31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3377 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3377  hypothetical protein  100 
 
 		 291 aa  610  9.999999999999999e-175  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01912  hypothetical protein  61.01 
 
 		 281 aa  363  2e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.111578  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2179  hypothetical protein  55.36 
 
 		 291 aa  330  2e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1819  isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  55.86 
 
 		 290 aa  330  2e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0201346  normal  0.303946 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2647  isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  55.86 
 
 		 290 aa  330  2e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.799377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2525  isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  55.86 
 
 		 290 aa  330  2e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.4236  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2532  isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  55.86 
 
 		 290 aa  330  2e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2291  hypothetical protein  55.17 
 
 		 291 aa  328  5.0000000000000004e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0547683  normal  0.904196 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2424  isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  54.83 
 
 		 291 aa  328  8e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2215  hypothetical protein  55.17 
 
 		 291 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.344292  normal  0.54623 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1574  hypothetical protein  54.98 
 
 		 290 aa  324  1e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2379  hypothetical protein  53.79 
 
 		 295 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00093197  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1811  hypothetical protein  52.76 
 
 		 293 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0258345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1473  hypothetical protein  54.3 
 
 		 294 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00308505  normal  0.913295 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2286  hypothetical protein  52.94 
 
 		 293 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00446076  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2784  hypothetical protein  53.45 
 
 		 293 aa  315  6e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.215341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1766  hypothetical protein  53.79 
 
 		 291 aa  312  4.999999999999999e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.409768  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1559  hypothetical protein  51.92 
 
 		 294 aa  310  2e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.314607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2266  hypothetical protein  48.79 
 
 		 289 aa  284  1.0000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06635  isocitrate dehydrogenase  53.68 
 
 		 271 aa  283  3.0000000000000004e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2614  hypothetical protein  47.83 
 
 		 296 aa  277  1e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.407191  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1196  hypothetical protein  46.37 
 
 		 278 aa  261  1e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1890  hypothetical protein  46.69 
 
 		 293 aa  251  1e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00413299  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2430  hypothetical protein  41.5 
 
 		 293 aa  223  3e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.100879  normal  0.098268 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2040  hypothetical protein  33.9 
 
 		 289 aa  160  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0632  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  28.83 
 
 		 167 aa  45.8  0.0009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0564  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  31.19 
 
 		 167 aa  43.9  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0341  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  30.28 
 
 		 167 aa  43.5  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.188252  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1241  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase and hypothetical protein  34.25 
 
 		 161 aa  42.7  0.008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0496  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  30.28 
 
 		 167 aa  42.4  0.009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1423  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  30.28 
 
 		 167 aa  42.4  0.01  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.294048  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>