36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1196 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1196  hypothetical protein  100 
 
 		 278 aa  580  1e-164  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2430  hypothetical protein  47.2 
 
 		 293 aa  272  3e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.100879  normal  0.098268 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1574  hypothetical protein  47.57 
 
 		 290 aa  271  8.000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1890  hypothetical protein  46.79 
 
 		 293 aa  264  2e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00413299  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2784  hypothetical protein  48.1 
 
 		 293 aa  262  4e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.215341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3377  hypothetical protein  46.37 
 
 		 291 aa  261  1e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2179  hypothetical protein  46.37 
 
 		 291 aa  260  2e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2424  isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  46.02 
 
 		 291 aa  257  2e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2291  hypothetical protein  45.52 
 
 		 291 aa  256  4e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0547683  normal  0.904196 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2215  hypothetical protein  46.02 
 
 		 291 aa  256  4e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.344292  normal  0.54623 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2286  hypothetical protein  45.67 
 
 		 293 aa  255  6e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00446076  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1559  hypothetical protein  46.85 
 
 		 294 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.314607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2379  hypothetical protein  44.83 
 
 		 295 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00093197  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2647  isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  45.52 
 
 		 290 aa  252  6e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.799377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2525  isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  45.52 
 
 		 290 aa  252  6e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.4236  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1819  isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  45.52 
 
 		 290 aa  252  6e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0201346  normal  0.303946 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2532  isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  45.52 
 
 		 290 aa  252  6e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1473  hypothetical protein  44.83 
 
 		 294 aa  250  2e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00308505  normal  0.913295 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1811  hypothetical protein  44.98 
 
 		 293 aa  249  2e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0258345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1766  hypothetical protein  45.67 
 
 		 291 aa  248  7e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.409768  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01912  hypothetical protein  42.24 
 
 		 281 aa  236  2e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.111578  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2266  hypothetical protein  39.37 
 
 		 289 aa  229  4e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2614  hypothetical protein  41.3 
 
 		 296 aa  223  2e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.407191  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06635  isocitrate dehydrogenase  37.92 
 
 		 271 aa  191  1e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2040  hypothetical protein  36.52 
 
 		 289 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0564  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  30.51 
 
 		 167 aa  48.1  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0496  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  27.07 
 
 		 167 aa  46.6  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1423  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  27.07 
 
 		 167 aa  46.2  0.0006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.294048  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0341  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  29.25 
 
 		 167 aa  45.8  0.0007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.188252  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5204  hypothetical protein  32.61 
 
 		 146 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0936  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase and hypothetical protein  27.42 
 
 		 143 aa  44.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.060764  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4125  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase and hypothetical protein  32.31 
 
 		 136 aa  44.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1847  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  25.81 
 
 		 143 aa  43.1  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0421  6-pyruvoyl tetrahydrobiopterin synthase, putative  28.23 
 
 		 142 aa  43.1  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.381661  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1269  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  47.06 
 
 		 116 aa  42.7  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.438364  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0870  6-pyruvoyl tetrahydrobiopterin synthase  33.33 
 
 		 147 aa  42.4  0.009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00108772  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>