264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3640 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_3640  ATPase  100 
 
 
285 aa  585  1e-166  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.232524  normal  0.0364996 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4904  ATPase  81.13 
 
 
272 aa  449  1e-125  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.465614 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1976  ATPase  65.54 
 
 
307 aa  369  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.919685  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3190  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  64.91 
 
 
267 aa  369  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.209478  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2662  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  65.66 
 
 
267 aa  369  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0905  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  64.23 
 
 
267 aa  367  1e-101  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3053  CbbQ protein  65.66 
 
 
267 aa  369  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2746  cbbQ protein  66.54 
 
 
266 aa  367  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.728078  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1547  ATPase  64.64 
 
 
269 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.591966  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2637  rubisco activation protein CbbQ  63.85 
 
 
268 aa  362  3e-99  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1376  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  66.15 
 
 
267 aa  362  4e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.428584  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1678  p30 protein  66.15 
 
 
267 aa  362  4e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.155235  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0871  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  65.28 
 
 
267 aa  361  8e-99  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4344  ATPase  63.77 
 
 
278 aa  361  1e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.785303  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2622  rubisco activation protein CbbQ  65 
 
 
267 aa  359  3e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0131  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  64.64 
 
 
268 aa  359  3e-98  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3766  CbbQ/NirQ/NorQ domain-containing protein  65.13 
 
 
268 aa  359  3e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2156  CbbQ protein  61.22 
 
 
272 aa  356  1.9999999999999998e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1044  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  66.15 
 
 
268 aa  356  1.9999999999999998e-97  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.552849  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1815  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  61.22 
 
 
272 aa  356  1.9999999999999998e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1094  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  62.07 
 
 
267 aa  354  8.999999999999999e-97  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1499  ATPase  63.85 
 
 
267 aa  352  2.9999999999999997e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00779848  normal  0.0229938 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2838  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  62.69 
 
 
268 aa  350  1e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.990465  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4065  hypothetical protein  64.12 
 
 
271 aa  350  2e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.312415 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1977  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  62.12 
 
 
265 aa  348  4e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0423  ATPase  58.33 
 
 
266 aa  344  8.999999999999999e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0429  ATPase  64.11 
 
 
272 aa  342  2.9999999999999997e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1966  putative cbbQ/nirQ/norQ/gpvN family protein  61.3 
 
 
266 aa  340  2e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.947732 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1844  ATPase AAA_5  60.52 
 
 
279 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.79049  normal  0.260882 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3615  nitric-oxide reductase NorQ protein  60.92 
 
 
280 aa  332  3e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0071998  normal  0.061838 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0601  ATPase  60.23 
 
 
265 aa  329  4e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.309548  normal  0.0418283 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2684  ATPase  60.77 
 
 
279 aa  326  3e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2766  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  59.77 
 
 
267 aa  322  4e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.27338  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3434  ATPase  59.38 
 
 
267 aa  322  4e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.513297  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0869  nitric oxide reductase activation protein NorQ  56.98 
 
 
270 aa  319  3e-86  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1254  ATPase  58.27 
 
 
284 aa  315  8e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3134  ATPase  51.66 
 
 
280 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2164  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  56.59 
 
 
286 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0558  putative nitric oxide reductase activation protein NorQ  56.86 
 
 
271 aa  310  1e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.365117  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2536  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  55.47 
 
 
276 aa  310  2e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.95955  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2164  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  55.47 
 
 
271 aa  309  2.9999999999999997e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.152394  hitchhiker  0.00000222341 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0119  ATPase  55.64 
 
 
270 aa  308  9e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0651  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  54.51 
 
 
286 aa  305  4.0000000000000004e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.486939  normal  0.117571 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3194  ATPase  56.08 
 
 
260 aa  305  8.000000000000001e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2602  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  56.47 
 
 
266 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1978  ATPase  55.34 
 
 
285 aa  302  5.000000000000001e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1848  ATPase  55.81 
 
 
275 aa  300  1e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3121  ATPase  56.69 
 
 
260 aa  300  2e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.209587  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2119  ATPase  56.86 
 
 
270 aa  300  2e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.976188 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0824  nitric oxide reductase activation protein NorQ  56.18 
 
 
270 aa  297  1e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.569782  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4196  ATPase  57.54 
 
 
273 aa  296  3e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.220432  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06770  regulatory protein NirQ  56.18 
 
 
260 aa  295  5e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2319  denitrification regulatory protein nirQ  55.73 
 
 
260 aa  292  3e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.101351  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0621  regulatory protein NirQ  54.9 
 
 
260 aa  292  4e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2458  ATPase  56.35 
 
 
273 aa  287  1e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1517  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  52.79 
 
 
271 aa  287  1e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3185  nitric oxide reductase Q protein  54.9 
 
 
268 aa  288  1e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.540661  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3738  ATPase  55.29 
 
 
282 aa  285  4e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.232377  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2576  ATPase  54.51 
 
 
283 aa  285  5e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0133764  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2538  ATPase  54.51 
 
 
283 aa  285  5e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3726  ATPase  55.29 
 
 
282 aa  285  5e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0460635  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2583  ATPase  54.51 
 
 
283 aa  285  5e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3799  ATPase  55.29 
 
 
282 aa  285  5e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00566869 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0972  ATPase  53.73 
 
 
265 aa  285  8e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.750079  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6287  ATPase  53.97 
 
 
272 aa  284  1.0000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2090  NorD protein required for nitric oxide reductase (Nor) activity (putative chaperone, ATPase)  52.94 
 
 
269 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.835685 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0322  NorQ protein required for nitric oxide reductase activity  53.73 
 
 
265 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4155  ATPase  54.55 
 
 
282 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.175272  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1967  ATPase  53.73 
 
 
265 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1467  ATPase  55.79 
 
 
277 aa  282  3.0000000000000004e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.232616 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2482  ATPase  53.73 
 
 
270 aa  276  3e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1643  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  53.97 
 
 
270 aa  275  5e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0250  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  51.19 
 
 
270 aa  272  5.000000000000001e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.326852  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0226  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  51.59 
 
 
270 aa  272  6e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4388  ATPase  51.59 
 
 
270 aa  270  2e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0269278  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1772  ATPase  48.99 
 
 
266 aa  240  2e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4975  ATPase  47.2 
 
 
267 aa  232  5e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.352604  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4418  ATPase  52.38 
 
 
267 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.999238  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4505  ATPase  52.38 
 
 
267 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4799  ATPase  51.9 
 
 
267 aa  219  3e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.446718  normal  0.789271 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3252  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.84 
 
 
308 aa  104  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.255293  normal  0.0133684 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06310  midasin, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12150)  32.67 
 
 
4917 aa  98.6  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.589937  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4201  ATPase  29.33 
 
 
324 aa  97.8  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.180208  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0979  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  26.47 
 
 
263 aa  94.7  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1499  ATPase  27.27 
 
 
263 aa  90.9  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1470  ATPase  27.27 
 
 
263 aa  90.9  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.33277  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71553  predicted protein  31.02 
 
 
4979 aa  89  8e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.473575 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1683  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.32 
 
 
278 aa  86.3  5e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01380  midasin, putative  31.09 
 
 
4844 aa  85.5  0.000000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0536  ATPase  25.1 
 
 
297 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0538  ATPase  26.56 
 
 
297 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4676  putative norQ protein  25.73 
 
 
297 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  3.7049199999999996e-21 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0693  norQ protein, putative  25.73 
 
 
297 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0661  putative norQ protein  25.73 
 
 
297 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2158  cobS protein, putative  28.91 
 
 
313 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0591  NorQ protein  26.14 
 
 
297 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0535  nitric-oxide reductase  26.14 
 
 
297 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0535  nitric-oxide reductase  26.14 
 
 
297 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0679  putative norQ protein  26.14 
 
 
297 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000358877 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0624  norq protein  26.14 
 
 
297 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.695502  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>