121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_06381 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008816  A9601_06381  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  100 
 
 
327 aa  672    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06081  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  97.55 
 
 
327 aa  658    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0582  hypothetical protein  92.05 
 
 
327 aa  630  1e-179  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06471  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  83.33 
 
 
294 aa  511  1e-144  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06381  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  50.77 
 
 
328 aa  325  7e-88  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0655453  normal  0.975907 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0018  hypothetical protein  50.92 
 
 
328 aa  325  9e-88  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1016  hypothetical protein  45.96 
 
 
339 aa  323  3e-87  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0917  hypothetical protein  46.27 
 
 
339 aa  318  7.999999999999999e-86  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.178943  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18351  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  46.01 
 
 
333 aa  315  6e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.279534 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10701  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  48.3 
 
 
333 aa  311  1e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.638537 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1087  hypothetical protein  41.12 
 
 
324 aa  255  7e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000930437 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.91 
 
 
319 aa  238  9e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1715  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.83 
 
 
324 aa  225  9e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5160  NmrA family protein  34.89 
 
 
318 aa  221  9.999999999999999e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2132  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.17 
 
 
317 aa  218  8.999999999999998e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2180  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.86 
 
 
317 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0725  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.99 
 
 
315 aa  215  7e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0116647  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2672  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.81 
 
 
315 aa  203  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.340849 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1783  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.72 
 
 
334 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.81312  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5626  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.27 
 
 
322 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0770321  normal  0.518626 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5247  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.27 
 
 
322 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.105316  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5335  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.27 
 
 
322 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.323313 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.85 
 
 
319 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0206  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.7 
 
 
352 aa  55.1  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  20.85 
 
 
333 aa  55.1  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2548  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 
357 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.211068 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0793  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  22.6 
 
 
331 aa  53.9  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5287  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.5 
 
 
350 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3221  polysaccharide biosynthesis protein CapD  24.14 
 
 
335 aa  52.4  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2232  polysaccharide biosynthesis protein CapD  21.74 
 
 
332 aa  50.4  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0242  saccharopine dehydrogenase related protein  32.17 
 
 
279 aa  50.1  0.00005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7040  hopanoid-associated sugar epimerase  27.12 
 
 
336 aa  49.7  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000519767 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0022  hypothetical protein  27.12 
 
 
336 aa  48.9  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1591  polysaccharide biosynthesis protein CapD  25.17 
 
 
344 aa  48.9  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.49643  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0146  polysaccharide biosynthesis protein CapD  24.07 
 
 
329 aa  48.5  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000342824 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2297  GDP-D-mannose dehydratase, putative  24.22 
 
 
337 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3293  WcbK  24.22 
 
 
337 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.402008  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0531  putative GDP-D-mannose dehydratase  24.22 
 
 
337 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.212911  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1069  putative GDP-D-mannose dehydratase  24.22 
 
 
337 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.351699  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.91 
 
 
333 aa  47.8  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0684  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  22.61 
 
 
312 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3244  GDP-6-deoxy-D-lyxo-4-hexulose reductase  24.22 
 
 
337 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3279  GDP-6-deoxy-D-lyxo-4-hexulose reductase  24.22 
 
 
337 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.409914  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2175  putative GDP-D-mannose dehydratase  24.22 
 
 
337 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.687698  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.97 
 
 
315 aa  48.1  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2037  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.17 
 
 
299 aa  46.6  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13073  capsular polysaccharide biosynthesis protein  25.6 
 
 
336 aa  46.6  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5425  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.16 
 
 
317 aa  46.6  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1119  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
372 aa  47  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.718161  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0002  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  22.35 
 
 
322 aa  46.6  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1225  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.46 
 
 
304 aa  46.6  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2586  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.44 
 
 
334 aa  46.6  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000232422 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3690  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.4 
 
 
331 aa  46.6  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.556189  normal  0.226818 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.42 
 
 
333 aa  46.2  0.0007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0280203  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0117  polysaccharide biosynthesis protein CapD  21.26 
 
 
335 aa  46.2  0.0008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000592797 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1188  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
372 aa  46.2  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.8 
 
 
330 aa  45.8  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3495  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.66 
 
 
369 aa  45.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.437184  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2409  polysaccharide biosynthesis protein CapD  23.39 
 
 
344 aa  45.8  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.551754  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1339  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.73 
 
 
331 aa  45.8  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0359  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.71 
 
 
327 aa  45.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.15 
 
 
355 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.129655 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1447  UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase  24 
 
 
328 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000193449 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4023  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.98 
 
 
308 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0248885  hitchhiker  0.0015787 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8881  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.44 
 
 
341 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.282171  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3414  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  24.39 
 
 
303 aa  45.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1833  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.68 
 
 
335 aa  45.1  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3560  polysaccharide biosynthesis protein CapD  27.05 
 
 
331 aa  44.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.423862 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0560  polysaccharide biosynthesis protein  26.83 
 
 
328 aa  44.7  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0539  hypothetical protein  27.41 
 
 
328 aa  44.7  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3715  polysaccharide biosynthesis protein CapD  25.6 
 
 
344 aa  44.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.722931  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3152  hopanoid-associated sugar epimerase  23.81 
 
 
340 aa  45.1  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4126  hopanoid-associated sugar epimerase  26.27 
 
 
336 aa  44.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0266  hypothetical protein  26.47 
 
 
329 aa  44.7  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.488249  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1920  NAD-dependent epimerase/dehydratase  20.81 
 
 
346 aa  45.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.892292  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1104  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.73 
 
 
310 aa  44.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.949606  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1060  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.22 
 
 
372 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1872  polysaccharide biosynthesis protein CapD  23.97 
 
 
336 aa  43.9  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0528646  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2077  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.32 
 
 
314 aa  44.3  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2324  VI polysaccharide biosynthesis protein vipB/tviC  24.68 
 
 
343 aa  43.9  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3257  hopanoid-associated sugar epimerase  23.73 
 
 
335 aa  44.3  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273856  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1815  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.71 
 
 
349 aa  44.3  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1007  GDP-6-deoxy-D-lyxo-4-hexulose reductase  24.59 
 
 
319 aa  43.9  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.197321  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0109  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.73 
 
 
335 aa  43.9  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3947  polysaccharide biosynthesis protein CapD  24.41 
 
 
340 aa  43.9  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.689942  normal  0.177131 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3265  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.56 
 
 
372 aa  43.9  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.791109 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5311  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.73 
 
 
335 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114305  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4873  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.73 
 
 
335 aa  43.9  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5549  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.73 
 
 
335 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.482021  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4723  hopanoid-associated sugar epimerase  23.73 
 
 
335 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0147  polysaccharide biosynthesis protein CapD  23.14 
 
 
340 aa  43.5  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.886918  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3011  polysaccharide biosynthesis protein CapD  25 
 
 
331 aa  43.9  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7142  hopanoid-associated sugar epimerase  26.27 
 
 
347 aa  43.9  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.516154  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3520  polysaccharide biosynthesis protein CapD  23.43 
 
 
328 aa  43.5  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4170  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.88 
 
 
358 aa  43.1  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117289  normal  0.322206 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56924  cinnamyl-alcohol dehydrogenase  22.32 
 
 
332 aa  43.5  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.302956 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2441  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.29 
 
 
333 aa  43.1  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.989614  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.07 
 
 
373 aa  43.5  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1105  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  23.93 
 
 
332 aa  43.1  0.006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4586  polysaccharide biosynthesis protein CapD  25.62 
 
 
348 aa  43.1  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.789975  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>