43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0502 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_3705  hypothetical protein  53.41 
 
 		 948 aa  945    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2186  hypothetical protein  85.56 
 
 		 962 aa  1574    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2394  hypothetical protein  85.45 
 
 		 962 aa  1570    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0683  hypothetical protein  82.32 
 
 		 960 aa  1550    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.439939  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36280  lipoprotein  65.47 
 
 		 973 aa  1230    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1164  hypothetical protein  74.96 
 
 		 659 aa  944    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.146013  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2948  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  65 
 
 		 913 aa  1177    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4515  type IV secretory pathway, VirB4 component  62.97 
 
 		 983 aa  1192    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2859  AAA ATPase  80 
 
 		 960 aa  1531    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1398  hypothetical protein  78.84 
 
 		 955 aa  1529    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3424  hypothetical protein  79.53 
 
 		 956 aa  1502    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.38542 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0337  putative plasmid-related protein  50.05 
 
 		 952 aa  909    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.92337  normal  0.715711 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4086  putative plasmid-related protein  50.48 
 
 		 954 aa  910    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4169  putative plasmid-related protein  51.27 
 
 		 954 aa  909    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.660111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0948  hypothetical protein  84.75 
 
 		 962 aa  1580    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.711504  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4179  hypothetical protein  78.06 
 
 		 969 aa  1484    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0837304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3330  hypothetical protein  64.89 
 
 		 913 aa  1176    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.543175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2353  hypothetical protein  78.23 
 
 		 963 aa  1499    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000463521  unclonable  0.00000047318 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0859  hypothetical protein  68.56 
 
 		 889 aa  1200    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1626  hypothetical protein  78.72 
 
 		 949 aa  1522    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1442  hypothetical protein  67.67 
 
 		 1002 aa  1271    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.188514 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0648  hypothetical protein  46.53 
 
 		 908 aa  843    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.685695  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3023  hypothetical protein  66.04 
 
 		 917 aa  1206    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0662  hypothetical protein  53.08 
 
 		 941 aa  934    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1184  hypothetical protein  79.1 
 
 		 955 aa  1490    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1764  hypothetical protein  49.05 
 
 		 938 aa  917    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59940  hypothetical protein  61.66 
 
 		 980 aa  1183    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.163365  hitchhiker  0.00000000104179 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3926  hypothetical protein  44.35 
 
 		 1042 aa  855    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0502  hypothetical protein  100 
 
 		 978 aa  1988    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.147471  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0435  hypothetical protein  77.49 
 
 		 949 aa  1469    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.544746  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1256  hypothetical protein  78.23 
 
 		 963 aa  1502    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2755  hypothetical protein  37.93 
 
 		 964 aa  610  1e-173  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.446038  normal  0.940253 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2392  hypothetical protein  28.4 
 
 		 924 aa  346  2e-93  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1060  hypothetical protein  27.59 
 
 		 916 aa  320  6e-86  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1022  hypothetical protein  27.59 
 
 		 916 aa  320  6e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0614  hypothetical protein  58.08 
 
 		 240 aa  290  9e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4178  hypothetical protein  24.68 
 
 		 874 aa  80.5  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0161122 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4006  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  22.46 
 
 		 868 aa  63.9  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.840318  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2162  ATPase  22.41 
 
 		 847 aa  61.6  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.532567  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0095  type IV conjugative transfer system protein TraC  22.73 
 
 		 815 aa  61.2  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.124816 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0936  putative pillus assembly protein  23.36 
 
 		 690 aa  57.4  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2948  Type IV secretory pathway VirB4 component, ATPase TRAC  24.79 
 
 		 841 aa  52  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5371  Type-IV secretion system protein TraC  22.28 
 
 		 864 aa  52  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.622531 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>