More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_1912 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  100 
 
 
300 aa  593  1e-169  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 
300 aa  593  1e-169  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  67.8 
 
 
326 aa  400  9.999999999999999e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  68.44 
 
 
304 aa  387  1e-106  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  54.79 
 
 
299 aa  301  1e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05200  putative cation efflux system protein  54.11 
 
 
299 aa  280  2e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2218  cation diffusion facilitator family transporter  51.74 
 
 
297 aa  275  7e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0353679 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  50 
 
 
301 aa  275  8e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  50 
 
 
301 aa  275  8e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  50 
 
 
301 aa  275  8e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  50 
 
 
301 aa  275  8e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1761  cation diffusion facilitator family transporter  51.51 
 
 
316 aa  272  5.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0169574  normal  0.529338 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5979  cation diffusion facilitator CzcD  51.51 
 
 
316 aa  272  5.000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000910181  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  47.92 
 
 
312 aa  269  5e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3473  cation diffusion facilitator family transporter  55.37 
 
 
319 aa  268  8e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0501  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  50.68 
 
 
297 aa  255  6e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0340413  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0498  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  50.34 
 
 
297 aa  252  5.000000000000001e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7268  cation efflux system protein czcD  45.24 
 
 
305 aa  248  7e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.571769  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  42.96 
 
 
305 aa  238  1e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4086  cation diffusion facilitator family transporter  44.98 
 
 
313 aa  236  3e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  42.09 
 
 
298 aa  225  9e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  43.19 
 
 
312 aa  219  3.9999999999999997e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  41.16 
 
 
305 aa  217  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  38.83 
 
 
299 aa  216  4e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25900  cation diffusion facilitator family transporter  44.86 
 
 
304 aa  215  5.9999999999999996e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0215  cation diffusion facilitator family transporter  51.44 
 
 
299 aa  214  1.9999999999999998e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3080  zinc transporter ZitB  40.74 
 
 
310 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3642  cation diffusion facilitator family transporter  44.21 
 
 
299 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5042  normal  0.259615 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4903  cation diffusion facilitator family transporter  46.08 
 
 
308 aa  212  7e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  38.49 
 
 
299 aa  212  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2286  cation diffusion facilitator family transporter  41.76 
 
 
305 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76035  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2131  cation diffusion facilitator family transporter  41.76 
 
 
305 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.127518  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3389  cation diffusion facilitator family transporter  41.06 
 
 
305 aa  210  2e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.400984 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0395  cation diffusion facilitator family transporter  44.44 
 
 
327 aa  209  4e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.309924  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  38.14 
 
 
299 aa  209  4e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  38.49 
 
 
299 aa  209  5e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  39.18 
 
 
299 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0594  cation diffusion facilitator family transporter  42.96 
 
 
314 aa  206  3e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.987975  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0184  cation diffusion facilitator family transporter  43.06 
 
 
304 aa  206  4e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.421209  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  40.48 
 
 
312 aa  206  4e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  40.48 
 
 
312 aa  206  4e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2300  cation efflux protein  43.13 
 
 
300 aa  206  5e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  40.48 
 
 
312 aa  205  7e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2211  cation diffusion facilitator family transporter  38.67 
 
 
302 aa  204  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.284177 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1256  zinc transporter ZitB  41.75 
 
 
321 aa  204  2e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.139102  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  38.41 
 
 
299 aa  203  3e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  38.41 
 
 
299 aa  203  3e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  38.21 
 
 
299 aa  202  4e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0171  cation diffusion facilitator family transporter  42.36 
 
 
307 aa  203  4e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4034  cation diffusion facilitator family transporter  40.88 
 
 
326 aa  202  4e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0471983  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  38.21 
 
 
299 aa  202  5e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0389  cation diffusion facilitator family transporter  41.61 
 
 
308 aa  202  8e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  38.41 
 
 
295 aa  202  8e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0039  cation efflux protein  34.69 
 
 
312 aa  201  9.999999999999999e-51  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.747433  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0525  cation diffusion facilitator family transporter  43.77 
 
 
306 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0487  cation efflux family protein  39.86 
 
 
331 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3496  cation diffusion facilitator family transporter  45.17 
 
 
300 aa  198  7e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.844675 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3071  cation efflux protein  38.23 
 
 
334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325451  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1191  cation diffusion facilitator family transporter  40.88 
 
 
309 aa  196  3e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4570  cation diffusion facilitator family transporter  42.81 
 
 
340 aa  196  4.0000000000000005e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0067  cation diffusion facilitator transporter family protein  34.01 
 
 
306 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0917  zinc transporter ZitB  40.52 
 
 
312 aa  196  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4444  cation diffusion facilitator family transporter  43.99 
 
 
305 aa  195  6e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0822  zinc transporter ZitB  40.52 
 
 
312 aa  195  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0794  zinc transporter ZitB  40.52 
 
 
312 aa  195  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00320778  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0853  zinc transporter ZitB  40.52 
 
 
312 aa  195  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.106853  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0885  zinc transporter ZitB  40.52 
 
 
312 aa  195  8.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.288903  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0909  cation diffusion facilitator family transporter  37.5 
 
 
327 aa  193  2e-48  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0096451  hitchhiker  0.0000000000204317 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2470  cation diffusion facilitator family transporter  42.96 
 
 
310 aa  194  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.843602  normal  0.377619 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1014  cation diffusion facilitator family transporter  35.89 
 
 
300 aa  194  2e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0149205  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3631  cation diffusion facilitator family transporter  42.76 
 
 
305 aa  194  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.492249  decreased coverage  0.00000526062 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1344  cation diffusion facilitator family transporter  44.88 
 
 
307 aa  192  6e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.123489  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2551  cation diffusion facilitator family transporter  40.36 
 
 
309 aa  192  6e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1284  zinc transporter ZitB  40.94 
 
 
316 aa  192  7e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000026139  hitchhiker  0.00172679 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6162  cation diffusion facilitator family transporter  40.56 
 
 
309 aa  192  8e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13910  cation diffusion facilitator family transporter  40.33 
 
 
303 aa  192  8e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  37.06 
 
 
316 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30010  cation diffusion facilitator family transporter  42.32 
 
 
307 aa  191  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000713084  normal  0.287518 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4276  cation efflux protein  40.29 
 
 
325 aa  190  2e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4118  cation diffusion facilitator family transporter  40.29 
 
 
325 aa  190  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0166  Co/Zn/Cd efflux system component protein  41.5 
 
 
312 aa  189  5e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.157738  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  36.69 
 
 
315 aa  189  7e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0978  cation diffusion facilitator family transporter  39.12 
 
 
317 aa  189  7e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0892489  normal  0.0362171 
 
 
-
 
NC_002978  WD1042  cation efflux family protein  35.62 
 
 
298 aa  188  8e-47  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0815398  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4666  CDF family cation efflux system protein  42.7 
 
 
320 aa  188  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0672  zinc transporter ZitB  41.05 
 
 
313 aa  187  2e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00307439  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1148  cation diffusion facilitator family transporter  39.78 
 
 
340 aa  187  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.280865  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  34.14 
 
 
342 aa  186  4e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  36.33 
 
 
307 aa  185  7e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1806  cation diffusion facilitator family transporter  40.37 
 
 
325 aa  185  8e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1370  cation diffusion facilitator family transporter  36.33 
 
 
333 aa  185  9e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2420  cation diffusion facilitator family transporter  38.49 
 
 
333 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.870744  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4544  cation diffusion facilitator family transporter  42.55 
 
 
356 aa  184  1.0000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.586592 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2050  cation diffusion facilitator family transporter  38.49 
 
 
333 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.347484  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2626  cation diffusion facilitator family transporter  39.26 
 
 
313 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.208162  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1830  cation diffusion facilitator family transporter  34.69 
 
 
320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13063 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0088  cation diffusion facilitator family transporter  32.19 
 
 
300 aa  183  2.0000000000000003e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0328  cation diffusion facilitator family transporter  39.58 
 
 
298 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0610  cation diffusion facilitator family transporter  40.96 
 
 
306 aa  182  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049806 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4582  cation diffusion facilitator family transporter  34.55 
 
 
311 aa  182  5.0000000000000004e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>