92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1469 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1469  hypothetical protein  100 
 
 
272 aa  555  1e-157  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0658  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase and hypothetical protein  29.33 
 
 
160 aa  63.5  0.000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0617  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase and hypothetical protein  28.57 
 
 
147 aa  55.8  0.0000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2840  6-pyruvoyl tetrahydrobiopterin synthase  27.14 
 
 
165 aa  54.3  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0565469  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0598  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  40.91 
 
 
120 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1269  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  44.07 
 
 
116 aa  52  0.000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.438364  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1417  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  28.46 
 
 
154 aa  51.6  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1493  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  42.47 
 
 
129 aa  52  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.222013  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1829  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase and hypothetical protein  28.46 
 
 
147 aa  49.3  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1123  queuosine biosynthesis protein QueD  39.39 
 
 
122 aa  49.3  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2215  hypothetical protein  36.62 
 
 
291 aa  48.9  0.00009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.344292  normal  0.54623 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2291  hypothetical protein  36.62 
 
 
291 aa  48.9  0.00009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0547683  normal  0.904196 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2424  isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  36.62 
 
 
291 aa  48.9  0.00009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2179  hypothetical protein  38.24 
 
 
291 aa  48.5  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0496  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  27.39 
 
 
167 aa  48.1  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1574  hypothetical protein  35.14 
 
 
290 aa  48.1  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2626  6-pyruvoyltetrahydropterin synthase  36.59 
 
 
112 aa  47.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000218474  normal  0.385805 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1423  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  27.45 
 
 
167 aa  47  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.294048  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2286  hypothetical protein  32.05 
 
 
293 aa  47.4  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00446076  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0590  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase and hypothetical protein  38.71 
 
 
124 aa  46.6  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0632  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  26.35 
 
 
167 aa  47  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0341  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  27.45 
 
 
167 aa  46.6  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.188252  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4382  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase and hypothetical protein  41.18 
 
 
123 aa  45.8  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1949  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase and hypothetical protein  38.1 
 
 
155 aa  45.8  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1887  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  41.54 
 
 
129 aa  45.8  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.245611  normal  0.0943508 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1890  hypothetical protein  23.97 
 
 
293 aa  45.8  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00413299  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1559  hypothetical protein  33.8 
 
 
294 aa  45.4  0.0009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.314607  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1477  6-pyruvoyl tetrahydrobiopterin synthase  26.02 
 
 
146 aa  45.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0930014  normal  0.329341 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1258  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  40.32 
 
 
120 aa  45.4  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2525  isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  35.29 
 
 
290 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.4236  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2532  isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  35.29 
 
 
290 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1819  isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  35.29 
 
 
290 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0201346  normal  0.303946 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0437  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  45 
 
 
120 aa  45.1  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.000000165421  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01912  hypothetical protein  27.34 
 
 
281 aa  45.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.111578  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2647  isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  35.29 
 
 
290 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.799377  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0219  6-pyruvoyl-tetrahydropterin synthase  32 
 
 
129 aa  45.4  0.001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.296704  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1766  hypothetical protein  36.76 
 
 
291 aa  44.3  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.409768  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0134  6-pyruvoyltetrahydropterin synthase  38.18 
 
 
117 aa  44.3  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3430  6-pyruvoyl tetrahydrobiopterin synthase, putative  36.92 
 
 
118 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00103726  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0629  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  31.11 
 
 
138 aa  44.3  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0907  queuosine biosynthesis protein QueD  36.51 
 
 
120 aa  43.9  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0842826  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0564  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  28.48 
 
 
167 aa  44.3  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1450  putative 6-pyruvoyl tetrahydrobiopterin synthase protein  29.27 
 
 
158 aa  44.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0857  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase and hypothetical protein  35.82 
 
 
121 aa  43.9  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0320  preQ(0) biosynthesis protein QueD  41.18 
 
 
141 aa  43.9  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3631  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase and hypothetical protein  39.34 
 
 
125 aa  43.9  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.867896  normal  0.305181 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2430  hypothetical protein  26.52 
 
 
293 aa  43.9  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.100879  normal  0.098268 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1389  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  37.93 
 
 
125 aa  43.9  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2266  hypothetical protein  28.12 
 
 
289 aa  43.1  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2341  6-pyruvoyl tetrahydrobiopterin synthase, putative  36.92 
 
 
118 aa  43.1  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165134  hitchhiker  0.00000339065 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1942  queuosine biosynthesis protein QueD  36.92 
 
 
118 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00573384 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3428  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  36.92 
 
 
118 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0885  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  36.51 
 
 
120 aa  43.1  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0677364  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1780  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  38.03 
 
 
118 aa  43.1  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1270  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase and hypothetical protein  40 
 
 
121 aa  43.1  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000575085  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2379  hypothetical protein  30.38 
 
 
295 aa  43.1  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00093197  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1997  queuosine biosynthesis protein QueD  40 
 
 
129 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.510803  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1912  queuosine biosynthesis protein QueD  40 
 
 
129 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.896923  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1257  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  39.68 
 
 
163 aa  43.1  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.789848  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2933  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  38.81 
 
 
120 aa  43.1  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.176164  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3215  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  36.92 
 
 
118 aa  42.7  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.331945 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1231  6-pyruvoyl tetrahydrobiopterin synthase  39.68 
 
 
163 aa  42.7  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3948  putative 6-pyruvoyl tetrahydrobiopterin synthase  39.68 
 
 
163 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0690909  normal  0.0571223 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2533  queuosine biosynthesis protein QueD  35.38 
 
 
118 aa  42.7  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1498  putative 6-pyruvoyl tetrahydrobiopterin synthase  39.68 
 
 
163 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00194689  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1395  putative 6-pyruvoyl tetrahydrobiopterin synthase  39.68 
 
 
163 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.2019  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1258  6-pyruvoyl tetrahydrobiopterin synthase  39.68 
 
 
163 aa  42.7  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1431  putative 6-pyruvoyl tetrahydrobiopterin synthase  39.68 
 
 
163 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000251282 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1360  6-pyruvoyl tetrahydrobiopterin synthase  39.68 
 
 
163 aa  42.7  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1459  6-pyruvoyl tetrahydrobiopterin synthase, putative  39.68 
 
 
163 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.555159  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29600  putative 6-pyruvoyl-tetrahydropterin synthase  35.38 
 
 
118 aa  42.7  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1233  6-pyruvoyl tetrahydrobiopterin synthase  39.68 
 
 
163 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1783  queuosine biosynthesis protein QueD  36.92 
 
 
118 aa  42.4  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.450226  normal  0.0178443 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1847  putative 6-pyruvoyl tetrahydrobiopterin synthase protein  27.64 
 
 
158 aa  42.4  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.344541  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1395  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase and hypothetical protein  27.64 
 
 
158 aa  42.4  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.206598  normal  0.099255 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1330  queuosine biosynthesis protein QueD  27.64 
 
 
158 aa  42.4  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.971287  normal  0.314571 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0320  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase and hypothetical protein  36.51 
 
 
156 aa  42.4  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4020  queuosine biosynthesis protein QueD  35.38 
 
 
120 aa  42.4  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2894  queuosine biosynthesis protein QueD  35.38 
 
 
120 aa  42.4  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1966  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  40 
 
 
129 aa  42.4  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0607736  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02573  hypothetical protein  35.38 
 
 
121 aa  42  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0923  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  35.38 
 
 
121 aa  42  0.01  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28600  6-pyruvoyltetrahydropterin synthase  35.38 
 
 
118 aa  42  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3776  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  36.92 
 
 
118 aa  42  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.456929  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3108  queuosine biosynthesis protein QueD  35.38 
 
 
121 aa  42  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2784  hypothetical protein  32.39 
 
 
293 aa  42  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.215341  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0947  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  35.38 
 
 
121 aa  42  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.325094 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1944  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  30.43 
 
 
149 aa  42  0.01  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0870  6-pyruvoyl tetrahydrobiopterin synthase  40.32 
 
 
147 aa  42  0.01  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00108772  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3067  queuosine biosynthesis protein QueD  35.38 
 
 
121 aa  42  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2905  queuosine biosynthesis protein QueD  35.38 
 
 
121 aa  42  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02610  6-pyruvoyl tetrahydrobiopterin synthase (PTPS)  35.38 
 
 
121 aa  42  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>