrogenase I chain E  40.58 
 
 
155 aa  120  6e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2832  NADH dehydrogenase I chain E  40.58 
 
 
155 aa  120  7e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3619  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.61 
 
 
169 aa  116  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2236  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.93 
 
 
163 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0271  NADH dehydrogenase subunit E  40.94 
 
 
269 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2561  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  41.83 
 
 
175 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06310  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  35.53 
 
 
162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000454733  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1886  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.46 
 
 
159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0227  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  39.23 
 
 
157 aa  111  3e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00462802  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0990  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.36 
 
 
168 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.504399  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0558  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  35.17 
 
 
161 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.808339  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3292  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  33.96 
 
 
177 aa  108  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1045  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.22 
 
 
230 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3631  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.37 
 
 
170 aa  107  6e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.574819 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1312  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.29 
 
 
160 aa  107  8.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0916  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  35.53 
 
 
162 aa  106  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0158  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  39.53 
 
 
149 aa  107  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4084  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.93 
 
 
165 aa  106  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1687  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.91 
 
 
153 aa  105  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0632  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  47.17 
 
 
154 aa  106  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1627  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  47.17 
 
 
154 aa  106  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3189  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  47.17 
 
 
154 aa  106  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0492  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  35.17 
 
 
157 aa  105  3e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_153  [Fe] hydrogenase, HymA subunit  33.33 
 
 
155 aa  105  3e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1829  Fe-hydrogenase, gamma subunit  37.09 
 
 
148 aa  105  4e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1320  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.74 
 
 
174 aa  104  6e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2142  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  36.92 
 
 
160 aa  103  9e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1858  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  37.66 
 
 
160 aa  103  9e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0145  [Fe] hydrogenase, HymA subunit, putative  32.68 
 
 
155 aa  103  1e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.702609  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1393  formate dehydrogenase subunit gamma  31.76 
 
 
159 aa  103  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0833  NADH:ubiquinone oxidoreductase 24 kD subunit  36.48 
 
 
163 aa  103  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0712  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.16 
 
 
176 aa  103  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.8198  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0656  NADH:ubiquinone oxidoreductase 24 kD subunit-like protein  36.36 
 
 
182 aa  103  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0027799  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0734  NADH dehydrogenase subunit E  35.88 
 
 
166 aa  102  2e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0247603  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0471  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  39.16 
 
 
195 aa  102  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.671708  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0226  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  32.68 
 
 
155 aa  102  2e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0846  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  37.01 
 
 
162 aa  102  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>