More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0325 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0325  glutamine amidotransferase class-I  100 
 
 
250 aa  498  1e-140  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.193734 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1607  glutamine amidotransferase class-I  50.61 
 
 
258 aa  229  3e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.471476  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2155  glutamine amidotransferase  48.07 
 
 
243 aa  218  7.999999999999999e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1359  glutamine amidotransferase class-I  52.77 
 
 
247 aa  210  1e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2563  glutamine amidotransferase  51.3 
 
 
237 aa  207  1e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.703088  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1762  glutamine amidotransferase  47.84 
 
 
250 aa  207  2e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0948  glutamine amidotransferase  46.55 
 
 
233 aa  206  3e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1637  glutamine amidotransferase class-I  48.51 
 
 
245 aa  201  8e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.419704  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0839  glutamine amidotransferase  46.55 
 
 
243 aa  199  3e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2875  glutamine amidotransferase class-I  41.99 
 
 
235 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.511003  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2584  glutamine amidotransferase class-I  39.66 
 
 
241 aa  191  8e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03836  glutamine amidotransferase  45.22 
 
 
250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.172302  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1670  glutamine amidotransferase  43.35 
 
 
240 aa  182  5.0000000000000004e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1742  glutamine amidotransferase  42.92 
 
 
240 aa  179  4e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3985  glutamine amidotransferase  44.83 
 
 
248 aa  179  4.999999999999999e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.759173 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0213  glutamine amidotransferase  39.39 
 
 
238 aa  161  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.486178 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4317  glutamine amidotransferase class-I  36.48 
 
 
243 aa  144  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2745  glutamine amidotransferase  34.87 
 
 
240 aa  143  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.562281  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1523  glutamine amidotransferase  36.24 
 
 
240 aa  139  4.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3672  glutamine amidotransferase class-I  40.66 
 
 
236 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2521  glutamine amidotransferase  38.07 
 
 
246 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00189035  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1424  glutamine amidotransferase  40.22 
 
 
241 aa  124  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4466  glutamine amidotransferase class-I  39.18 
 
 
241 aa  104  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3785  glutamine amidotransferase class-I  32.79 
 
 
258 aa  102  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134927  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3619  glutamine amidotransferase class-I  38.89 
 
 
235 aa  102  8e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0721  glutamine amidotransferase class-I  43.54 
 
 
238 aa  99  7e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.706458  normal  0.650481 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5138  GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain- like protein  35.12 
 
 
238 aa  97.1  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.127338  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2617  glutamine amidotransferase class-I  37.5 
 
 
233 aa  96.7  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07470  GMP synthase family protein  40.25 
 
 
261 aa  95.9  6e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.577592 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3152  glutamine amidotransferase class-I  42.57 
 
 
242 aa  95.5  7e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000980969  hitchhiker  0.000546532 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0041  glutamine amidotransferase class-I  34.2 
 
 
246 aa  94.7  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2712  glutamine amidotransferase class-I  40 
 
 
228 aa  95.1  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0635027 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2917  glutamine amidotransferase class-I domain protein  35.11 
 
 
237 aa  94  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2532  glutamine amidotransferase class-I  35.11 
 
 
237 aa  94  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1509  glutamine amidotransferase class-I  36.84 
 
 
241 aa  94  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1753  glutamine amidotransferase class-I  33.86 
 
 
249 aa  93.2  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0299  glutamine amidotransferase class-I  38.36 
 
 
240 aa  93.2  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1504  glutamine amidotransferase class-I  38.41 
 
 
228 aa  92.8  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1260  glutamine amidotransferase class-I  38.25 
 
 
249 aa  91.3  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.201229 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2529  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  31.16 
 
 
232 aa  91.7  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.777754 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1063  glutamine amidotransferase class-I  35.86 
 
 
232 aa  90.5  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2225  putative glutamine amidotransferase class-I  31.47 
 
 
236 aa  89.7  4e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.987752  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1011  glutamine amidotransferase  40.97 
 
 
260 aa  88.6  9e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.352701  normal  0.0294382 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2916  glutamine amidotransferase class-I  36.31 
 
 
244 aa  87  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.186988 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0865  glutamine amidotransferase class-I  33.52 
 
 
246 aa  86.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0038327  hitchhiker  0.0000262286 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0770  glutamine amidotransferase class I  32.61 
 
 
231 aa  86.3  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0718  glutamine amidotransferase class-I  39.36 
 
 
275 aa  86.3  5e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000237191 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1214  glutamine amidotransferase class-I  35.67 
 
 
229 aa  85.5  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2104  glutamine amidotransferase class-I  29.22 
 
 
232 aa  85.5  8e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.503763 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0875  glutamine amidotransferase, class I  34.95 
 
 
238 aa  84.7  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.327652  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0844  glutamine amidotransferase class-I  42.68 
 
 
253 aa  82.8  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.113234  normal  0.319271 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1182  glutamine amidotransferase class-I  30.73 
 
 
243 aa  82.8  0.000000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2203  hypothetical protein  32.52 
 
 
232 aa  82  0.000000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0065  glutamine amidotransferase  31.68 
 
 
255 aa  82  0.000000000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3149  glutamine amidotransferase class-I  35.23 
 
 
278 aa  81.3  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1121  glutamine amidotransferase class-I  32.2 
 
 
239 aa  81.3  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.997537 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1396  glutamine amidotransferase class-I  31.22 
 
 
238 aa  81.3  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.187754 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3263  glutamine amidotransferase  33.16 
 
 
247 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2986  glutamine amidotransferase class-I  39.47 
 
 
239 aa  80.5  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000292655  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2980  glutamine amidotransferase  33.69 
 
 
260 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0885879  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0936  glutamine amidotransferase, class I  39.44 
 
 
231 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228928  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2029  glutamine amidotransferase  39.49 
 
 
288 aa  79  0.00000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0888  glutamine amidotransferase class-I  33.76 
 
 
251 aa  79  0.00000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1805  glutamine amidotransferase class-I  37.19 
 
 
247 aa  79  0.00000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.595238 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2175  hypothetical protein  31.9 
 
 
232 aa  78.6  0.00000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2614  glutamine amidotransferase class-I  33.5 
 
 
238 aa  78.6  0.00000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.223861  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1856  glutamine amidotransferase  35.48 
 
 
243 aa  78.6  0.00000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.991157  decreased coverage  0.0021836 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0817  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing]  31.29 
 
 
228 aa  78.6  0.00000000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0734  glutamine amidotransferase class-I  35.5 
 
 
233 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3397  glutamine amidotransferase class-I  36.84 
 
 
246 aa  78.2  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.725183  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3581  glutamine amidotransferase class-I  42.86 
 
 
255 aa  78.6  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1842  amidotransferase  34.04 
 
 
244 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1451  amidotransferase  34.04 
 
 
244 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.410018  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1179  glutamine amidotransferase, class I  31.29 
 
 
228 aa  77.8  0.0000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1420  amidotransferase  34.04 
 
 
243 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.388788  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3868  amidotransferase  34.04 
 
 
244 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.160036 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1315  glutamine amidotransferase  30.26 
 
 
243 aa  77.4  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000170552 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0721  glutamine amidotransferase class-I  35.38 
 
 
230 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.31334 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2859  hypothetical protein  28.57 
 
 
230 aa  75.5  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4097  glutamine amidotransferase class-I  31.6 
 
 
282 aa  75.9  0.0000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.593636  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1393  glutamine amidotransferase class-I  30.46 
 
 
220 aa  75.5  0.0000000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4674  amidotransferase, putative  36.23 
 
 
234 aa  75.5  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.623837 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4275  glutamine amidotransferase class-I  34.21 
 
 
308 aa  75.5  0.0000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2935  glutamine amidotransferase class-I  44.78 
 
 
249 aa  74.7  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0080  glutamine amidotransferase class-I  35.08 
 
 
234 aa  75.1  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.780681  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0376  glutamine amidotransferase class-I  31.25 
 
 
225 aa  73.9  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0692  glutamine amidotransferase class-I  35.71 
 
 
230 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.767227  normal  0.956702 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0596  glutamine amidotransferase class-I  34.27 
 
 
233 aa  73.9  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2047  glutamine amidotransferase class-I  36.48 
 
 
240 aa  74.3  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0380148  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2020  glutamine amidotransferase class-I  31.25 
 
 
225 aa  74.3  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3197  glutamine amidotransferase  33.55 
 
 
261 aa  73.6  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0557  glutamine amidotransferase class-I  30.92 
 
 
236 aa  73.6  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7211  putative glutamine amidotransferase, class-I  35.98 
 
 
276 aa  73.2  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.724633  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1873  amidotransferase  29.29 
 
 
242 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0865  glutamine amidotransferase class-I  31.8 
 
 
225 aa  72.8  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1369  glutamine amidotransferase  33.15 
 
 
261 aa  72.4  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0879  glutamine amidotransferase class-I  41.67 
 
 
245 aa  72.4  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1342  glutamine amidotransferase class-I  31.94 
 
 
229 aa  72  0.000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1763  glutamine amidotransferase class-I  38.84 
 
 
238 aa  72.4  0.000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1289  glutamine amidotransferase  31.25 
 
 
246 aa  72.4  0.000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0579596  normal  0.253406 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>