More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2674 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_2674  pseudouridine synthase  100 
 
 		 307 aa  613  1e-175  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0930515 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1777  pseudouridine synthase  71.15 
 
 		 304 aa  437  1e-121  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4251  pseudouridine synthase  71.15 
 
 		 305 aa  434  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00270285  normal  0.0267319 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2605  pseudouridine synthase  68.21 
 
 		 314 aa  421  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.602447 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2906  pseudouridine synthase  60.07 
 
 		 303 aa  347  1e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2937  pseudouridine synthase  60.14 
 
 		 302 aa  332  5e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.519419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1895  pseudouridine synthase  55.71 
 
 		 302 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4309  pseudouridine synthase  56.23 
 
 		 310 aa  308  1.0000000000000001e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4738  pseudouridine synthase  54.76 
 
 		 303 aa  307  2.0000000000000002e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1453  pseudouridine synthase  53.95 
 
 		 293 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38090  putative pseudouridylate synthase  52.26 
 
 		 300 aa  294  1e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0112741 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3244  RNA pseudouridine synthase family protein  53.28 
 
 		 275 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2133  pseudouridine synthase  50.18 
 
 		 313 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112549  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2349  RNA pseudouridine synthase family protein  50.18 
 
 		 296 aa  278  1e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.189292  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1623  pseudouridine synthase  49.83 
 
 		 292 aa  271  1e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.449518  normal  0.260522 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20160  RNA pseudouridine synthase family protein  50 
 
 		 301 aa  267  1e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1212  pseudouridine synthase  49.14 
 
 		 299 aa  262  6e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.415796  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1652  pseudouridine synthase  49.83 
 
 		 294 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192086  normal  0.562298 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1629  pseudouridine synthase  50.17 
 
 		 294 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.876181  normal  0.456368 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3629  pseudouridine synthase  49.48 
 
 		 301 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3964  pseudouridine synthase  48.06 
 
 		 297 aa  248  9e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5332  pseudouridine synthase  47.18 
 
 		 302 aa  247  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.776192  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2953  pseudouridine synthase  45.22 
 
 		 293 aa  245  6.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0257  pseudouridine synthase  43.01 
 
 		 293 aa  245  8e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0319588  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1330  pseudouridine synthase  46.26 
 
 		 293 aa  240  2e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0166738  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1531  pseudouridine synthase  42.86 
 
 		 303 aa  228  1e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.585813  normal  0.216028 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0554  pseudouridine synthase  45.92 
 
 		 299 aa  227  2e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28660  23S RNA-specific pseudouridylate synthase  44.37 
 
 		 303 aa  225  7e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.727795 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4011  pseudouridine synthase  42.27 
 
 		 305 aa  217  2e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4820  pseudouridine synthase  44.41 
 
 		 286 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0140866 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0745  pseudouridine synthase  40.63 
 
 		 326 aa  215  9e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1621  pseudouridine synthase  43.69 
 
 		 285 aa  211  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153149 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0617  pseudouridine synthase  40.66 
 
 		 314 aa  210  3e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1278  pseudouridine synthase  46.76 
 
 		 287 aa  209  4e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175088 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0506  pseudouridine synthase  39.02 
 
 		 309 aa  209  6e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.95991 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0445  pseudouridine synthase  37.98 
 
 		 303 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03250  23S RNA-specific pseudouridylate synthase  39.88 
 
 		 348 aa  206  3e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.243016  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13329  hypothetical protein  46.69 
 
 		 305 aa  206  5e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0572  pseudouridine synthase  37.68 
 
 		 306 aa  205  6e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0482  pseudouridine synthase  35.37 
 
 		 312 aa  205  6e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0459  pseudouridine synthase  38.33 
 
 		 305 aa  205  7e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3881  pseudouridine synthase  38.33 
 
 		 305 aa  205  8e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.792189  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0433  pseudouridine synthase  37.98 
 
 		 305 aa  205  1e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0639  pseudouridine synthase  42.14 
 
 		 362 aa  204  2e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.898355 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0549  pseudouridine synthase  37.27 
 
 		 312 aa  204  2e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0418  pseudouridine synthase  37.41 
 
 		 308 aa  203  4e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1251  pseudouridine synthase  45.73 
 
 		 287 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.375028  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1268  pseudouridine synthase  45.73 
 
 		 287 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0519  pseudouridine synthase  36.59 
 
 		 305 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3712  pseudouridine synthase  37.07 
 
 		 305 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0431  pseudouridine synthase  41.52 
 
 		 317 aa  198  7.999999999999999e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.344664  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3537  pseudouridine synthase  37.07 
 
 		 308 aa  197  3e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.966501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3557  pseudouridine synthase  36.1 
 
 		 326 aa  195  6e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.656396  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3348  pseudouridine synthase  38.29 
 
 		 313 aa  195  7e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0242654 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0672  pseudouridine synthase  40.85 
 
 		 309 aa  194  2e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.526087  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02575  pseudouridylate synthase  55.44 
 
 		 206 aa  193  4e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4073  pseudouridine synthase  36.96 
 
 		 312 aa  188  8e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3559  pseudouridine synthase  40.6 
 
 		 304 aa  185  8e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0932  23S RNA-specific pseudouridylate synthase  42.74 
 
 		 254 aa  182  6e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08910  23S RNA-specific pseudouridylate synthase  41.53 
 
 		 316 aa  149  7e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.267328  normal  0.027473 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08660  23S RNA-specific pseudouridylate synthase  36.92 
 
 		 305 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5191  pseudouridine synthase, RluA family  30.42 
 
 		 308 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000721787 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3978  pseudouridine synthase, RluA family  29.63 
 
 		 306 aa  112  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4020  pseudouridine synthase, RluA family  29.63 
 
 		 306 aa  112  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3242  pseudouridine synthase, RluA family  27.92 
 
 		 303 aa  108  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.341693  normal  0.607359 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27171  pseudouridine synthase  29.92 
 
 		 338 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2882  RluA family pseudouridine synthase  32.12 
 
 		 300 aa  100  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.51797 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4953  pseudouridine synthase, RluA family  29.97 
 
 		 369 aa  99.4  7e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2844  pseudouridine synthase  37.88 
 
 		 249 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.340445  normal  0.556308 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4308  pseudouridine synthase, RluA family  32.31 
 
 		 323 aa  95.5  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2226  pseudouridine synthase, RluD  32.55 
 
 		 301 aa  94.7  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0492  pseudouridine synthase, RluA family  36.15 
 
 		 325 aa  93.2  4e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113875 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1303  pseudouridine synthase, RluA family  35.93 
 
 		 314 aa  93.6  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2949  pseudouridine synthase  37.37 
 
 		 239 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.316024  hitchhiker  0.00664146 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4330  pseudouridine synthase, RluA family  31.92 
 
 		 323 aa  93.2  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2722  pseudouridine synthase  37.37 
 
 		 239 aa  92.8  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0515  pseudouridylate synthase  31.94 
 
 		 225 aa  92.8  7e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0655  pseudouridine synthase  32.31 
 
 		 241 aa  92.4  9e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.10472  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1610  pseudouridine synthase  33.64 
 
 		 211 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00911925  normal  0.237577 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0087  RluA family pseudouridine synthase  36.04 
 
 		 344 aa  90.5  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1969  RluA family pseudouridine synthase  31.14 
 
 		 541 aa  90.1  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.434828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1879  pseudouridine synthase RluA  33.97 
 
 		 211 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2426  pseudouridine synthase  29.55 
 
 		 315 aa  90.1  5e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.181942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0606  pseudouridylate synthase  32.54 
 
 		 225 aa  89.7  5e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.134681 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0261  pseudouridine synthase  26.16 
 
 		 336 aa  89.4  6e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000139633  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22000  pseudouridine synthase RluA  33.65 
 
 		 211 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.921344  hitchhiker  0.0000000000442265 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1865  RluA family pseudouridine synthase  32.18 
 
 		 344 aa  89.4  6e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3568  pseudouridine synthase  32.38 
 
 		 206 aa  89.4  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0161869  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1232  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  32.38 
 
 		 211 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.3197  normal  0.341718 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3439  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  32.38 
 
 		 206 aa  89.4  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000744972  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0767  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  32.38 
 
 		 206 aa  89.4  7e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000401131  normal  0.046253 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09301  putative pseudouridylate synthase  33.81 
 
 		 207 aa  89.4  7e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4321  RluA family pseudouridine synthase  31.5 
 
 		 350 aa  89.4  8e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.412069 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1692  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  33.49 
 
 		 211 aa  89  9e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.251616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1447  pseudouridine synthase, RluD  29.47 
 
 		 578 aa  89  9e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0605  23S rRNA/tRNA pseudouridine synthase A  34.6 
 
 		 217 aa  88.6  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000834833  normal  0.555438 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3875  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  34.6 
 
 		 211 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0462638  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1344  pseudouridine synthase, RluA family  27.59 
 
 		 313 aa  88.6  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4177  pseudouridine synthase, RluD  31.6 
 
 		 318 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.463318  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2969  pseudouridine synthase, RluA family  29.49 
 
 		 623 aa  88.2  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>