More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1616 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1616  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  100 
 
 
475 aa  906    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.512799  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10020  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  59.8 
 
 
422 aa  381  1e-104  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0127568  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1734  uroporphyrin-III C-methyltransferase  62.95 
 
 
406 aa  372  1e-102  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0333412  normal  0.124511 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7364  siroheme synthase  54.08 
 
 
410 aa  370  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0139888  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3111  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  58.7 
 
 
418 aa  369  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2812  uroporphyrin-III C-methyltransferase  58.18 
 
 
420 aa  364  2e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00743993 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2221  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  54.43 
 
 
426 aa  347  3e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2561  uroporphyrin-III C-methyltransferase  56.74 
 
 
410 aa  339  7e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.945162  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2321  uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.77 
 
 
405 aa  327  3e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1326  uroporphyrin-III C-methyltransferase  57.47 
 
 
421 aa  325  8.000000000000001e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0751578  normal  0.224084 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1323  uroporphyrin-III C-methyltransferase  54.55 
 
 
448 aa  324  2e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.153793  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3431  uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.65 
 
 
426 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.447049  normal  0.196927 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2057  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  47.57 
 
 
398 aa  302  1e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.177628  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2074  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  47.57 
 
 
398 aa  302  1e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376766  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2120  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  47.57 
 
 
398 aa  302  1e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0228819 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1703  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50 
 
 
411 aa  289  8e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12862  multi-functional enzyme siroheme synthase cysG: uroporphyrin-III C-methyltransferase + precorrin-2 oxidase + ferrochelatase  47.03 
 
 
405 aa  288  1e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000225219  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2305  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.13 
 
 
402 aa  286  5e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193462  normal  0.130764 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3920  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.21 
 
 
419 aa  281  2e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.797973  normal  0.18472 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2248  uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.62 
 
 
416 aa  280  3e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000210375  normal  0.280858 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4663  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.24 
 
 
394 aa  280  6e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.607311  hitchhiker  0.00373911 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0658  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.41 
 
 
447 aa  275  1.0000000000000001e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.244252 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4047  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.6 
 
 
403 aa  273  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2143  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.98 
 
 
413 aa  273  5.000000000000001e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.32611  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0536  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.88 
 
 
419 aa  268  1e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.865143  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2797  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.04 
 
 
403 aa  269  1e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334066  decreased coverage  0.000494849 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5854  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.77 
 
 
405 aa  263  4.999999999999999e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.148412  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2600  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  47.67 
 
 
407 aa  262  1e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.177036  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3545  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.11 
 
 
417 aa  256  6e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22640  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  48.62 
 
 
414 aa  245  9.999999999999999e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1774  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.55 
 
 
426 aa  242  1e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.254822  normal  0.025791 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2558  uroporphyrin-III C-methyltransferase  54.24 
 
 
250 aa  238  3e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1124  uroporphyrin-III C-methyltransferase  56.83 
 
 
491 aa  237  3e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.219261  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1125  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase, uroporphyrinogen-III synthase  48.95 
 
 
516 aa  234  4.0000000000000004e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.325525 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1105  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  51.06 
 
 
250 aa  232  1e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000034343  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1977  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  55.27 
 
 
513 aa  226  1e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0017868  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1791  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  51.48 
 
 
255 aa  224  3e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.693099  normal  0.522962 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0162  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.01 
 
 
385 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0796  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  53.09 
 
 
276 aa  220  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5796  uroporphyrin-III C-methyltransferase  55.6 
 
 
271 aa  220  5e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.991425  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00850  uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.68 
 
 
340 aa  219  6e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.653671  normal  0.580236 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0701  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.32 
 
 
504 aa  218  1e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28170  Uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.12 
 
 
464 aa  218  2e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0711  uroporphyrin-III C-methyltransferase  62.56 
 
 
261 aa  218  2e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.572038  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1248  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  51.67 
 
 
520 aa  217  2.9999999999999998e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.472521 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3353  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.9 
 
 
504 aa  216  5e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422788  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3863  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.73 
 
 
258 aa  216  5e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.707668  hitchhiker  0.0000644403 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1481  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.3 
 
 
258 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.822435  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30340  siroheme synthase  36.73 
 
 
465 aa  216  9e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2597  siroheme synthase  36.95 
 
 
465 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1587  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.3 
 
 
258 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00363233  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1233  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.94 
 
 
254 aa  215  9.999999999999999e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.323489  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1549  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.3 
 
 
258 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3676  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.89 
 
 
272 aa  215  1.9999999999999998e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1349  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.73 
 
 
258 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.758533  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1335  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.3 
 
 
258 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1308  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.3 
 
 
258 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1445  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.3 
 
 
258 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.51628  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1278  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.31 
 
 
504 aa  214  3.9999999999999995e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000100069  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1517  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.3 
 
 
258 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.58633e-17 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32840  siroheme synthase, N-terminal domain protein  54.78 
 
 
490 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.703694  normal  0.335856 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0232  siroheme synthase  33.11 
 
 
473 aa  213  5.999999999999999e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3959  siroheme synthase  33.11 
 
 
473 aa  213  5.999999999999999e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3344  siroheme synthase  34.82 
 
 
464 aa  213  7e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00903193  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1309  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.88 
 
 
258 aa  211  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0984  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.79 
 
 
245 aa  210  4e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.084748  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1679  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  47.5 
 
 
481 aa  209  6e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1668  uroporphyrin-III C-methyltransferase  54.08 
 
 
271 aa  209  8e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.228653  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2313  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.51 
 
 
502 aa  209  9e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0215  siroheme synthase  33.56 
 
 
462 aa  209  1e-52  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1787  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.99 
 
 
497 aa  209  1e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000345374  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3174  uroporphyrin-III C-methyltransferase, C-terminal:siroheme synthase, N-terminal  34.74 
 
 
464 aa  208  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.108275  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0652  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  45.04 
 
 
493 aa  208  2e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0896  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.42 
 
 
506 aa  208  2e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1175  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.68 
 
 
252 aa  207  2e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4706  normal  0.0224859 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1257  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  53.25 
 
 
344 aa  208  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0671  uroporphyrin-III C-methyltransferase  36.59 
 
 
482 aa  207  2e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal  0.0127709 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2162  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.28 
 
 
512 aa  207  3e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000123773  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0687  hypothetical protein  47.06 
 
 
505 aa  207  3e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.943133  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1148  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.04 
 
 
258 aa  207  3e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.660594  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1724  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.09 
 
 
250 aa  207  4e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1304  uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.48 
 
 
341 aa  207  4e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000013342 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2235  uroporphyrin-III C-methyltransferase  37.22 
 
 
470 aa  206  5e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0319  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.8 
 
 
497 aa  206  5e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.83 
 
 
511 aa  206  7e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1252  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.32 
 
 
505 aa  206  8e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2131  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.12 
 
 
507 aa  206  8e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0860734  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.42 
 
 
510 aa  205  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2200  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.93 
 
 
261 aa  205  1e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0396322  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3062  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.94 
 
 
512 aa  205  2e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00105684  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06660  putative uroporphyrin-III c-methyltransferase  49.58 
 
 
279 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.253082  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1025  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.03 
 
 
293 aa  205  2e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1941  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.67 
 
 
478 aa  204  3e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2837  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  45.15 
 
 
503 aa  204  4e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.452302  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1371  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.64 
 
 
502 aa  204  4e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0528  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  56.3 
 
 
508 aa  203  5e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.216012 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6102  uroporphyrin-III C-methyltransferase  54.72 
 
 
570 aa  203  5e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.229547  normal  0.024124 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0970  siroheme synthase  35.44 
 
 
472 aa  203  6e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3305  siroheme synthase  35.44 
 
 
472 aa  202  7e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2603  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.23 
 
 
256 aa  203  7e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>