26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2614 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2614  hypothetical protein  100 
 
 		 296 aa  608  1e-173  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.407191  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3377  hypothetical protein  47.83 
 
 		 291 aa  277  1e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1819  isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  48.65 
 
 		 290 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0201346  normal  0.303946 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2647  isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  48.65 
 
 		 290 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.799377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2525  isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  48.65 
 
 		 290 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.4236  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2532  isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  48.65 
 
 		 290 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2266  hypothetical protein  50.85 
 
 		 289 aa  268  7e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2215  hypothetical protein  47.64 
 
 		 291 aa  268  8e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.344292  normal  0.54623 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2291  hypothetical protein  47.47 
 
 		 291 aa  268  1e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0547683  normal  0.904196 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2424  isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  47.64 
 
 		 291 aa  267  1e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1473  hypothetical protein  50.34 
 
 		 294 aa  266  4e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00308505  normal  0.913295 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1559  hypothetical protein  46.42 
 
 		 294 aa  262  4.999999999999999e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.314607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2379  hypothetical protein  47.12 
 
 		 295 aa  261  8e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00093197  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2286  hypothetical protein  47.12 
 
 		 293 aa  260  2e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00446076  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2179  hypothetical protein  46.78 
 
 		 291 aa  260  2e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01912  hypothetical protein  47.55 
 
 		 281 aa  259  3e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.111578  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1574  hypothetical protein  47.3 
 
 		 290 aa  259  4e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1811  hypothetical protein  46.78 
 
 		 293 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0258345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06635  isocitrate dehydrogenase  47.79 
 
 		 271 aa  253  3e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2784  hypothetical protein  47.14 
 
 		 293 aa  251  7e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.215341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1766  hypothetical protein  48.14 
 
 		 291 aa  251  1e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.409768  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1196  hypothetical protein  41.3 
 
 		 278 aa  223  2e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2430  hypothetical protein  37.87 
 
 		 293 aa  207  1e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.100879  normal  0.098268 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1890  hypothetical protein  41.1 
 
 		 293 aa  206  3e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00413299  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2040  hypothetical protein  33.67 
 
 		 289 aa  152  7e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0220  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase and hypothetical protein  34.67 
 
 		 138 aa  43.1  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>