42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3755 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3755  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 87 aa  165  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3973  XRE family transcriptional regulator  64.71 
 
 		 98 aa  57.4  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2711  hypothetical protein  41.54 
 
 		 94 aa  52.8  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.75348 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1918  transcriptional regulator, XRE family  45.28 
 
 		 94 aa  50.4  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0543598  normal  0.812558 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2282  XRE family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 95 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.545722  normal  0.280221 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1776  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 79 aa  48.5  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0912116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6295  helix-turn-helix domain-containing protein  46.43 
 
 		 93 aa  48.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2426  hypothetical protein  37.93 
 
 		 75 aa  47.8  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0857  transcriptional regulator, putative  41.07 
 
 		 74 aa  46.6  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000197317 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2290  hypothetical protein  37.93 
 
 		 74 aa  46.2  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0140  helix-turn-helix domain protein  44.74 
 
 		 87 aa  45.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.7168 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2168  transcriptional regulator, XRE family  42.31 
 
 		 68 aa  45.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.117298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5326  transcriptional regulator, XRE family  34.92 
 
 		 68 aa  45.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.134062 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2161  helix-turn-helix domain-containing protein  44.23 
 
 		 126 aa  44.7  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0212  transcriptional regulator, XRE family  42.37 
 
 		 68 aa  44.3  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0249  XRE family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 68 aa  44.7  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4154  hypothetical protein  37.31 
 
 		 82 aa  44.3  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1485  XRE family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 75 aa  43.9  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2661  putative transcription regulator protein  45.28 
 
 		 111 aa  43.9  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.574569 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0283  XRE family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 99 aa  43.9  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2575  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 230 aa  43.5  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0889  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0496  DNA-binding protein, putative  37.93 
 
 		 72 aa  42.7  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3371  helix-turn-helix domain-containing protein  46.15 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5678  XRE family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 90 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.669501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1196  transcriptional regulator, XRE family  37.93 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.151247 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0291  helix-turn-helix domain protein  36.23 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0510  XRE family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 89 aa  41.6  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03585  transcriptional regulator  40 
 
 		 206 aa  41.6  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0785  hypothetical protein  32.18 
 
 		 166 aa  42  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00156386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2461  XRE family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 79 aa  41.2  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000100603  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2524  transcriptional regulator, XRE family  32.84 
 
 		 76 aa  40.8  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000972778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1498  hypothetical protein  35.82 
 
 		 85 aa  40.8  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152901  normal  0.507716 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5665  transcriptional regulator, XRE family  37.04 
 
 		 156 aa  40.4  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1067  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 86 aa  40.4  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.753603 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0444  XRE family transcriptional regulator  36 
 
 		 529 aa  40  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.33149 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0830  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 88 aa  40.4  0.009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.0000289664  hitchhiker  0.0000066158 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0377  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 164 aa  40.4  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.817561  normal  0.780883 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6539  XRE family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 94 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.625099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1251  XRE family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 94 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6254  helix-turn-helix domain-containing protein  36.54 
 
 		 94 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.853292 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6581  XRE family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 94 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>