88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3378 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_3378  ribonuclease P protein component  100 
 
 		 125 aa  242  1.9999999999999999e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4984  ribonuclease P protein component  48.82 
 
 		 122 aa  99  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31970  ribonuclease P protein component  49.59 
 
 		 122 aa  93.2  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9055  ribonuclease P protein  52.25 
 
 		 109 aa  87.4  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00175664  normal  0.592231 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5095  ribonuclease P protein component  46.03 
 
 		 127 aa  87  8e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3936  ribonuclease P protein component  44.09 
 
 		 136 aa  86.7  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000442123 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6077  ribonuclease P  43.44 
 
 		 119 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0418194  normal  0.134211 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23470  ribonuclease P protein component  46.77 
 
 		 132 aa  82.8  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0829  ribonuclease P  40.32 
 
 		 124 aa  80.1  0.000000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.861038 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5788  ribonuclease P  40.16 
 
 		 118 aa  80.5  0.000000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534341  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0007  ribonuclease P  40.16 
 
 		 118 aa  80.5  0.000000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0873597  normal  0.0618314 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5412  ribonuclease P  40.16 
 
 		 118 aa  80.5  0.000000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4171  ribonuclease P protein component  41.94 
 
 		 136 aa  75.9  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00326173  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3595  ribonuclease P protein component  41.59 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.183825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3116  ribonuclease P protein  41.94 
 
 		 147 aa  73.9  0.0000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134216  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4512  ribonuclease P protein component  48.25 
 
 		 120 aa  73.6  0.0000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00356165 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38050  ribonuclease P protein component  46.67 
 
 		 91 aa  72.8  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5414  ribonuclease P protein component  47.27 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4224  ribonuclease P protein component  50.89 
 
 		 119 aa  71.2  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7099  ribonuclease P protein  55.13 
 
 		 81 aa  68.6  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.260789  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6486  ribonuclease P protein  50.59 
 
 		 89 aa  68.6  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00207284  normal  0.0833987 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13958  ribonuclease P  34.15 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4699  ribonuclease P protein component  52.21 
 
 		 117 aa  64.7  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.259793  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3729  ribonuclease P protein component  47.75 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.468865 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2557  ribonuclease P protein component  50 
 
 		 91 aa  58.2  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000049885  normal  0.280398 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1438  RNase P protein component  32.79 
 
 		 119 aa  56.6  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0006  ribonuclease P protein component  41.11 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0503027 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27030  ribonuclease P protein component  47.06 
 
 		 93 aa  56.2  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39790  ribonuclease P protein component  50.44 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.0000138929  normal  0.561767 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2160  ribonuclease P protein component  45.05 
 
 		 120 aa  52.8  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0454  ribonuclease P  38.61 
 
 		 129 aa  52  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0715455  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4060  ribonuclease P  45.71 
 
 		 116 aa  48.9  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175953  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0081  ribonuclease P  35.87 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.284943 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4137  ribonuclease P protein component  25.69 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0213874  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0641  ribonuclease P protein component  36.71 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116685  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0096  ribonuclease P  37.04 
 
 		 133 aa  47.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0857  ribonuclease P protein component  33.33 
 
 		 113 aa  47  0.00009  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4516  ribonuclease P protein component  44.29 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4497  ribonuclease P protein component  44.29 
 
 		 116 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2949  ribonuclease P protein component  34.92 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000512551  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4360  ribonuclease P protein component  43.06 
 
 		 116 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7340  ribonuclease P protein component  38.71 
 
 		 121 aa  45.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.921062 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4863  ribonuclease P protein component  32.5 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0312  ribonuclease P protein component  36 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2141  ribonuclease P protein component  37.14 
 
 		 130 aa  45.4  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0080  ribonuclease P  37.1 
 
 		 132 aa  45.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1738  ribonuclease P protein component  27.68 
 
 		 116 aa  45.1  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000204064  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0047  ribonuclease P protein component  35.06 
 
 		 135 aa  45.1  0.0004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4151  ribonuclease P  44.29 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  34.25 
 
 		 119 aa  44.3  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  34.25 
 
 		 119 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000560819  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5949  ribonuclease P protein component  37.72 
 
 		 132 aa  44.7  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  34.25 
 
 		 119 aa  44.3  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202449  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3215  ribonuclease P protein component  37 
 
 		 114 aa  44.3  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  34.25 
 
 		 119 aa  44.3  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5638  ribonuclease P  34.25 
 
 		 115 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108517  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  34.25 
 
 		 119 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4960  ribonuclease P protein component  26.09 
 
 		 111 aa  44.3  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123477  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2576  RNase P protein component  30.17 
 
 		 119 aa  43.9  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  31.94 
 
 		 115 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2735  ribonuclease P  33.82 
 
 		 117 aa  44.3  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.178342  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_913  RNase P protein component  33.91 
 
 		 126 aa  44.3  0.0006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000601305  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2792  ribonuclease P  33.82 
 
 		 117 aa  44.3  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.437521  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1022  ribonuclease P  36.84 
 
 		 145 aa  43.9  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.358481  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5614  ribonuclease P  34.25 
 
 		 115 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5321  ribonuclease P  34.25 
 
 		 115 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.852432 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2934  ribonuclease P protein component  42.19 
 
 		 115 aa  43.9  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0069  ribonuclease P protein component  51.22 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0925  ribonuclease P protein component  33.33 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000841875  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0963  ribonuclease P  35.43 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0219  ribonuclease P protein component  35.14 
 
 		 154 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14200  ribonuclease P protein component  36.36 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3433  ribonuclease P  25.23 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000048083  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1042  ribonuclease P protein component  36.52 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00401916  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0332  ribonuclease P protein component  60 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0093  ribonuclease P protein component  37.31 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0641  ribonuclease P protein component  41.51 
 
 		 148 aa  41.6  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.244598  normal  0.489939 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1943  ribonuclease P  31.34 
 
 		 117 aa  41.6  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0018816  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3327  ribonuclease P protein component  34.12 
 
 		 227 aa  42  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.542591  normal  0.0367737 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1060  ribonuclease P protein component  46.67 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.569481  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2721  ribonuclease P protein component  46.67 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0959795 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4027  ribonuclease P  29.17 
 
 		 115 aa  41.2  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246151  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3615  ribonuclease P protein component  46 
 
 		 106 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.250922 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1200  ribonuclease P protein component  39.71 
 
 		 150 aa  40.8  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00390619 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0035  ribonuclease P protein component  41.54 
 
 		 116 aa  40.8  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.816345  normal  0.309207 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0034  ribonuclease P protein component  41.54 
 
 		 116 aa  40.8  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2413  ribonuclease P  34.33 
 
 		 116 aa  40.4  0.009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205817  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5280  ribonuclease P  32.88 
 
 		 115 aa  40  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00507948  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>