30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2430 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2430  hypothetical protein  100 
 
 
293 aa  615  1e-175  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.100879  normal  0.098268 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1196  hypothetical protein  47.2 
 
 
278 aa  272  4.0000000000000004e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1890  hypothetical protein  44.21 
 
 
293 aa  244  9.999999999999999e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00413299  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2266  hypothetical protein  41.36 
 
 
289 aa  239  4e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3377  hypothetical protein  41.5 
 
 
291 aa  223  3e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01912  hypothetical protein  40.21 
 
 
281 aa  218  7.999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.111578  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2379  hypothetical protein  38.51 
 
 
295 aa  211  1e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00093197  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2424  isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  38.51 
 
 
291 aa  210  2e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2291  hypothetical protein  38.51 
 
 
291 aa  210  2e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0547683  normal  0.904196 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2215  hypothetical protein  38.51 
 
 
291 aa  210  2e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.344292  normal  0.54623 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2179  hypothetical protein  38.18 
 
 
291 aa  209  5e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1574  hypothetical protein  37.84 
 
 
290 aa  207  1e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2614  hypothetical protein  37.87 
 
 
296 aa  207  1e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.407191  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1559  hypothetical protein  40.41 
 
 
294 aa  207  2e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.314607  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2286  hypothetical protein  38.18 
 
 
293 aa  207  2e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00446076  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1819  isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  38.18 
 
 
290 aa  206  3e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0201346  normal  0.303946 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2647  isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  38.18 
 
 
290 aa  206  3e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.799377  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2525  isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  38.18 
 
 
290 aa  206  3e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.4236  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2532  isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  38.18 
 
 
290 aa  206  3e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1473  hypothetical protein  36.82 
 
 
294 aa  206  5e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00308505  normal  0.913295 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1766  hypothetical protein  38.85 
 
 
291 aa  204  2e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.409768  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1811  hypothetical protein  37.16 
 
 
293 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0258345  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2784  hypothetical protein  37.84 
 
 
293 aa  199  6e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.215341  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2040  hypothetical protein  36.68 
 
 
289 aa  192  5e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06635  isocitrate dehydrogenase  36.96 
 
 
271 aa  187  2e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1423  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  25.32 
 
 
167 aa  49.7  0.00007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.294048  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0496  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  25.32 
 
 
167 aa  49.3  0.00009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0341  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  25.97 
 
 
167 aa  46.6  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.188252  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0564  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  27.56 
 
 
167 aa  46.2  0.0007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1469  hypothetical protein  26.52 
 
 
272 aa  43.9  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>