30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2424 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_2424  isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  100 
 
 		 291 aa  608  1e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2215  hypothetical protein  98.97 
 
 		 291 aa  604  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.344292  normal  0.54623 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2291  hypothetical protein  99.31 
 
 		 291 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0547683  normal  0.904196 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2286  hypothetical protein  92.07 
 
 		 293 aa  571  1.0000000000000001e-162  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00446076  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2179  hypothetical protein  91.75 
 
 		 291 aa  566  1e-160  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2647  isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  92.07 
 
 		 290 aa  564  1e-160  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.799377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2525  isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  92.07 
 
 		 290 aa  564  1e-160  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.4236  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1819  isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  92.07 
 
 		 290 aa  564  1e-160  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0201346  normal  0.303946 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2532  isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  92.07 
 
 		 290 aa  564  1e-160  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1574  hypothetical protein  79.66 
 
 		 290 aa  502  1e-141  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1811  hypothetical protein  79.38 
 
 		 293 aa  503  1e-141  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0258345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1473  hypothetical protein  78.97 
 
 		 294 aa  499  1e-140  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00308505  normal  0.913295 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2379  hypothetical protein  78.97 
 
 		 295 aa  496  1e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00093197  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2784  hypothetical protein  77.32 
 
 		 293 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.215341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1766  hypothetical protein  80.97 
 
 		 291 aa  484  1e-136  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.409768  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1559  hypothetical protein  78.52 
 
 		 294 aa  479  1e-134  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.314607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3377  hypothetical protein  54.83 
 
 		 291 aa  328  8e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01912  hypothetical protein  48.57 
 
 		 281 aa  278  6e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.111578  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2614  hypothetical protein  47.64 
 
 		 296 aa  267  1e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.407191  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1890  hypothetical protein  45.52 
 
 		 293 aa  261  8e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00413299  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2266  hypothetical protein  44.86 
 
 		 289 aa  261  8.999999999999999e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06635  isocitrate dehydrogenase  49.25 
 
 		 271 aa  261  1e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1196  hypothetical protein  46.02 
 
 		 278 aa  257  2e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2430  hypothetical protein  38.51 
 
 		 293 aa  210  2e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.100879  normal  0.098268 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2040  hypothetical protein  36.59 
 
 		 289 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1469  hypothetical protein  36.62 
 
 		 272 aa  48.9  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0658  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase and hypothetical protein  22.64 
 
 		 160 aa  46.6  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0496  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  25.23 
 
 		 167 aa  44.3  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0341  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  25.23 
 
 		 167 aa  44.3  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.188252  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1423  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  25.23 
 
 		 167 aa  43.9  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.294048  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>