More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_0413 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_0413  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 
565 aa  1160    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1915  arginyl-tRNA synthetase  48.94 
 
 
565 aa  584  1.0000000000000001e-165  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00499149  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1633  arginyl-tRNA synthetase  48.94 
 
 
565 aa  582  1.0000000000000001e-165  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00726529  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1251  arginyl-tRNA synthetase  45.98 
 
 
566 aa  536  1e-151  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0998852 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08210  arginyl-tRNA synthetase  45 
 
 
566 aa  536  1e-151  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2010  arginyl-tRNA synthetase  46.99 
 
 
562 aa  536  1e-151  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0025269  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2198  arginyl-tRNA synthetase  47.52 
 
 
562 aa  532  1e-150  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00225057 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1974  arginyl-tRNA synthetase  47.52 
 
 
562 aa  532  1e-150  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0585277  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2021  arginyl-tRNA synthetase  47.16 
 
 
562 aa  531  1e-149  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000995488  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1992  arginyl-tRNA synthetase  47.16 
 
 
562 aa  528  1e-149  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0418452  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2318  arginyl-tRNA synthetase  46.99 
 
 
562 aa  531  1e-149  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273467  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2175  arginyl-tRNA synthetase  47.16 
 
 
562 aa  531  1e-149  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000337819  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1620  arginyl-tRNA synthetase  48.76 
 
 
562 aa  531  1e-149  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010963  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1535  arginyl-tRNA synthetase  45.54 
 
 
624 aa  528  1e-148  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2181  arginyl-tRNA synthetase  46.45 
 
 
562 aa  526  1e-148  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.519125  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3135  arginyl-tRNA synthetase  46.81 
 
 
562 aa  521  1e-146  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0137352  normal  0.0340703 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0065  arginyl-tRNA synthetase  47.7 
 
 
563 aa  520  1e-146  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.079588  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1270  arginyl-tRNA synthetase  47.34 
 
 
562 aa  496  1e-139  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000463651  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2103  arginyl-tRNA synthetase  45.21 
 
 
563 aa  494  9.999999999999999e-139  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00628973  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2323  arginyl-tRNA synthetase  44.13 
 
 
564 aa  487  1e-136  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0466  arginyl-tRNA synthetase  44.39 
 
 
564 aa  487  1e-136  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.795792  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1215  arginyl-tRNA synthetase  46 
 
 
563 aa  487  1e-136  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1335  arginyl-tRNA synthetase  42.23 
 
 
565 aa  479  1e-134  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0899  arginyl-tRNA synthetase  43.35 
 
 
566 aa  474  1e-132  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0249713  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2236  arginyl-tRNA synthetase  50.57 
 
 
433 aa  458  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000339277  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3474  arginyl-tRNA synthetase  42.29 
 
 
580 aa  418  9.999999999999999e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.387689  normal  0.108328 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0333  arginyl-tRNA synthetase  39.32 
 
 
572 aa  366  1e-100  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1644  arginyl-tRNA synthetase  38.27 
 
 
640 aa  365  2e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.705073  hitchhiker  0.00244092 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2606  arginyl-tRNA synthetase  39.79 
 
 
574 aa  365  2e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.629784 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3643  arginyl-tRNA synthetase  38.26 
 
 
571 aa  363  6e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.679016  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1309  arginyl-tRNA synthetase  37.63 
 
 
613 aa  344  2e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.925397  normal  0.535647 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38727  arginyl-tRNA synthetase  34.39 
 
 
603 aa  338  9.999999999999999e-92  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.908762 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2169  arginyl-tRNA synthetase  36.41 
 
 
585 aa  329  8e-89  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4135  arginyl-tRNA synthetase  35.86 
 
 
591 aa  321  3e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06368  arginyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_2G14030)  30.73 
 
 
650 aa  301  2e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.908063  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3319  arginyl-tRNA synthetase  36.41 
 
 
575 aa  295  1e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0269  arginyl-tRNA synthetase  35.95 
 
 
576 aa  292  1e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01310  arginine-tRNA ligase, putative  34.29 
 
 
622 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0173932  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1577  arginyl-tRNA synthetase  35.54 
 
 
590 aa  285  2.0000000000000002e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3956  arginyl-tRNA synthetase  35.8 
 
 
574 aa  284  3.0000000000000004e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3671  arginyl-tRNA synthetase  35.27 
 
 
585 aa  283  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2379  arginyl-tRNA synthetase  36.33 
 
 
579 aa  282  1e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.222047  hitchhiker  0.007384 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2566  arginyl-tRNA synthetase  37.01 
 
 
590 aa  281  2e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2705  arginyl-tRNA synthetase  38.82 
 
 
598 aa  278  1e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02786  arginyl-tRNA synthetase  36.7 
 
 
576 aa  279  1e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5089  arginyl-tRNA synthetase  36.02 
 
 
578 aa  277  4e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.257691  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0438  arginyl-tRNA synthetase  33.71 
 
 
601 aa  277  4e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4962  arginyl-tRNA synthetase  36.02 
 
 
578 aa  277  5e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0399  arginyl-tRNA synthetase  36.79 
 
 
578 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02161  arginyl-tRNA synthetase  32.61 
 
 
602 aa  274  3e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02071  arginyl-tRNA synthetase  32.92 
 
 
604 aa  273  6e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0376  arginyl-tRNA synthetase  35.84 
 
 
578 aa  272  1e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3151  arginyl-tRNA synthetase  34.12 
 
 
585 aa  272  1e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4427  arginyl-tRNA synthetase  35.63 
 
 
581 aa  272  1e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5574  arginyl-tRNA synthetase  37.97 
 
 
619 aa  271  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.469409  normal  0.593378 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0443  arginyl-tRNA synthetase  36.01 
 
 
581 aa  271  2e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02621  arginyl-tRNA synthetase  32.98 
 
 
607 aa  271  2e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0249545  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2613  arginyl-tRNA synthetase  35.75 
 
 
577 aa  270  4e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00253751 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004100  arginyl-tRNA synthetase  34.3 
 
 
577 aa  270  5.9999999999999995e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000862961  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0542  arginyl-tRNA synthetase  34.41 
 
 
585 aa  269  8e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.475442  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0630  arginyl-tRNA synthetase  37.97 
 
 
593 aa  269  8e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0525  arginyl-tRNA synthetase  34.23 
 
 
585 aa  269  8e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4134  arginyl-tRNA synthetase  32.52 
 
 
577 aa  269  8e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.440291  hitchhiker  0.000000042149 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0533  arginyl-tRNA synthetase  35.08 
 
 
581 aa  269  1e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.142076  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01847  arginyl-tRNA synthetase  35.57 
 
 
577 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1764  arginyl-tRNA synthetase  35.57 
 
 
577 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1971  arginyl-tRNA synthetase  35.57 
 
 
577 aa  268  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01836  hypothetical protein  35.57 
 
 
577 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2155  arginyl-tRNA synthetase  34.89 
 
 
576 aa  267  4e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0808745  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3357  arginyl-tRNA synthetase  35.09 
 
 
581 aa  267  4e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0971  arginyl-tRNA synthetase  29.55 
 
 
590 aa  266  5e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.168665  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1554  arginyl-tRNA synthetase  33.39 
 
 
607 aa  267  5e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2069  arginyl-tRNA synthetase  35.38 
 
 
577 aa  266  7e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000205082 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1310  arginyl-tRNA synthetase  35.38 
 
 
577 aa  266  7e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.363287 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2124  arginyl-tRNA synthetase  35.38 
 
 
577 aa  266  8e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.726393  hitchhiker  0.0000003636 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2169  arginyl-tRNA synthetase  35.38 
 
 
577 aa  266  8e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3845  arginyl-tRNA synthetase  35.26 
 
 
581 aa  266  8e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2791  arginyl-tRNA synthetase  33.64 
 
 
576 aa  266  8.999999999999999e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.263184 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0378  arginyl-tRNA synthetase  35.14 
 
 
581 aa  266  8.999999999999999e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1756  arginyl-tRNA synthetase  35.38 
 
 
577 aa  266  8.999999999999999e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4123  arginyl-tRNA synthetase  35.26 
 
 
581 aa  265  1e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5138  arginyl-tRNA synthetase  36.06 
 
 
578 aa  266  1e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.447973  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0498  arginyl-tRNA synthetase  35.26 
 
 
581 aa  266  1e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2043  arginyl-tRNA synthetase  34.89 
 
 
576 aa  265  1e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0495  arginyl-tRNA synthetase  35.26 
 
 
581 aa  266  1e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0474  arginyl-tRNA synthetase  35.26 
 
 
581 aa  266  1e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2173  arginyl-tRNA synthetase  33.7 
 
 
576 aa  265  2e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2434  arginyl-tRNA synthetase  34.7 
 
 
576 aa  265  2e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.962719  normal  0.035286 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5139  arginyl-tRNA synthetase  35.48 
 
 
578 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00424681  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3673  arginyl-tRNA synthetase  34.56 
 
 
581 aa  265  2e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1661  arginyl-tRNA synthetase  34.51 
 
 
599 aa  265  2e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1337  arginyl-tRNA synthetase  35.2 
 
 
577 aa  264  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000014051 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0146  arginyl-tRNA synthetase  34.89 
 
 
572 aa  264  3e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1213  arginyl-tRNA synthetase  35.2 
 
 
577 aa  264  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0562  arginyl-tRNA synthetase  31.92 
 
 
550 aa  264  3e-69  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2064  arginyl-tRNA synthetase  35.2 
 
 
577 aa  264  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.10003 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0153  arginyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
572 aa  263  4.999999999999999e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0456  arginyl-tRNA synthetase  34.56 
 
 
581 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2108  arginyl-tRNA synthetase  35.32 
 
 
577 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3496  arginyl-tRNA synthetase  34.39 
 
 
581 aa  263  8e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>