27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2179 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2179  hypothetical protein  100 
 
 		 291 aa  608  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2291  hypothetical protein  92.1 
 
 		 291 aa  567  1e-161  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0547683  normal  0.904196 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2215  hypothetical protein  92.1 
 
 		 291 aa  566  1e-160  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.344292  normal  0.54623 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2424  isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  91.75 
 
 		 291 aa  566  1e-160  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2286  hypothetical protein  88.97 
 
 		 293 aa  549  1e-155  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00446076  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2532  isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  86.55 
 
 		 290 aa  536  1e-151  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1819  isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  86.55 
 
 		 290 aa  536  1e-151  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0201346  normal  0.303946 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2647  isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  86.55 
 
 		 290 aa  536  1e-151  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.799377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2525  isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  86.55 
 
 		 290 aa  536  1e-151  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.4236  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1473  hypothetical protein  78.28 
 
 		 294 aa  494  1e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00308505  normal  0.913295 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1574  hypothetical protein  78.28 
 
 		 290 aa  495  1e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2379  hypothetical protein  78.62 
 
 		 295 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00093197  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1811  hypothetical protein  77.66 
 
 		 293 aa  489  1e-137  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0258345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2784  hypothetical protein  75.6 
 
 		 293 aa  482  1e-135  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.215341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1766  hypothetical protein  78.97 
 
 		 291 aa  474  1e-133  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.409768  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1559  hypothetical protein  76.76 
 
 		 294 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.314607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3377  hypothetical protein  55.36 
 
 		 291 aa  330  2e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01912  hypothetical protein  48.93 
 
 		 281 aa  274  1.0000000000000001e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.111578  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1196  hypothetical protein  46.37 
 
 		 278 aa  260  2e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2614  hypothetical protein  46.78 
 
 		 296 aa  260  2e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.407191  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2266  hypothetical protein  44.95 
 
 		 289 aa  258  6e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06635  isocitrate dehydrogenase  48.16 
 
 		 271 aa  258  1e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1890  hypothetical protein  45.36 
 
 		 293 aa  255  5e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00413299  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2430  hypothetical protein  38.18 
 
 		 293 aa  209  5e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.100879  normal  0.098268 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2040  hypothetical protein  37.28 
 
 		 289 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1469  hypothetical protein  38.24 
 
 		 272 aa  48.5  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0658  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase and hypothetical protein  23.58 
 
 		 160 aa  45.1  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>