174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_2234 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_0046  glucan biosynthesis protein D  74.49 
 
 
534 aa  813    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.11724 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0141  glucan biosynthesis protein D  64.67 
 
 
534 aa  694    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0359657 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1791  glucan biosynthesis protein D  65.59 
 
 
525 aa  676    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.315041 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03624  glucan biosynthesis protein D  78.93 
 
 
534 aa  840    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2144  glucan biosynthesis protein D  98.69 
 
 
534 aa  1086    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2234  glucan biosynthesis protein D  100 
 
 
537 aa  1107    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1051  glucan biosynthesis protein D  58.87 
 
 
597 aa  619  1e-176  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0926  glucan biosynthesis protein D  59.07 
 
 
604 aa  618  1e-176  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000374583  normal  0.530607 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3021  glucan biosynthesis protein D  59.48 
 
 
594 aa  620  1e-176  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3046  glucan biosynthesis protein D  58.87 
 
 
604 aa  617  1e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000732267  normal  0.185455 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0889  glucan biosynthesis protein D  59.07 
 
 
558 aa  617  1e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000629377  normal  0.387819 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0877  glucan biosynthesis protein D  58.67 
 
 
562 aa  615  1e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000443395  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3412  glucan biosynthesis protein D  58.67 
 
 
562 aa  615  1e-175  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000028825  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3487  glucan biosynthesis protein D  58.67 
 
 
608 aa  616  1e-175  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000242416  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3610  glucan biosynthesis protein D  58.67 
 
 
562 aa  615  1e-175  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000323201  normal  0.858477 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2990  glucan biosynthesis protein D  61.78 
 
 
560 aa  601  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4296  glucan biosynthesis protein D  56.85 
 
 
568 aa  598  1e-170  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000183317 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0233  glucan biosynthesis protein D  56.42 
 
 
530 aa  600  1e-170  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3337  glucan biosynthesis protein D  61.78 
 
 
560 aa  586  1e-166  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3057  glucan biosynthesis protein D  60.8 
 
 
507 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445662  normal  0.366151 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1038  glucan biosynthesis protein D  46.06 
 
 
542 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.667596 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1506  glucan biosynthesis protein D  44.91 
 
 
551 aa  444  1e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01381  glucan biosynthesis protein, periplasmic  45.59 
 
 
541 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2222  periplasmic glucan biosynthesis protein MdoG  45.59 
 
 
539 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.834174  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01393  hypothetical protein  44.73 
 
 
551 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1649  glucan biosynthesis protein D  44.55 
 
 
551 aa  440  9.999999999999999e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1971  glucan biosynthesis protein D  45.54 
 
 
551 aa  441  9.999999999999999e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1603  glucan biosynthesis protein D  44.73 
 
 
551 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1750  glucan biosynthesis protein D  45.79 
 
 
539 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  2.5781800000000004e-18 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2235  glucan biosynthesis protein D  45.79 
 
 
539 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.720704 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2029  glucan biosynthesis protein D  45.79 
 
 
539 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.511288  hitchhiker  0.0000000000014294 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5542  periplasmic glucan biosynthesis protein, putative  43.65 
 
 
539 aa  434  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3122  glucan biosynthesis protein D  44.36 
 
 
551 aa  435  1e-120  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0218  glucan biosynthesis protein D  45.34 
 
 
550 aa  435  1e-120  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.451813  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5085  glucan biosynthesis protein D  43.46 
 
 
539 aa  431  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3964  glucan biosynthesis protein D  45.84 
 
 
537 aa  431  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4077  glucan biosynthesis protein D  45.84 
 
 
537 aa  431  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.608962 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1800  glucan biosynthesis protein D  45.02 
 
 
539 aa  427  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.947764  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1740  glucan biosynthesis protein D  45.02 
 
 
539 aa  427  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1535  glucan biosynthesis protein D  45.02 
 
 
539 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.603561  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1736  glucan biosynthesis protein D  45.02 
 
 
539 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.403462  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1720  glucan biosynthesis protein D  44.83 
 
 
539 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.29319 
 
 
-
 
NC_003296  RS03704  glucan biosynthesis protein D  44.92 
 
 
551 aa  419  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124419  normal  0.995047 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0143  glucan biosynthesis protein D  42.34 
 
 
543 aa  409  1e-113  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4673  glucan biosynthesis protein D  46.64 
 
 
540 aa  410  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4893  glucan biosynthesis protein D  46.48 
 
 
518 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00109342 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1830  glucan biosynthesis protein D  46.27 
 
 
519 aa  398  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.191017  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4033  glucan biosynthesis protein G  42.72 
 
 
533 aa  394  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450444  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1110  glucan biosynthesis protein D  45.09 
 
 
526 aa  389  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3273  glucan biosynthesis protein D  44.27 
 
 
532 aa  392  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0778178  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0309  glucan biosynthesis protein D  43.78 
 
 
524 aa  385  1e-106  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.105362 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3145  glucan biosynthesis protein D  44.27 
 
 
587 aa  387  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.680509  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3187  glucan biosynthesis protein D  46.39 
 
 
531 aa  384  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3185  glucan biosynthesis protein D  45.1 
 
 
527 aa  385  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.657429  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3438  glucan biosynthesis protein D  42.91 
 
 
545 aa  383  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3925  glucan biosynthesis protein D  46.19 
 
 
527 aa  381  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.324166  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4755  glucan biosynthesis protein G  41.7 
 
 
588 aa  377  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.708858  normal  0.22294 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0445  glucan biosynthesis protein G  43.76 
 
 
542 aa  373  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.102238 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3095  glucan biosynthesis protein G  43.39 
 
 
498 aa  370  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.3866  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2780  glucan biosynthesis protein G  41.43 
 
 
503 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.309239  normal  0.811126 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1650  glucan biosynthesis protein G  42.86 
 
 
532 aa  370  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2805  glucan biosynthesis protein G  42.28 
 
 
530 aa  363  3e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2135  glucan biosynthesis protein G  42.65 
 
 
528 aa  363  6e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3154  glucan biosynthesis protein G  42.28 
 
 
520 aa  362  8e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0128218 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2908  glucan biosynthesis protein G  42.77 
 
 
504 aa  361  2e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2046  glucan biosynthesis protein G  42.66 
 
 
539 aa  359  7e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.324147  normal  0.558823 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3220  glucan biosynthesis protein D  39.17 
 
 
503 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.321251  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3863  glucan biosynthesis protein D  41.58 
 
 
519 aa  358  1.9999999999999998e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0232574 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1712  glucan biosynthesis protein G  42.21 
 
 
540 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.15106  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2251  glucan biosynthesis protein G  42.13 
 
 
495 aa  357  3.9999999999999996e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1130  glucan biosynthesis protein G  41.56 
 
 
519 aa  355  1e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.700993 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2321  glucan biosynthesis protein G  42.34 
 
 
539 aa  355  1e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.405289  normal  0.314726 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0377  glucan biosynthesis protein G  38.67 
 
 
642 aa  352  1e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.713899  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1691  glucan biosynthesis protein G  40 
 
 
540 aa  352  1e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.138891  normal  0.0773488 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1158  glucan biosynthesis protein G  40.94 
 
 
527 aa  351  2e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.025306 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0125  glucan biosynthesis protein G  41.51 
 
 
540 aa  350  4e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2007  glucan biosynthesis protein G  42.04 
 
 
545 aa  350  4e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1762  glucan biosynthesis protein G  41.51 
 
 
540 aa  350  4e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.746379 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0907  glucan biosynthesis protein D  39.6 
 
 
545 aa  350  4e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201606  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2081  glucan biosynthesis protein G  39.39 
 
 
544 aa  348  1e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45530  glucan biosynthesis protein G  41.01 
 
 
505 aa  348  2e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.536607  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1829  glucan biosynthesis protein G  38.74 
 
 
545 aa  345  8.999999999999999e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4350  glucan biosynthesis protein D  41.77 
 
 
533 aa  345  8.999999999999999e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0483582  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5162  periplasmic glucan biosynthesis protein  38.28 
 
 
641 aa  345  1e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0373  glucan biosynthesis protein G  39.76 
 
 
604 aa  345  1e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.999536  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3848  glucan biosynthesis protein G  38.21 
 
 
559 aa  345  1e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1887  glucan biosynthesis protein G  38.54 
 
 
545 aa  345  1e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0593  glucan biosynthesis protein D  39.28 
 
 
522 aa  345  1e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000124621  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2148  glucan biosynthesis protein G  38.74 
 
 
545 aa  344  2e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0089817  normal  0.333418 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5817  glucan biosynthesis protein D  39.35 
 
 
525 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.470464  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2397  glucan biosynthesis protein G  38.34 
 
 
542 aa  343  4e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000106178  normal  0.024996 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3236  glucan biosynthesis protein G  42.49 
 
 
511 aa  343  4e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1929  glucan biosynthesis protein G  38.34 
 
 
542 aa  343  4e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.178013  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67090  glucan biosynthesis protein G  39.15 
 
 
525 aa  343  5.999999999999999e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.755776  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1896  glucan biosynthesis protein G  38.34 
 
 
542 aa  342  7e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.465098  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1922  glucan biosynthesis protein G  38.34 
 
 
542 aa  342  7e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000209795  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1081  glucan biosynthesis protein G  41.14 
 
 
533 aa  342  8e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.418062  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3043  glucan biosynthesis protein D  40.73 
 
 
534 aa  342  9e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500489  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2107  glucan biosynthesis protein G  38.54 
 
 
498 aa  342  1e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3996  glucan biosynthesis protein G  39.15 
 
 
536 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00021174  normal  0.469553 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>