More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1297 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1297  cobalamin biosynthesis protein, CobS family  100 
 
 		 306 aa  618  1e-176  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0573751  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4067  ATPase  40 
 
 		 321 aa  179  5.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0207  ATPase  41.02 
 
 		 307 aa  175  8e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0262  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  42.02 
 
 		 307 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0106  AAA family ATPase  37.17 
 
 		 322 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0687561  normal  0.0739465 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2158  cobS protein, putative  39.06 
 
 		 313 aa  163  3e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2922  ATPase  37.25 
 
 		 338 aa  155  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3433  ATPase  37.25 
 
 		 338 aa  154  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2608  ATPase  37.45 
 
 		 324 aa  151  2e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.8348 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3729  ATPase  31.27 
 
 		 317 aa  137  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2872  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.78 
 
 		 314 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.47653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1887  ATPase  29.93 
 
 		 328 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.863936  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1877  cobalt chelatase, pCobS small subunit  33.57 
 
 		 327 aa  126  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0965153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3069  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  33.09 
 
 		 343 aa  122  5e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.51378  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0914  cobalt chelatase, pCobS small subunit  32.85 
 
 		 328 aa  123  5e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5079  ATPase  32.83 
 
 		 330 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.141996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2560  cobalt chelatase, pCobS small subunit  33.09 
 
 		 331 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.438183 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0080  cobaltochelatase, CobS subunit  33.99 
 
 		 328 aa  119  9e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2022  cobalamin biosynthesis protein, putative  32.49 
 
 		 328 aa  118  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.526454  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1946  cobaltochelatase, CobS subunit  32.13 
 
 		 328 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.344536  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6496  cobalt chelatase, pCobS small subunit  32.85 
 
 		 327 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0251136  decreased coverage  0.00405526 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3884  cobalt chelatase, pCobS small subunit  31.85 
 
 		 330 aa  115  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.922452  hitchhiker  0.0087584 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6740  cobalt chelatase, pCobS small subunit  32.85 
 
 		 327 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3591  cobalt chelatase, pCobS small subunit  32.22 
 
 		 330 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.244464  normal  0.721519 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0287  cobalt chelatase, pCobS small subunit  32.73 
 
 		 331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.300269 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0403  cobalt chelatase, pCobS small subunit  32.62 
 
 		 332 aa  114  3e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.154081  normal  0.524708 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0541  cobalt chelatase, pCobS small subunit  32.36 
 
 		 331 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7565  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  31.97 
 
 		 318 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0499  cobalt chelatase, pCobS small subunit  32 
 
 		 331 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.368358  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4046  cobaltochelatase CobS subunit  32.84 
 
 		 330 aa  112  7.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0554035  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3698  cobalt chelatase, pCobS small subunit  31.67 
 
 		 327 aa  112  9e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.41569 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0318  cobalt chelatase, pCobS small subunit  31.88 
 
 		 332 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0350783 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0108  AAA family ATPase  36.03 
 
 		 411 aa  110  3e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  2.32776e-96  hitchhiker  3.99922e-135 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0498  cobalt chelatase, pCobS small subunit  31.3 
 
 		 332 aa  108  8.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0538  cobalt chelatase, pCobS small subunit  31.68 
 
 		 331 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.408122 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6209  cobaltochelatase  29.33 
 
 		 330 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.850781  normal  0.94187 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3425  cobalt chelatase, pCobS small subunit  32.02 
 
 		 327 aa  107  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.910371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1713  cobalt chelatase, pCobS small subunit  31.25 
 
 		 331 aa  107  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.736131  normal  0.451542 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4278  ATPase  36.76 
 
 		 301 aa  107  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2189  cobalt chelatase, pCobS small subunit  32.35 
 
 		 324 aa  107  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.560792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3230  cobalt chelatase, pCobS small subunit  31.62 
 
 		 327 aa  105  9e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.453158 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3554  cobalt chelatase, pCobS small subunit  31.62 
 
 		 327 aa  105  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869389  normal  0.328272 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3427  cobalt chelatase, pCobS small subunit  30.43 
 
 		 334 aa  104  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.227982  normal  0.273109 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1712  cobalt chelatase, pCobS small subunit  32.22 
 
 		 338 aa  103  3e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2891  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  30.36 
 
 		 326 aa  103  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0687  cobalt chelatase, pCobS small subunit  31.5 
 
 		 364 aa  102  9e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1977  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  31.5 
 
 		 364 aa  102  9e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.290532  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2280  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  32.52 
 
 		 328 aa  102  9e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3076  cobalt chelatase, pCobS small subunit  31.14 
 
 		 345 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2711  aerobic cobaltochelatase subunit cobS  33.18 
 
 		 327 aa  101  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.672533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0687  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  30.83 
 
 		 329 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.5623 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0222  cobalt chelatase, pCobS small subunit  33.02 
 
 		 330 aa  100  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.605914  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4520  cobaltochelatase  30.28 
 
 		 328 aa  100  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0470453  normal  0.475995 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4365  Cobaltochelatase  31.2 
 
 		 329 aa  100  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.633066 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1997  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  30.28 
 
 		 329 aa  100  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.284374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2735  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  31.64 
 
 		 329 aa  100  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5501  ATPase  33.2 
 
 		 346 aa  99.8  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1301  hypothetical protein  34.98 
 
 		 315 aa  98.6  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.146345  normal  0.342986 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4201  ATPase  33.85 
 
 		 324 aa  98.6  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.180208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5308  Cobaltochelatase  34.98 
 
 		 409 aa  97.8  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3252  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.8 
 
 		 308 aa  97.4  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.255293  normal  0.0133684 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0643  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  32.09 
 
 		 328 aa  97.1  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.040533  normal  0.256697 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2331  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  30.65 
 
 		 334 aa  97.4  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0537917  normal  0.414847 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0116  cobalt chelatase, pCobS small subunit  31.18 
 
 		 343 aa  96.7  5e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0277687  normal  0.0706588 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1844  ATPase AAA_5  31.98 
 
 		 279 aa  95.5  9e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.79049  normal  0.260882 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0644  cobalt chelatase, pCobS small subunit  29.03 
 
 		 329 aa  95.1  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.751429  normal  0.0530402 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3827  Cobaltochelatase  30.5 
 
 		 327 aa  95.1  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4668  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.62 
 
 		 373 aa  94.7  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7219  ATPase AAA_5  34.02 
 
 		 400 aa  94.7  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0711  cobalt chelatase, pCobS small subunit  31.13 
 
 		 335 aa  94.7  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.141534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3755  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  29.5 
 
 		 322 aa  92  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.430731  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0394  cobalamin biosynthesis CobS-like protein  28.77 
 
 		 375 aa  92  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0313111  hitchhiker  0.00145489 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1994  cobaltochelatase  30.74 
 
 		 325 aa  91.7  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.148591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2119  ATPase  29.39 
 
 		 270 aa  86.3  5e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.976188 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3190  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  29.52 
 
 		 267 aa  85.9  8e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.209478  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06310  midasin, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12150)  34.27 
 
 		 4917 aa  85.1  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.589937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0429  ATPase  28.69 
 
 		 272 aa  85.5  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1678  p30 protein  29.88 
 
 		 267 aa  85.1  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.155235  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1376  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  29.88 
 
 		 267 aa  85.1  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.428584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0131  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  28.45 
 
 		 268 aa  85.1  0.000000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0206  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  29.3 
 
 		 329 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.218471  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4344  ATPase  29.33 
 
 		 278 aa  83.2  0.000000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.785303  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2746  cbbQ protein  31.43 
 
 		 266 aa  83.2  0.000000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.728078  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1976  ATPase  29.33 
 
 		 307 aa  82.8  0.000000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.919685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71553  predicted protein  34.08 
 
 		 4979 aa  82.4  0.000000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.473575 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1467  ATPase  30.67 
 
 		 277 aa  82.4  0.000000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.232616 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1978  ATPase  29.25 
 
 		 285 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4904  ATPase  28.69 
 
 		 272 aa  80.5  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.465614 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3640  ATPase  28.92 
 
 		 285 aa  80.9  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.232524  normal  0.0364996 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1044  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  29.77 
 
 		 268 aa  80.1  0.00000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.552849  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1683  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.17 
 
 		 278 aa  80.5  0.00000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0871  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  28.9 
 
 		 267 aa  79.7  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3053  CbbQ protein  28.85 
 
 		 267 aa  78.2  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2662  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  28.85 
 
 		 267 aa  78.2  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0601  ATPase  29.39 
 
 		 265 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.309548  normal  0.0418283 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4065  hypothetical protein  29.72 
 
 		 271 aa  79  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.312415 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3615  nitric-oxide reductase NorQ protein  32.26 
 
 		 280 aa  79  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0071998  normal  0.061838 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3766  CbbQ/NirQ/NorQ domain-containing protein  29.05 
 
 		 268 aa  77.8  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2090  NorD protein required for nitric oxide reductase (Nor) activity (putative chaperone, ATPase)  27.98 
 
 		 269 aa  77.4  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.835685 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3185  nitric oxide reductase Q protein  29.1 
 
 		 268 aa  77  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.540661  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>