70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0162 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0162  amino acid transporter  100 
 
 		 755 aa  1543    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.063385 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2156  amino acid transporters  71.89 
 
 		 746 aa  1110    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.739886  normal  0.876305 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1104  amino acid transporter  39.42 
 
 		 676 aa  479  1e-133  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1196  amino acid permease-associated region  27.48 
 
 		 455 aa  92.4  3e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2796  amino acid permease-associated region  25.69 
 
 		 580 aa  79  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1345  amino acid permease-associated region  24.38 
 
 		 521 aa  72  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000295081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0920  Amino acid transporter-like  22.68 
 
 		 619 aa  67.4  0.000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000519212  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2018  hypothetical protein  23.63 
 
 		 609 aa  65.1  0.000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0010431  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2515  hypothetical protein  22.88 
 
 		 609 aa  65.1  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000264968  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2466  hypothetical protein  22.88 
 
 		 609 aa  65.1  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000341492  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0055  amino acid permease-associated region  24.33 
 
 		 428 aa  62.4  0.00000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.195903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2910  UspA domain protein  28.86 
 
 		 649 aa  61.6  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.12405  normal  0.0785631 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1601  amino acid transporter  24.56 
 
 		 636 aa  60.8  0.00000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.654948  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7673  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  21.5 
 
 		 815 aa  58.2  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.803412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21241  amino acid transporter  22.47 
 
 		 615 aa  57.4  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.97289 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2908  UspA domain protein  30.77 
 
 		 636 aa  57  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.1088  normal  0.0371725 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1758  amino acid permease-associated region  35.14 
 
 		 495 aa  53.9  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120604  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1642  putative transporter  25.96 
 
 		 654 aa  53.1  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.05725  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1638  amino acid transporter  22.79 
 
 		 615 aa  53.1  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1404  amino acid permease  27.17 
 
 		 678 aa  53.1  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.943899 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1324  hypothetical protein  24.32 
 
 		 668 aa  53.1  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.112475  normal  0.347698 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2100  ethanolamine transproter  23.77 
 
 		 486 aa  52  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00738274  normal  0.254622 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0046  amino acid permease-associated region  27.42 
 
 		 481 aa  52  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00849  cationic amino acid transporter  25.69 
 
 		 476 aa  52  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000255765  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06078  cationic amino acid transporter  25.69 
 
 		 476 aa  52  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0210338  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1930  amino acid permease-associated region  21.81 
 
 		 489 aa  51.2  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1294  ethanolamine transproter  27.66 
 
 		 467 aa  50.8  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3755  amino acid transporter  25.78 
 
 		 682 aa  50.8  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000328435  normal  0.279832 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1397  hypothetical protein  23.44 
 
 		 674 aa  49.3  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1880  hypothetical protein  25 
 
 		 608 aa  49.3  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000195786  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3464  hypothetical protein  25 
 
 		 608 aa  49.3  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000852812  decreased coverage  4.4181400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1974  amino acid transporter-like protein  23.22 
 
 		 629 aa  49.3  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1215  amino acid permease-associated region  27.63 
 
 		 792 aa  48.5  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1635  putative transporter  25.19 
 
 		 658 aa  48.9  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000053335 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0032  hypothetical protein  24.48 
 
 		 693 aa  48.1  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2474  amino acid permease-associated region  26.94 
 
 		 664 aa  48.1  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0436881  normal  0.698819 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1651  amino acid permease-associated region  21.84 
 
 		 501 aa  47.8  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2158  amino acid permease family protein  25.16 
 
 		 483 aa  47.8  0.0008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3581  amino acid transport protein  20.53 
 
 		 480 aa  47.4  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0683236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1838  amino acid permease-associated region  30.53 
 
 		 517 aa  47  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4627  amino acid permease  24.21 
 
 		 608 aa  47.4  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.486141  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2902  putative transporter  23.8 
 
 		 685 aa  46.2  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  32.97 
 
 		 476 aa  46.2  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  30.3 
 
 		 468 aa  46.6  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0590  amino acid permease-associated region  30.1 
 
 		 489 aa  46.2  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.806794  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  30.3 
 
 		 468 aa  46.6  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  30.3 
 
 		 468 aa  46.6  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1252  amino acid permease-associated region  35.48 
 
 		 481 aa  46.6  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1741  amino acid permease-associated region  25.32 
 
 		 467 aa  46.6  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.908164  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  32.97 
 
 		 476 aa  45.8  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1709  hypothetical protein  28.11 
 
 		 667 aa  45.8  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.71467  normal  0.0434218 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2924  amino acid permease-associated region  24.73 
 
 		 473 aa  45.8  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.670343  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2826  hypothetical protein  20.73 
 
 		 713 aa  45.8  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2448  amino acid permease-associated region  20.73 
 
 		 713 aa  45.8  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0321394 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  29.95 
 
 		 466 aa  46.2  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  29.95 
 
 		 466 aa  46.2  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1210  amino acid permease  23.05 
 
 		 585 aa  45.4  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.177071  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0974  amino acid permease-associated region  23.1 
 
 		 438 aa  45.4  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.11694 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1113  hypothetical protein  24.41 
 
 		 608 aa  45.1  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0305  amino acid permease-associated region  27.12 
 
 		 468 aa  45.1  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3641  amino acid permease-associated region  26.36 
 
 		 513 aa  45.1  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2567  amino acid permease-associated region  37.8 
 
 		 507 aa  45.1  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0275493 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  29.2 
 
 		 489 aa  45.1  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4037  ethanolamine transproter  24.41 
 
 		 486 aa  44.7  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.521145  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0195  amino acid permease-associated region  20.12 
 
 		 745 aa  44.7  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2749  amino acid permease-associated region  25.23 
 
 		 481 aa  44.3  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  normal  0.633141 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  27.73 
 
 		 491 aa  44.3  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1201  amino acid permease-associated region  24.38 
 
 		 615 aa  44.3  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0215506 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2679  amino acid permease-associated region  24.64 
 
 		 482 aa  44.3  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2625  amino acid permease-associated region  24.64 
 
 		 482 aa  44.3  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0475967  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>