29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1890 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_1890  hypothetical protein  100 
 
 
293 aa  598  1e-170  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00413299  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1196  hypothetical protein  46.79 
 
 
278 aa  264  2e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2291  hypothetical protein  45.99 
 
 
291 aa  262  6e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0547683  normal  0.904196 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2424  isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  45.52 
 
 
291 aa  261  8e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2215  hypothetical protein  45.52 
 
 
291 aa  259  3e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.344292  normal  0.54623 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1819  isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  44.83 
 
 
290 aa  257  2e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0201346  normal  0.303946 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2647  isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  44.83 
 
 
290 aa  257  2e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.799377  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1766  hypothetical protein  47.75 
 
 
291 aa  257  2e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.409768  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1811  hypothetical protein  45.86 
 
 
293 aa  257  2e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0258345  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2525  isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  44.83 
 
 
290 aa  257  2e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.4236  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2532  isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  44.83 
 
 
290 aa  257  2e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1473  hypothetical protein  47.93 
 
 
294 aa  256  4e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00308505  normal  0.913295 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2179  hypothetical protein  45.36 
 
 
291 aa  255  5e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2286  hypothetical protein  44.67 
 
 
293 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00446076  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2784  hypothetical protein  46.55 
 
 
293 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.215341  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1559  hypothetical protein  47.37 
 
 
294 aa  252  6e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.314607  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3377  hypothetical protein  46.69 
 
 
291 aa  251  1e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2379  hypothetical protein  45.3 
 
 
295 aa  249  5e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00093197  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1574  hypothetical protein  43.75 
 
 
290 aa  248  9e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2430  hypothetical protein  44.21 
 
 
293 aa  244  9.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.100879  normal  0.098268 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2266  hypothetical protein  44.6 
 
 
289 aa  233  4.0000000000000004e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01912  hypothetical protein  44.77 
 
 
281 aa  232  7.000000000000001e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.111578  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06635  isocitrate dehydrogenase  42.49 
 
 
271 aa  218  7e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2614  hypothetical protein  41.1 
 
 
296 aa  206  3e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.407191  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2040  hypothetical protein  40.65 
 
 
289 aa  188  7e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0564  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  24.81 
 
 
167 aa  46.6  0.0005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1469  hypothetical protein  23.97 
 
 
272 aa  45.8  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4125  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase and hypothetical protein  42.59 
 
 
136 aa  45.4  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0496  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  25.56 
 
 
167 aa  42.4  0.009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>