67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0597 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_0597  hypothetical protein  100 
 
 		 278 aa  553  1e-157  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0563  YdjC family protein  60.14 
 
 		 288 aa  317  2e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1375  hypothetical protein  38.17 
 
 		 272 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000101211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2756  hypothetical protein  37.5 
 
 		 291 aa  160  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.905596 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1523  YdjC family protein  40.54 
 
 		 266 aa  159  4e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2544  hypothetical protein  31.62 
 
 		 276 aa  152  5e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2400  hypothetical protein  30.22 
 
 		 270 aa  150  2e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1482  hypothetical protein  34.47 
 
 		 273 aa  148  8e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.929836  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0695  hypothetical protein  34.47 
 
 		 273 aa  148  1.0000000000000001e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0263511  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0768  hypothetical protein  34.04 
 
 		 287 aa  143  4e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5902  YdjC family protein  39.86 
 
 		 288 aa  133  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5304  YdjC family protein  40.42 
 
 		 292 aa  132  9e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.693916  normal  0.0144003 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5574  YdjC family protein  36.84 
 
 		 293 aa  130  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0120442  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2351  YdjC family protein  36.57 
 
 		 282 aa  126  5e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.154967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1647  YdjC family protein  35.96 
 
 		 287 aa  123  4e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3638  YdjC family protein  39.08 
 
 		 304 aa  122  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.962606  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1678  hypothetical protein  35.87 
 
 		 280 aa  117  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2568  YdjC-like protein  31.85 
 
 		 291 aa  116  5e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1843  YdjC-like protein  37.18 
 
 		 291 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000761949 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0374  YdjC family protein  35.42 
 
 		 311 aa  113  3e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.106871 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1338  YdjC family protein  34.66 
 
 		 297 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4720  YdjC-like protein  35.48 
 
 		 296 aa  109  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4120  YdjC-like protein  34.29 
 
 		 301 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3190  YdjC-like protein  31.99 
 
 		 280 aa  105  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1930  hypothetical protein  29.39 
 
 		 260 aa  85.9  7e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1054  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  31.8 
 
 		 294 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1148  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  33.87 
 
 		 294 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.501076  normal  0.486153 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0693  YdjC-like protein  33.87 
 
 		 294 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.242371  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1172  YdjC family protein  33.87 
 
 		 294 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.824926  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4284  YdjC-like protein  34 
 
 		 294 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1051  YdjC family protein  32.17 
 
 		 294 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.408827  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0125  hypothetical protein  31.76 
 
 		 249 aa  64.7  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0136  hypothetical protein  31.76 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0678064  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0386  hypothetical protein  31.95 
 
 		 280 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6340  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  33.57 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293411 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0193  hypothetical protein  30.43 
 
 		 412 aa  59.3  0.00000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2132  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  32.93 
 
 		 294 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.175213  normal  0.699288 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2069  phospho-beta-glucosidase, YdjC- like protein, cellobiose degradation  32 
 
 		 265 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.358232  normal  0.273719 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1178  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  32.11 
 
 		 283 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2736  YdjC family protein  32.38 
 
 		 295 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2851  YdjC-like family protein  31.9 
 
 		 295 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0576  YdjC-like family protein  31.9 
 
 		 295 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2858  YdjC-like family protein  31.9 
 
 		 289 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1751  YdjC family protein  31.9 
 
 		 295 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3456  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  35.92 
 
 		 280 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0306936  normal  0.407914 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2795  YdjC family protein  31.9 
 
 		 295 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.279855  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3765  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  35.92 
 
 		 280 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3655  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  34.51 
 
 		 280 aa  52.4  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.507009  normal  0.0806723 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1536  YdjC family protein  32.12 
 
 		 283 aa  51.6  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.700585 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7155  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  32.8 
 
 		 284 aa  52  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180575  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0972  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  31.35 
 
 		 280 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1768  YdjC-like family protein  29.02 
 
 		 295 aa  48.5  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0163  hypothetical protein  31.4 
 
 		 395 aa  48.5  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0658959 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5852  hypothetical protein  26.9 
 
 		 253 aa  48.1  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143064  normal  0.707413 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2194  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  31.45 
 
 		 274 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4972  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  28.42 
 
 		 278 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0838  hypothetical protein  28.68 
 
 		 257 aa  46.6  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.436002  hitchhiker  0.00113451 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1293  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  31.33 
 
 		 279 aa  45.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.214385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1148  hypothetical protein  28.37 
 
 		 253 aa  44.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00261143  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2962  YdjC family protein  29.41 
 
 		 288 aa  44.3  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000156957  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4030  YdjC-like protein  23.59 
 
 		 307 aa  44.3  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.41165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1095  hypothetical protein  28.37 
 
 		 253 aa  44.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000242893  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3115  YdjC family protein  26.32 
 
 		 293 aa  43.9  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00112169  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1151  hypothetical protein  28.97 
 
 		 288 aa  43.5  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3409  YdjC-like protein  30.07 
 
 		 275 aa  43.5  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3572  hypothetical protein  27.66 
 
 		 253 aa  43.5  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000340132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2585  YdjC-like protein  36.51 
 
 		 244 aa  42.7  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>