More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0268 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0268  NADH dehydrogenase subunit B  100 
 
 
184 aa  380  1e-105  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.220523  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0400  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  79.35 
 
 
184 aa  303  9.000000000000001e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0521  NADH dehydrogenase subunit B  76.63 
 
 
184 aa  300  5.000000000000001e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4482  NADH dehydrogenase subunit B  76.63 
 
 
184 aa  298  3e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00198426 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1884  NADH dehydrogenase subunit B  76.09 
 
 
184 aa  296  9e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4557  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  85.45 
 
 
226 aa  295  2e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.770439  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7690  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  78.8 
 
 
184 aa  295  3e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6093  NADH dehydrogenase subunit B  90 
 
 
264 aa  293  8e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.024124 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2694  NADH dehydrogenase subunit B  77.71 
 
 
185 aa  293  1e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13167  NADH dehydrogenase subunit B  78.8 
 
 
184 aa  291  2e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1579  NADH dehydrogenase subunit B  75 
 
 
184 aa  291  4e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1549  NADH dehydrogenase subunit B  75 
 
 
184 aa  291  4e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0528108  normal  0.21195 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2715  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  74.46 
 
 
183 aa  290  7e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0539  NADH dehydrogenase subunit B  88.67 
 
 
271 aa  290  1e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.573079  normal  0.187495 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5054  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  79.76 
 
 
181 aa  289  1e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1275  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  80.95 
 
 
216 aa  289  2e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99313  normal  0.170871 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4417  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  73.22 
 
 
183 aa  288  2e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3169  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  73.91 
 
 
184 aa  287  6e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.242992  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07390  NADH dehydrogenase subunit B  76.63 
 
 
183 aa  286  8e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6681  NADH dehydrogenase subunit B  83.97 
 
 
182 aa  284  5.999999999999999e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3228  NADH dehydrogenase subunit B  74.32 
 
 
184 aa  284  5.999999999999999e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.64554  normal  0.0125062 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0585  NADH dehydrogenase (quinone)  74.29 
 
 
183 aa  284  5.999999999999999e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0282  NADH-quinone oxidoreductase subunit B  74.86 
 
 
183 aa  283  7e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0470  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  75.54 
 
 
183 aa  283  7e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.677887  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03170  NADH dehydrogenase subunit B  75.14 
 
 
182 aa  280  6.000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.739873 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0975  NADH dehydrogenase subunit B  84.62 
 
 
199 aa  280  1e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4064  NADH dehydrogenase subunit B  78.44 
 
 
226 aa  271  3e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.108394 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4462  NADH dehydrogenase subunit B  82.05 
 
 
226 aa  269  2e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0540  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  67.76 
 
 
183 aa  263  1e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.687461  normal  0.404608 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0364  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  76.82 
 
 
180 aa  252  3e-66  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1282  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  70.47 
 
 
179 aa  236  1e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1876  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  69.13 
 
 
179 aa  235  2e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.522368  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3080  NADH dehydrogenase subunit B  64.57 
 
 
179 aa  236  2e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0688011  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0910  NADH dehydrogenase subunit B  70.42 
 
 
178 aa  235  3e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.617047 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2252  NADH dehydrogenase subunit B  68.97 
 
 
213 aa  234  4e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1048  NADH dehydrogenase subunit B  67.95 
 
 
174 aa  227  8e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.675921  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3677  NADH dehydrogenase subunit B  64.74 
 
 
167 aa  222  3e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974896 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1323  NADH dehydrogenase subunit B  63.46 
 
 
167 aa  220  8e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_795  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  65.13 
 
 
200 aa  219  9.999999999999999e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0924  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  64.05 
 
 
200 aa  217  6e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3358  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  62.99 
 
 
202 aa  218  6e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0808  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  66 
 
 
200 aa  217  7.999999999999999e-56  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0339  NADH dehydrogenase I, B subunit  55.29 
 
 
170 aa  216  1e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000262724  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3137  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  56.63 
 
 
169 aa  215  2.9999999999999998e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000706512  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3925  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  54.71 
 
 
170 aa  214  8e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000298768  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4009  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  54.12 
 
 
170 aa  213  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.02735e-29 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3622  NADH dehydrogenase subunit B  60.13 
 
 
167 aa  213  9.999999999999999e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.623908  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3354  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 20 kDa subunit  54.12 
 
 
170 aa  212  2.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000291107  hitchhiker  0.00879289 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0139  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  64.08 
 
 
169 aa  211  5.999999999999999e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4243  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  53.53 
 
 
170 aa  209  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157448  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2990  NADH dehydrogenase subunit B  55.75 
 
 
268 aa  209  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.484766  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1630  NADH dehydrogenase subunit B  55.17 
 
 
264 aa  208  3e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.298148  normal  0.626931 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2089  NADH dehydrogenase subunit B  55.17 
 
 
268 aa  206  1e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.580688  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2157  NADH dehydrogenase subunit B  52.98 
 
 
193 aa  206  1e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00451511 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2812  NADH dehydrogenase subunit B  58.55 
 
 
159 aa  204  7e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.252149 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3412  NADH dehydrogenase subunit B  61.84 
 
 
170 aa  202  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0978  NADH dehydrogenase subunit B  58.71 
 
 
166 aa  202  2e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3750  NADH dehydrogenase subunit B  63.83 
 
 
173 aa  202  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.75959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0709  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.42 
 
 
158 aa  202  3e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.914683  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1828  NADH dehydrogenase subunit B  59.86 
 
 
169 aa  201  4e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.124676  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0822  NADH dehydrogenase subunit B  57.42 
 
 
160 aa  201  5e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1050  NADH dehydrogenase subunit B  57.42 
 
 
160 aa  201  5e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2835  NADH dehydrogenase subunit B  59.21 
 
 
158 aa  200  9e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2704  NADH dehydrogenase subunit B  59.21 
 
 
158 aa  200  9e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0987  NADH dehydrogenase subunit B  58.06 
 
 
158 aa  200  9e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.739675  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3857  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  56.67 
 
 
230 aa  200  9.999999999999999e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1963  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.42 
 
 
159 aa  199  9.999999999999999e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000504024  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0873  NADH dehydrogenase subunit B  57.24 
 
 
159 aa  200  9.999999999999999e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.650133  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3818  NADH dehydrogenase subunit B  60.84 
 
 
172 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0958  NADH dehydrogenase subunit B  57.24 
 
 
159 aa  200  9.999999999999999e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000268179 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1969  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  56.13 
 
 
158 aa  199  9.999999999999999e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0170292 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0158  NADH-quinone oxidoreductase chain b  54.19 
 
 
168 aa  200  9.999999999999999e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2256  NADH dehydrogenase subunit B  58.06 
 
 
158 aa  199  1.9999999999999998e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000211515 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1264  NADH dehydrogenase subunit B  56.58 
 
 
159 aa  199  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.233516 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2629  NADH dehydrogenase subunit B  58.06 
 
 
158 aa  199  1.9999999999999998e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1664  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  62 
 
 
183 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0485  NADH dehydrogenase subunit B  55.56 
 
 
171 aa  199  1.9999999999999998e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.130232 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3509  NADH dehydrogenase subunit B  56.77 
 
 
159 aa  199  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2411  NADH dehydrogenase subunit B  56.77 
 
 
158 aa  198  3e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5149  NADH dehydrogenase subunit B  60.14 
 
 
179 aa  199  3e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4981  NADH dehydrogenase subunit B  60.14 
 
 
179 aa  199  3e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4999  NADH dehydrogenase subunit B  60.14 
 
 
179 aa  199  3e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2042  NADH dehydrogenase subunit B  56.77 
 
 
158 aa  198  3e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5179  NADH dehydrogenase subunit B  55.92 
 
 
159 aa  198  3.9999999999999996e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5424  NADH dehydrogenase subunit B  60.14 
 
 
172 aa  198  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0962  NADH dehydrogenase subunit B  56.77 
 
 
160 aa  198  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0673529  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5530  NADH dehydrogenase subunit B  60.14 
 
 
172 aa  198  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000187843 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5541  NADH dehydrogenase subunit B  60.14 
 
 
172 aa  198  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.511689  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5390  NADH dehydrogenase subunit B  60.14 
 
 
172 aa  198  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90605e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5420  NADH dehydrogenase subunit B  60.14 
 
 
172 aa  198  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5475  NADH dehydrogenase subunit B  60.14 
 
 
172 aa  198  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5097  NADH dehydrogenase subunit B  60.14 
 
 
172 aa  198  3.9999999999999996e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2388  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  54.94 
 
 
225 aa  197  5e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1890  NADH dehydrogenase subunit B  56.77 
 
 
160 aa  197  7.999999999999999e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0103149  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2213  NADH dehydrogenase subunit B  56.77 
 
 
160 aa  197  7.999999999999999e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.444713 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1657  NADH dehydrogenase subunit B  60 
 
 
170 aa  197  7.999999999999999e-50  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.659675  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0182  NADH dehydrogenase subunit B  53.66 
 
 
169 aa  197  9e-50  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1528  NADH dehydrogenase subunit B  60 
 
 
170 aa  197  9e-50  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.152485  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2061  NADH dehydrogenase subunit B  56.77 
 
 
160 aa  197  9e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.061977  normal  0.162166 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1344  NADH dehydrogenase subunit B  56.13 
 
 
159 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000452822  hitchhiker  0.00283492 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>