43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4342 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_4342  hypothetical protein  100 
 
 		 253 aa  502  1e-141  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.121402 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2966  hypothetical protein  40 
 
 		 236 aa  75.9  0.0000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.280918  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0886  transcription antitermination protein NusG  28.98 
 
 		 212 aa  74.7  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000000269191  hitchhiker  0.00000687026 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1897  hypothetical protein  28.57 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.169609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0835  protein of unknown function DUF989  26.15 
 
 		 398 aa  59.7  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.510797  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1852  hypothetical protein  46.03 
 
 		 166 aa  58.2  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1372  hypothetical protein  45.07 
 
 		 174 aa  57.4  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2734  hypothetical protein  41.27 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.101284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2761  hypothetical protein  26.72 
 
 		 430 aa  57  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.654808  normal  0.643822 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1917  hypothetical protein  25.49 
 
 		 448 aa  56.6  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.159844  normal  0.631971 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2838  membrane protein  27.68 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.768899  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1345  protein of unknown function DUF989  25.38 
 
 		 397 aa  55.5  0.0000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.20155  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2934  membrane-like protein  41.27 
 
 		 188 aa  55.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.391683 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3039  hypothetical protein  35.71 
 
 		 204 aa  55.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1702  hypothetical protein  27.31 
 
 		 437 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.317159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1398  hypothetical protein  36.51 
 
 		 190 aa  53.9  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0259428  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3615  hypothetical protein  27.78 
 
 		 442 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.130992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2430  hypothetical protein  27.89 
 
 		 404 aa  52  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3914  hypothetical protein  25.5 
 
 		 415 aa  51.6  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.410571  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4289  hypothetical protein  27.67 
 
 		 446 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3853  hypothetical protein  27.67 
 
 		 442 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0186652  normal  0.587321 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1384  hypothetical protein  36.76 
 
 		 197 aa  51.2  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4624  hypothetical protein  26.51 
 
 		 412 aa  51.2  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.449143 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1579  hypothetical protein  27.67 
 
 		 442 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0576  hypothetical protein  36.76 
 
 		 197 aa  50.4  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02521  predicted membrane protein  27.27 
 
 		 426 aa  49.3  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.216294  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3105  hypothetical protein  44.26 
 
 		 204 aa  48.9  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.27509  normal  0.295178 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1781  protein of unknown function DUF989  26.38 
 
 		 438 aa  47.8  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.201182 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6197  hypothetical protein  24.9 
 
 		 417 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.328689 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2045  hypothetical protein  27.95 
 
 		 394 aa  46.2  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.654077 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1391  hypothetical protein  22.62 
 
 		 438 aa  45.8  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.196967  normal  0.0829452 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2611  hypothetical protein  25.9 
 
 		 413 aa  45.4  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3709  hypothetical protein  25.88 
 
 		 394 aa  44.3  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.191189  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3922  protein of unknown function DUF989  23.41 
 
 		 401 aa  44.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3670  hypothetical protein  25.91 
 
 		 421 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.753123  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44880  hypothetical protein  28.23 
 
 		 425 aa  43.5  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.798821  normal  0.217943 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1805  hypothetical protein  26.32 
 
 		 430 aa  43.5  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.916296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1932  hypothetical protein  24.57 
 
 		 397 aa  43.1  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.781025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2837  hypothetical protein  24.7 
 
 		 404 aa  43.1  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3294  hypothetical protein  26.1 
 
 		 407 aa  42.7  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.198313  normal  0.824259 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0455  hypothetical protein  25.82 
 
 		 411 aa  42.7  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.730035  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3822  hypothetical protein  27.82 
 
 		 423 aa  42  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0115673  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3478  hypothetical protein  26.8 
 
 		 419 aa  42  0.01  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.300585  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>