More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2258 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  100 
 
 		 296 aa  563  1.0000000000000001e-159  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  100 
 
 		 305 aa  563  1.0000000000000001e-159  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0148  hypothetical protein  47.6 
 
 		 308 aa  246  3e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.171694 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0534  hypothetical protein  47.97 
 
 		 310 aa  245  4.9999999999999997e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.736309  normal  0.683051 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0208  protein of unknown function DUF81  45.58 
 
 		 307 aa  241  7.999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0237  protein of unknown function DUF81  45.24 
 
 		 307 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  47.26 
 
 		 306 aa  233  3e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  46.35 
 
 		 307 aa  232  5e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2206  hypothetical protein  46.92 
 
 		 306 aa  231  7.000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.767696  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  46.74 
 
 		 306 aa  231  1e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3098  hypothetical protein  48.29 
 
 		 330 aa  231  1e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.075635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0602  hypothetical protein  45.89 
 
 		 307 aa  228  9e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.116643  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0026  hypothetical protein  45.92 
 
 		 305 aa  225  6e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25228  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0703  protein of unknown function DUF81  47.64 
 
 		 312 aa  224  2e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.619223 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  43.58 
 
 		 307 aa  220  1.9999999999999999e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2287  hypothetical protein  47.26 
 
 		 306 aa  219  5e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.733159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  46.6 
 
 		 315 aa  217  2e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0823  hypothetical protein  45.58 
 
 		 316 aa  212  5.999999999999999e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.580669  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4039  hypothetical protein  45.05 
 
 		 306 aa  210  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.995552  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0772  hypothetical protein  45.24 
 
 		 316 aa  210  3e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000254854  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0967  protein of unknown function DUF81  43.24 
 
 		 303 aa  209  5e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000092207  normal  0.442745 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2732  hypothetical protein  47.6 
 
 		 307 aa  209  5e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.990455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2642  hypothetical protein  46.05 
 
 		 304 aa  208  8e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3547  hypothetical protein  47.12 
 
 		 304 aa  208  9e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2100  hypothetical protein  51.03 
 
 		 307 aa  204  1e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0741  hypothetical protein  40.69 
 
 		 308 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.610206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0807  putative permease  39.59 
 
 		 308 aa  187  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0899504 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0184  hypothetical protein  39.66 
 
 		 343 aa  186  6e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.249656  normal  0.93927 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0881  protein of unknown function DUF81  41.64 
 
 		 320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0800  hypothetical protein  39.93 
 
 		 307 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.979856  normal  0.617739 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4610  hypothetical protein  41.36 
 
 		 307 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.427893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2487  hypothetical protein  41.41 
 
 		 307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.741718 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3097  hypothetical protein  41 
 
 		 307 aa  170  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0521383  normal  0.0206179 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0529  protein of unknown function DUF81  46.13 
 
 		 301 aa  166  5e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.639681  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5288  protein of unknown function DUF81  42.76 
 
 		 307 aa  160  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000586578  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0245  hypothetical protein  40.55 
 
 		 308 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.176673  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0240  hypothetical protein  32.56 
 
 		 313 aa  135  8e-31  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0364801  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1975  hypothetical protein  33.33 
 
 		 394 aa  119  6e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000141125  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0315  protein of unknown function DUF81  33.33 
 
 		 415 aa  119  7e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.24542  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0357  protein of unknown function DUF81  31.45 
 
 		 420 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.968564  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0758  protein of unknown function DUF81  33.09 
 
 		 342 aa  110  3e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.154844  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0285  protein of unknown function DUF81  31.01 
 
 		 350 aa  109  5e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0253252 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1353  hypothetical protein  31.9 
 
 		 427 aa  108  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000251364  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1425  hypothetical protein  28.77 
 
 		 426 aa  105  8e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0163769  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4296  protein of unknown function DUF81  30.07 
 
 		 346 aa  105  9e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0264  protein of unknown function DUF81  30.31 
 
 		 345 aa  105  1e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1984  protein of unknown function DUF81  29.93 
 
 		 415 aa  102  7e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0644  hypothetical protein  32.34 
 
 		 417 aa  102  8e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2673  protein of unknown function DUF81  30.98 
 
 		 349 aa  101  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.970315  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1427  hypothetical protein  29.73 
 
 		 428 aa  100  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000425148  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3160  protein of unknown function DUF81  29.15 
 
 		 443 aa  98.2  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2103  protein of unknown function DUF81  29.93 
 
 		 352 aa  95.1  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2833  hypothetical protein  31 
 
 		 415 aa  93.6  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.260143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0040  protein of unknown function DUF81  31.99 
 
 		 309 aa  91.3  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0626  hypothetical protein  28.73 
 
 		 356 aa  90.9  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1512  hypothetical protein  33.1 
 
 		 360 aa  90.5  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.864681  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1799  protein of unknown function DUF81  29.3 
 
 		 356 aa  85.1  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0095  hypothetical protein  29.93 
 
 		 356 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.571557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1011  protein of unknown function DUF81  32.48 
 
 		 362 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0652909 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2818  hypothetical protein  26.6 
 
 		 350 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2342  protein of unknown function DUF81  27.94 
 
 		 350 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3721  protein of unknown function DUF81  32.34 
 
 		 346 aa  83.2  0.000000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.766072  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4256  protein of unknown function DUF81  33.59 
 
 		 330 aa  82.8  0.000000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1032  protein of unknown function DUF81  32.68 
 
 		 329 aa  80.9  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2613  hypothetical protein  28.78 
 
 		 361 aa  80.5  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.303309 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1044  protein of unknown function DUF81  29.41 
 
 		 349 aa  80.5  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.161703  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1316  hypothetical protein  30.55 
 
 		 339 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.919916  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5026  hypothetical protein  30.48 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0908979  normal  0.879248 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0692  hypothetical protein  27.3 
 
 		 257 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0982631  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1641  protein of unknown function DUF81  29.32 
 
 		 354 aa  79  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.407514  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1150  hypothetical protein  24.38 
 
 		 275 aa  79  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0836  hypothetical protein  26.13 
 
 		 254 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00239721  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5534  protein of unknown function DUF81  43.44 
 
 		 309 aa  75.5  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.511417 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2185  hypothetical protein  26.2 
 
 		 257 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000204592  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0638  hypothetical protein  27.71 
 
 		 355 aa  74.3  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.328833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1020  protein of unknown function DUF81  32.36 
 
 		 325 aa  73.9  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.470827  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1504  hypothetical protein  31.64 
 
 		 255 aa  72.8  0.000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00278101  normal  0.358981 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0600  protein of unknown function DUF81  24.54 
 
 		 278 aa  72.8  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2368  hypothetical protein  27.5 
 
 		 257 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0031  permease  26.81 
 
 		 257 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0872  hypothetical protein  27.53 
 
 		 254 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0958  protein of unknown function DUF81  30.81 
 
 		 259 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0931  protein of unknown function DUF81  30.81 
 
 		 259 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2342  hypothetical protein  28.83 
 
 		 253 aa  70.9  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0230503 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0075  protein of unknown function DUF81  25.8 
 
 		 276 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.393989  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0968  hypothetical protein  33.33 
 
 		 269 aa  70.5  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0921  hypothetical protein  25.75 
 
 		 275 aa  70.1  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0525574  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0940  hypothetical protein  25.75 
 
 		 275 aa  70.1  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2291  hypothetical protein  30.09 
 
 		 266 aa  69.3  0.00000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.734365  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1722  hypothetical protein  31.39 
 
 		 261 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18800  predicted permease  27.74 
 
 		 323 aa  68.2  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4500  hypothetical protein  26.83 
 
 		 254 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000116291 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1418  hypothetical protein  28.94 
 
 		 300 aa  65.9  0.0000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297306  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8588  hypothetical protein  27.99 
 
 		 317 aa  65.9  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.633076  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4693  hypothetical protein  29.81 
 
 		 250 aa  65.9  0.0000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0114145  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2244  hypothetical protein  30.63 
 
 		 261 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.727347 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1875  hypothetical protein  30.26 
 
 		 261 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3139  protein of unknown function DUF81  26.84 
 
 		 280 aa  64.3  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2357  protein of unknown function DUF81  29.08 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3494  hypothetical protein  30.26 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.585154  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>