117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0658 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0658  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase and hypothetical protein  100 
 
 
160 aa  326  9e-89  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0341  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  36.88 
 
 
167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.188252  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0496  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  37.5 
 
 
167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1423  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  36.88 
 
 
167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.294048  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0564  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  36.25 
 
 
167 aa  110  9e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2840  6-pyruvoyl tetrahydrobiopterin synthase  38.03 
 
 
165 aa  102  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0565469  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0632  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  36.42 
 
 
167 aa  101  4e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2408  hypothetical protein  36.55 
 
 
161 aa  92.4  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.89222  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_50741  predicted protein  28.57 
 
 
173 aa  70.5  0.000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5497  hypothetical protein  32.89 
 
 
168 aa  63.2  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.335792  normal  0.287603 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1469  hypothetical protein  29.33 
 
 
272 aa  63.5  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2923  hypothetical protein  30.57 
 
 
164 aa  62  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2777  hypothetical protein  30.57 
 
 
164 aa  62  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0590  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase and hypothetical protein  34.34 
 
 
124 aa  53.1  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0809  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  43.08 
 
 
119 aa  52.8  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02610  6-pyruvoyl tetrahydrobiopterin synthase (PTPS)  44.62 
 
 
121 aa  52  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0923  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  44.62 
 
 
121 aa  52  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0823  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  43.08 
 
 
122 aa  52.4  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3372  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase and hypothetical protein  44.62 
 
 
120 aa  52.4  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2905  queuosine biosynthesis protein QueD  44.62 
 
 
121 aa  52  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3067  queuosine biosynthesis protein QueD  44.62 
 
 
121 aa  52  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1766  hypothetical protein  26.42 
 
 
291 aa  52.4  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.409768  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0947  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  44.62 
 
 
121 aa  52  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.325094 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2894  queuosine biosynthesis protein QueD  44.62 
 
 
120 aa  52  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3108  queuosine biosynthesis protein QueD  44.62 
 
 
121 aa  52  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3530  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase and hypothetical protein  44.62 
 
 
120 aa  52  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.411393  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4020  queuosine biosynthesis protein QueD  44.62 
 
 
120 aa  52  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0857  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase and hypothetical protein  41.54 
 
 
121 aa  52  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02573  hypothetical protein  44.62 
 
 
121 aa  52  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2379  hypothetical protein  25.42 
 
 
295 aa  52  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00093197  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1574  hypothetical protein  27.36 
 
 
290 aa  50.8  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0134  6-pyruvoyltetrahydropterin synthase  34.72 
 
 
117 aa  50.8  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1473  hypothetical protein  25.47 
 
 
294 aa  50.4  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00308505  normal  0.913295 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3312  putative 6-pyruvoyl tetrahydrobiopterin synthase  41.54 
 
 
121 aa  50.4  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.844682  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1811  hypothetical protein  25.47 
 
 
293 aa  50.4  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0258345  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0976  putative 6-pyruvoyl tetrahydrobiopterin synthase  41.54 
 
 
119 aa  50.4  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3443  queuosine biosynthesis protein QueD  41.54 
 
 
119 aa  50.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2784  hypothetical protein  27.36 
 
 
293 aa  50.1  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.215341  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3228  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  44.44 
 
 
120 aa  49.7  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000154571  normal  0.118863 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3160  6-pyruvoyl tetrahydrobiopterin synthase  41.54 
 
 
120 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.291473  normal  0.466351 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3144  queuosine biosynthesis protein QueD  41.54 
 
 
120 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.921331  normal  0.300292 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3103  queuosine biosynthesis protein QueD  41.54 
 
 
120 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00330949  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3079  queuosine biosynthesis protein QueD  41.54 
 
 
120 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00219555  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3262  6-pyruvoyl tetrahydrobiopterin synthase  41.54 
 
 
120 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.872797  normal  0.157447 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0220  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase and hypothetical protein  36.36 
 
 
138 aa  48.5  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0917  putative 6-pyruvoyl tetrahydrobiopterin synthase  36 
 
 
122 aa  48.5  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000947574  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0320  preQ(0) biosynthesis protein QueD  29.23 
 
 
141 aa  47.8  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2532  isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  22.64 
 
 
290 aa  47.8  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2525  isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  22.64 
 
 
290 aa  47.8  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.4236  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2647  isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  22.64 
 
 
290 aa  47.8  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.799377  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1819  isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  22.64 
 
 
290 aa  47.8  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0201346  normal  0.303946 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1559  hypothetical protein  24.53 
 
 
294 aa  47.8  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.314607  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1089  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  30.2 
 
 
142 aa  47.8  0.00007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.225786  normal  0.813307 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003152  queuosine biosynthesis QueD PTPS-I  41.27 
 
 
120 aa  47.4  0.00009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00206478  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01900  hypothetical protein  41.27 
 
 
120 aa  47.4  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3503  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase and hypothetical protein  37.5 
 
 
121 aa  47  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.426216 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2215  hypothetical protein  22.64 
 
 
291 aa  47  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.344292  normal  0.54623 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2291  hypothetical protein  22.64 
 
 
291 aa  47  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0547683  normal  0.904196 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2424  isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  22.64 
 
 
291 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2286  hypothetical protein  21.7 
 
 
293 aa  47  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00446076  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1493  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  39.06 
 
 
129 aa  47  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.222013  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1330  6-pyruvoyl tetrahydrobiopterin synthase  41.27 
 
 
120 aa  46.6  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3631  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase and hypothetical protein  27.03 
 
 
125 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.867896  normal  0.305181 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2314  6-pyruvoyl tetrahydrobiopterin synthase  38.89 
 
 
122 aa  46.2  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0219  6-pyruvoyl-tetrahydropterin synthase  33.85 
 
 
129 aa  46.2  0.0002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.296704  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29600  putative 6-pyruvoyl-tetrahydropterin synthase  38.46 
 
 
118 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0437  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  40.62 
 
 
120 aa  46.2  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.000000165421  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2533  queuosine biosynthesis protein QueD  38.46 
 
 
118 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1754  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  33.87 
 
 
128 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1485  queuosine biosynthesis protein QueD  31.46 
 
 
135 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.959398  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6746  queuosine biosynthesis protein QueD  32.1 
 
 
118 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.427555  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2179  hypothetical protein  23.58 
 
 
291 aa  45.1  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1990  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  41.27 
 
 
118 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0619121  normal  0.16495 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28600  6-pyruvoyltetrahydropterin synthase  41.27 
 
 
118 aa  45.1  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3430  6-pyruvoyl tetrahydrobiopterin synthase, putative  36.92 
 
 
118 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00103726  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1783  queuosine biosynthesis protein QueD  40.74 
 
 
118 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.450226  normal  0.0178443 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6595  queuosine biosynthesis protein QueD  30.86 
 
 
118 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.246451  normal  0.0968031 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1942  queuosine biosynthesis protein QueD  36.92 
 
 
118 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00573384 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3381  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  32.31 
 
 
124 aa  44.3  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.175681 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0097  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase and hypothetical protein  37.31 
 
 
130 aa  44.3  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0372  6-pyruvoyl tetrahydrobiopterin synthase, putative  45.31 
 
 
139 aa  43.5  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2933  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  39.68 
 
 
120 aa  43.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.176164  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3776  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  40.74 
 
 
118 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.456929  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4642  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  36.07 
 
 
125 aa  43.9  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0598  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  34.33 
 
 
120 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1854  queuosine biosynthesis protein QueD  33.33 
 
 
120 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00372153  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2341  6-pyruvoyl tetrahydrobiopterin synthase, putative  35.38 
 
 
118 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165134  hitchhiker  0.00000339065 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3215  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  36.92 
 
 
118 aa  43.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.331945 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2626  6-pyruvoyltetrahydropterin synthase  36.51 
 
 
112 aa  43.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000218474  normal  0.385805 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1269  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  33.33 
 
 
116 aa  42.7  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.438364  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06460  6-pyruvoyl-tetrahydropterin synthase  28.17 
 
 
146 aa  43.1  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.225694  normal  0.354189 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1417  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  33.33 
 
 
154 aa  42.7  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3428  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  35.38 
 
 
118 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3191  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  33.33 
 
 
129 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.220976  normal  0.124084 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1391  6-pyruvoyl-tetrahydropterin synthase-like protein  26.12 
 
 
174 aa  43.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0476  queuosine biosynthesis protein QueD  37.04 
 
 
120 aa  42.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2184  6-pyruvoyl tetrahydrobiopterin synthase  27.59 
 
 
149 aa  42  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.452775  unclonable  0.000000238403 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4382  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase and hypothetical protein  40.91 
 
 
123 aa  42.4  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0129  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase and hypothetical protein  25 
 
 
130 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.249671 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1389  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  31.82 
 
 
125 aa  41.6  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>