More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1388 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1388  oxidoreductase molybdopterin binding protein  100 
 
 
515 aa  983    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1443  oxidoreductase, molybdopterin binding  54.66 
 
 
520 aa  441  9.999999999999999e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.63286  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4544  oxidoreductase molybdopterin binding protein  50.2 
 
 
512 aa  430  1e-119  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3840  oxidoreductase, molybdopterin binding  53.4 
 
 
531 aa  423  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1664  oxidoreductase molybdopterin binding  54.6 
 
 
524 aa  424  1e-117  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.545601  normal  0.282195 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0079  oxidoreductase molybdopterin binding protein  48.72 
 
 
511 aa  417  9.999999999999999e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.256372  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3188  oxidoreductase molybdopterin binding  48.4 
 
 
528 aa  412  1e-114  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3407  oxidoreductase, molybdopterin binding  48.31 
 
 
525 aa  412  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0160  oxidoreductase molybdopterin binding  48 
 
 
531 aa  413  1e-114  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4230  oxidoreductase molybdopterin binding  54.68 
 
 
531 aa  409  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1801  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  49.13 
 
 
512 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.13158  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1848  oxidoreductase, molybdopterin binding  49.13 
 
 
512 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.45213 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1782  oxidoreductase, molybdopterin binding  49.13 
 
 
512 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.133498  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1739  Sulfite oxidase-like protein  49.27 
 
 
546 aa  399  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.316961 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4320  oxidoreductase, molybdopterin binding  49.19 
 
 
505 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1445  oxidoreductase molybdopterin binding  51.51 
 
 
538 aa  399  9.999999999999999e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000237131 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2026  oxidoreductase, molybdopterin binding  50 
 
 
505 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246614  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5094  oxidoreductase molybdopterin binding  48.02 
 
 
570 aa  388  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3761  oxidoreductase molybdopterin binding  49.61 
 
 
523 aa  388  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0396091 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3527  oxidoreductase molybdopterin binding  46.73 
 
 
534 aa  388  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.80252  normal  0.883441 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2651  oxidoreductase molybdopterin binding protein  47.98 
 
 
509 aa  385  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.813391  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0738  Sulfite oxidase-like protein  48.79 
 
 
488 aa  379  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.247764  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0327  oxidoreductase molybdopterin binding  43.94 
 
 
554 aa  370  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5905  oxidoreductase molybdopterin binding protein  47.01 
 
 
508 aa  370  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.767401 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4023  oxidoreductase, molybdopterin binding  49.52 
 
 
521 aa  370  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.351273  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5364  oxidoreductase molybdopterin binding protein  47.45 
 
 
545 aa  363  3e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4265  oxidoreductase molybdopterin binding  44.49 
 
 
542 aa  362  9e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0266604  normal  0.460277 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1771  oxidoreductase molybdopterin binding protein  61.71 
 
 
532 aa  359  7e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0572452  normal  0.0309546 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6733  oxidoreductase molybdopterin binding  51.92 
 
 
608 aa  328  1.0000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4533  oxidoreductase, molybdopterin binding  43.5 
 
 
508 aa  319  6e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.484625  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2426  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  48.09 
 
 
501 aa  272  1e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4789  oxidoreductase molybdopterin binding protein  46.67 
 
 
552 aa  262  8.999999999999999e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0102171  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  36.68 
 
 
501 aa  229  8e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3066  oxidoreductase molybdopterin binding protein  37.83 
 
 
465 aa  184  4.0000000000000006e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.419919  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2513  oxidoreductase molybdopterin binding  39.31 
 
 
528 aa  181  2.9999999999999997e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1764  oxidoreductase molybdopterin binding  34.95 
 
 
505 aa  170  5e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2329  oxidoreductase molybdopterin binding protein  34.02 
 
 
512 aa  168  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1532  oxidoreductase molybdopterin binding  37.1 
 
 
489 aa  165  2.0000000000000002e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.235509  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2351  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  32.26 
 
 
376 aa  122  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2838  twin-arginine translocation pathway signal  34.16 
 
 
426 aa  121  3e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4055  Nitrate reductase (NADH)  33.86 
 
 
414 aa  118  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2672  oxidoreductase molybdopterin binding  31.65 
 
 
405 aa  117  3.9999999999999997e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.125752 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0255  oxidoreductase molybdopterin binding  31.65 
 
 
405 aa  117  3.9999999999999997e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112809  normal  0.0149347 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3394  twin-arginine translocation pathway signal  32.17 
 
 
402 aa  117  6.9999999999999995e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.115416  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3748  oxidoreductase molybdopterin binding  34.2 
 
 
372 aa  115  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8664  oxidoreductase molybdopterin binding  33.44 
 
 
401 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3951  nitrate reductase (NADH)  32.58 
 
 
369 aa  115  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0432  Sulfite oxidase  29.46 
 
 
409 aa  110  5e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.203271 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0938  oxidoreductase molybdopterin binding protein  34.41 
 
 
199 aa  110  6e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.378305  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5388  oxidoreductase molybdopterin binding  31.95 
 
 
403 aa  110  7.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359711  normal  0.947595 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0362  oxidoreductase, molybdopterin binding  37.36 
 
 
200 aa  109  9.000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.659486  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3022  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.31 
 
 
400 aa  108  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2704  oxidoreductase molybdopterin binding  33.02 
 
 
402 aa  108  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8369  oxidoreductase molybdopterin binding  33.02 
 
 
403 aa  108  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0460  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.26 
 
 
415 aa  108  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3339  oxidoreductase molybdopterin binding  33.12 
 
 
406 aa  107  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.617225  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3664  oxidoreductase molybdopterin binding  33.12 
 
 
402 aa  107  6e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.185653  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5267  oxidoreductase molybdopterin binding  31.5 
 
 
407 aa  107  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873576  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2781  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  31.8 
 
 
434 aa  105  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.446362  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2626  Sulfite oxidase  34.22 
 
 
370 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6453  oxidoreductase molybdopterin binding  30.98 
 
 
401 aa  104  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.662727 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0778  oxidoreductase molybdopterin binding  32.11 
 
 
229 aa  104  3e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00214347  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4215  oxidoreductase molybdopterin binding  33.12 
 
 
402 aa  103  7e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.223271 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4894  oxidoreductase molybdopterin binding  28.35 
 
 
369 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.344343 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2981  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.09 
 
 
415 aa  103  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000198483  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8677  oxidoreductase molybdopterin binding  29.11 
 
 
429 aa  102  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12671  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1978  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.39 
 
 
416 aa  101  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.956228  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2692  oxidoreductase, molybdopterin binding  28.64 
 
 
408 aa  101  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.339066  normal  0.961864 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2867  Nitrate reductase (NADH)  27.27 
 
 
431 aa  100  5e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5008  oxidoreductase molybdopterin binding  29.57 
 
 
338 aa  100  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1455  oxidoreductase molybdopterin binding  29.95 
 
 
406 aa  100  7e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431852  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4627  oxidoreductase molybdopterin binding  31.33 
 
 
414 aa  100  9e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4886  putative sulfite oxidase (soxC)  29.23 
 
 
409 aa  99.8  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.592405 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0389  oxidoreductase molybdopterin binding  37.95 
 
 
231 aa  99.8  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1107  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.79 
 
 
207 aa  98.6  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.266904  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4891  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  29.55 
 
 
410 aa  99  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.935481  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6301  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.6 
 
 
400 aa  98.6  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386808  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0686  oxidoreductase molybdopterin binding  28.05 
 
 
369 aa  98.2  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.300119 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3098  sulfite oxidase and related enzyme  28.05 
 
 
451 aa  97.8  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.57715  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0650  oxidoreductase, molybdopterin binding  38.31 
 
 
237 aa  97.4  6e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0972302  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0949  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  33.33 
 
 
412 aa  97.1  7e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.443239  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0361  molybdopterin-binding oxidoreductase  37.35 
 
 
231 aa  97.1  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0686  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.82 
 
 
453 aa  97.1  7e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51607  normal  0.0249066 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1672  oxidoreductase, molybdopterin binding  38.24 
 
 
221 aa  97.1  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.476748  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0643  oxidoreductase molybdopterin binding protein  33.14 
 
 
209 aa  96.7  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1487  oxidoreductase, molybdopterin binding  27.85 
 
 
406 aa  96.7  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0391  oxidoreductase molybdopterin binding  36.75 
 
 
231 aa  95.1  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6027  oxidoreductase molybdopterin binding  27.74 
 
 
369 aa  95.5  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0144452 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4929  oxidoreductase, molybdopterin-binding  27.27 
 
 
414 aa  95.1  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3083  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  30.41 
 
 
417 aa  94.7  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741387  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2682  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  38.27 
 
 
199 aa  93.2  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0237  oxidoreductase molybdopterin binding  29.59 
 
 
189 aa  92.8  1e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.164235  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3913  hypothetical protein  29.03 
 
 
420 aa  92.8  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.44156 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0148  oxidoreductase molybdopterin binding  29.55 
 
 
437 aa  91.7  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3202  LigA protein  28.1 
 
 
428 aa  91.3  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152966  unclonable  0.00000538057 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5892  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.74 
 
 
335 aa  91.3  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3445  cytochrome c class I  28.1 
 
 
428 aa  91.3  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.456547  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4200  oxidoreductase molybdopterin binding  35.09 
 
 
220 aa  90.9  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.483422  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2529  oxidoreductase molybdopterin binding protein  40.27 
 
 
181 aa  90.1  8e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5873  oxidoreductase molybdopterin binding  28.33 
 
 
414 aa  89.7  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.342004  normal  0.20315 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>