More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0471 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0471  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  100 
 
 
283 aa  563  1e-160  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.665178  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2714  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  64.26 
 
 
309 aa  352  4e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07400  NADH dehydrogenase subunit C  73.55 
 
 
253 aa  332  4e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0403286 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3227  NADH dehydrogenase subunit C  74.42 
 
 
240 aa  325  5e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.754321  normal  0.0249404 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0541  NADH dehydrogenase subunit C  72.07 
 
 
239 aa  318  6e-86  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.770394  normal  0.399651 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13168  NADH dehydrogenase subunit C  67.11 
 
 
236 aa  308  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1548  NADH dehydrogenase subunit C  66.67 
 
 
231 aa  293  2e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.559128  normal  0.208156 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1578  NADH dehydrogenase subunit C  66.67 
 
 
231 aa  293  2e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0522  NADH dehydrogenase subunit C  65.2 
 
 
250 aa  293  2e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1602  NADH dehydrogenase subunit C  66.67 
 
 
231 aa  293  2e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.949933  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1883  NADH dehydrogenase subunit C  63.91 
 
 
225 aa  291  7e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4483  NADH dehydrogenase subunit C  66.67 
 
 
226 aa  290  2e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00208368 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0283  NADH (or F420H2) dehydrogenase subunit C  67.27 
 
 
229 aa  285  5e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0399  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  63.16 
 
 
227 aa  283  2.0000000000000002e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2693  NADH dehydrogenase subunit C  62.95 
 
 
252 aa  281  1e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0586  NADH:ubiquinone oxidoreductase 27 kD subunit- like protein  66.98 
 
 
225 aa  277  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7689  NADH dehydrogenase subunit C  60.89 
 
 
235 aa  277  1e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.800892  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4416  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  62.39 
 
 
248 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03180  NADH dehydrogenase subunit C  56.91 
 
 
253 aa  265  7e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.44147 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6680  NADH dehydrogenase subunit C  61.29 
 
 
252 aa  263  2e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4556  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  56.52 
 
 
245 aa  254  8e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4461  NADH dehydrogenase subunit C  60.19 
 
 
245 aa  250  2e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3170  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  59.47 
 
 
236 aa  248  5e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5055  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  58.48 
 
 
246 aa  248  9e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4063  NADH dehydrogenase subunit C  58.33 
 
 
245 aa  247  1e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.109975 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0976  NADH dehydrogenase subunit C  54.84 
 
 
275 aa  240  2e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0540  NADH dehydrogenase subunit C  61.47 
 
 
236 aa  233  3e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.363465  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0269  NADH dehydrogenase subunit C  61.22 
 
 
192 aa  232  5e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.148576  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6092  NADH dehydrogenase subunit C  58.88 
 
 
229 aa  230  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0251678 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1276  NADH (or F420H2) dehydrogenase subunit C  56.76 
 
 
213 aa  230  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.662944  normal  0.334332 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3676  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  46.62 
 
 
174 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00982408 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3081  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  48.82 
 
 
171 aa  118  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.876993  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4086  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  41.35 
 
 
166 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.335829 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1322  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  45.86 
 
 
174 aa  116  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.671955  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3924  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  41.61 
 
 
161 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0146493  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4008  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  40.99 
 
 
161 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6243400000000003e-29 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5798  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  38.18 
 
 
205 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323776  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1314  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  40 
 
 
165 aa  111  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1017  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  43.38 
 
 
219 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4128  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  40.62 
 
 
215 aa  109  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0340  NADH dehydrogenase I, C subunit  38.56 
 
 
162 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00148493  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5100  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  39.02 
 
 
166 aa  108  7.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0890  NADH dehydrogenase subunit C  41.29 
 
 
201 aa  108  8.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.31158  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02211  NADH:ubiquinone oxidoreductase, chain C,D  42.52 
 
 
600 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1371  NADH dehydrogenase I, D subunit  42.52 
 
 
600 aa  108  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0159293  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1814  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  42.52 
 
 
598 aa  107  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.394715  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2440  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  42.52 
 
 
600 aa  108  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3425  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  42.52 
 
 
600 aa  108  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.022536  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3136  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  46.28 
 
 
162 aa  108  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000631094  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02171  hypothetical protein  42.52 
 
 
600 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1366  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  42.52 
 
 
600 aa  108  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2435  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  42.52 
 
 
600 aa  108  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2662  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  42.52 
 
 
600 aa  108  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0464288  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1047  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  46.55 
 
 
172 aa  108  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.634523  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2579  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  42.52 
 
 
600 aa  108  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.144655  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1494  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  40.94 
 
 
599 aa  107  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0962881  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1562  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  42.52 
 
 
598 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.905378  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1456  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  42.52 
 
 
598 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0929  NADH dehydrogenase subunit C  48.48 
 
 
199 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00761919  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0963  NADH dehydrogenase subunit C  46.97 
 
 
199 aa  106  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0785182  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1353  NADH dehydrogenase subunit C  39.26 
 
 
200 aa  105  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4392  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  40.49 
 
 
215 aa  105  8e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.165622  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1212  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  43.31 
 
 
219 aa  105  8e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4631  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  44.19 
 
 
209 aa  105  9e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.247115 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3306  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  42.52 
 
 
598 aa  105  9e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00420635  normal  0.503981 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1083  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  43.31 
 
 
219 aa  105  9e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0768548 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2770  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  40.16 
 
 
599 aa  104  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.393942  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1261  NADH dehydrogenase subunit C  38.65 
 
 
200 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.841588  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2154  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  40.43 
 
 
230 aa  105  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.818422  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7017  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  42.48 
 
 
173 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2058  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  39.49 
 
 
215 aa  104  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.313982 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1542  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  41.84 
 
 
179 aa  103  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3130  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  41.73 
 
 
592 aa  103  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2834  NADH dehydrogenase subunit C  43.65 
 
 
214 aa  102  7e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.156781  normal  0.125217 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4242  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  40.3 
 
 
164 aa  100  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000475487  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1030  NADH dehydrogenase subunit C  45.86 
 
 
200 aa  100  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000284725  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2422  NADH dehydrogenase subunit C  39.47 
 
 
202 aa  100  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3353  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  35.86 
 
 
162 aa  100  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000103894  normal  0.0125346 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0844  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  42.4 
 
 
175 aa  100  4e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2548  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  37.8 
 
 
599 aa  99.8  4e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.257879  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1396  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  39.37 
 
 
599 aa  99.8  4e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.200775  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3633  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  38.93 
 
 
187 aa  100  4e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.61451 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2402  NADH dehydrogenase subunit C  39.07 
 
 
199 aa  99.8  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0037532 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0415  NADH dehydrogenase subunit C  40.52 
 
 
200 aa  99.4  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1301  NADH dehydrogenase subunit C  40.52 
 
 
200 aa  99.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1827  NADH dehydrogenase subunit C  40.52 
 
 
200 aa  99.4  6e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.767422  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1437  NADH dehydrogenase subunit C  40.52 
 
 
200 aa  99.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0585887  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1292  NADH dehydrogenase subunit C  40.52 
 
 
200 aa  99.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0735  NADH dehydrogenase subunit C  40.52 
 
 
200 aa  99.4  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.018373  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1357  NADH dehydrogenase subunit C  41.27 
 
 
200 aa  99.4  6e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.357714  normal  0.0381949 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1132  NADH dehydrogenase subunit C  40.52 
 
 
200 aa  99.4  6e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.304231  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5575  NADH dehydrogenase subunit C  45.11 
 
 
200 aa  99  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00023001  normal  0.249552 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2219  NADH dehydrogenase subunit C  41.61 
 
 
206 aa  99  7e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.534462  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0799  NADH dehydrogenase subunit C  39.47 
 
 
202 aa  99  8e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.557773  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0804  NADH dehydrogenase subunit C  39.47 
 
 
202 aa  99  8e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.215567  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1744  NADH dehydrogenase subunit C  40.94 
 
 
201 aa  99  8e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2271  NADH dehydrogenase subunit C  44.36 
 
 
200 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00136652  normal  0.138518 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1635  NADH dehydrogenase subunit C  44.36 
 
 
200 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00516199  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1380  NADH dehydrogenase I chain C  37.5 
 
 
175 aa  98.2  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0753299  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2247  NADH dehydrogenase subunit C  44.36 
 
 
200 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00797265  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>