More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3298 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3298  nucleotidyl transferase  100 
 
 		 255 aa  513  1.0000000000000001e-145  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.998134 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0492  nucleotidyl transferase  66.1 
 
 		 245 aa  322  5e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021214 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1607  Nucleotidyl transferase  66.53 
 
 		 248 aa  316  2e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0819429  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0204  nucleotidyl transferase  60.43 
 
 		 257 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0627  nucleotidyl transferase  60.26 
 
 		 240 aa  285  7e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.065942  normal  0.378103 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4894  Nucleotidyl transferase  59.66 
 
 		 248 aa  283  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.692515 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0056  nucleotidyl transferase  61.04 
 
 		 240 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4543  nucleotidyl transferase  60.83 
 
 		 250 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0048  nucleotidyl transferase  60.59 
 
 		 241 aa  282  3.0000000000000004e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.413317  normal  0.396027 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0088  putative nucleotidyl transferase family protein  63.01 
 
 		 240 aa  281  7.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.781518  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4430  nucleotidyl transferase  58.2 
 
 		 248 aa  281  8.000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.543814 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4940  Nucleotidyl transferase  58.82 
 
 		 248 aa  280  1e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.291574 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0079  Nucleotidyl transferase  58.9 
 
 		 240 aa  278  5e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.195195  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0385  nucleotidyl transferase  59.66 
 
 		 241 aa  277  9e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.615277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0136  nucleotidyl transferase  58.26 
 
 		 236 aa  269  2.9999999999999997e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0586  nucleotidyl transferase  53.28 
 
 		 250 aa  261  8e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.787562 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0665  nucleotidyl transferase  54.7 
 
 		 241 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.51351 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3436  nucleotidyl transferase  55.79 
 
 		 253 aa  243  3e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.604999  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0159  nucleotidyl transferase  54.08 
 
 		 239 aa  242  3.9999999999999997e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.938482  normal  0.555394 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1999  nucleotidyl transferase  51.72 
 
 		 240 aa  226  2e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00143776  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2678  nucleotidyl transferase  51.06 
 
 		 252 aa  226  3e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2101  nucleotidyltransferase family protein  50.64 
 
 		 239 aa  221  9e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.721567  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0819  nucleotidyl transferase  50.86 
 
 		 243 aa  221  9.999999999999999e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.978036  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2018  nucleotidyltransferase family protein  50.43 
 
 		 232 aa  218  7.999999999999999e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4288  Nucleotidyl transferase  50.21 
 
 		 243 aa  217  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.237933  normal  0.419035 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4851  nucleotidyl transferase  50.65 
 
 		 239 aa  216  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.557988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3579  nucleotidyl transferase  51.07 
 
 		 252 aa  210  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00479956  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3244  nucleotidyl transferase  51.11 
 
 		 243 aa  211  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3961  Nucleotidyl transferase  48.74 
 
 		 243 aa  208  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0053  nucleotidyltransferase protein  47.44 
 
 		 237 aa  205  7e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0084  nucleotidyl transferase  48.65 
 
 		 237 aa  186  2e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.684587 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1297  putative nucleotidyl transferase  44.35 
 
 		 252 aa  185  6e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3436  nucleotidyl transferase  47.66 
 
 		 227 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2796  nucleotidyl transferase  44 
 
 		 223 aa  167  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2953  nucleotidyl transferase  45.22 
 
 		 221 aa  158  7e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.295776  normal  0.0446833 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0176  nucleotidyl transferase  44.78 
 
 		 221 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00476295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1524  nucleotidyltransferase family protein  43.48 
 
 		 221 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0834784  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4064  nucleotidyl transferase  41.74 
 
 		 226 aa  147  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.168419 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0963  nucleotidyl transferase  43.23 
 
 		 244 aa  142  4e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.168083  hitchhiker  0.00146596 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2844  nucleotidyl transferase  37.23 
 
 		 226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.55388 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2300  Nucleotidyl transferase  38.3 
 
 		 230 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.706405  normal  0.0677947 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0197  nucleotidyl transferase  39.74 
 
 		 223 aa  125  7e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0927184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5130  nucleotidyl transferase  39.22 
 
 		 223 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2073  mannose-1-phosphate guanyltransferase  33.48 
 
 		 219 aa  122  7e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.403503  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0440  nucleotidyl transferase  37.18 
 
 		 223 aa  122  8e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.792142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0915  nucleotidyl transferase  39.66 
 
 		 222 aa  121  9e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.177826  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0406  nucleotidyl transferase  37.18 
 
 		 223 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0109  nucleotidyl transferase family protein  33.48 
 
 		 219 aa  121  9.999999999999999e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00238886  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07790  putative nucleotidyl transferase  40.26 
 
 		 224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0225083 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3074  nucleotidyl transferase  36.82 
 
 		 232 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0565  nucleotidyl transferase  39.56 
 
 		 222 aa  116  3e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0437  nucleotidyl transferase  36.32 
 
 		 223 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0741  putative nucleotidyl transferase  38.98 
 
 		 224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.115145  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4796  nucleotidyl transferase  35.62 
 
 		 223 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.814441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2641  Nucleotidyl transferase  36.48 
 
 		 229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.782296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0994  nucleotidyl transferase  34.67 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.65594  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3032  nucleotidyltransferase family protein  36.48 
 
 		 229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0497  Nucleotidyl transferase  36.21 
 
 		 232 aa  109  4.0000000000000004e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.756206  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0969  nucleotidyl transferase  35.29 
 
 		 229 aa  109  5e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0165491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0867  nucleotidyl transferase  33.48 
 
 		 222 aa  108  6e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0335423  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3634  nucleotidyltransferase family protein  35.11 
 
 		 226 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4008  nucleotidyl transferase  36.75 
 
 		 223 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3204  nucleotidyl transferase  35.32 
 
 		 221 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0602858  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0599  nucleotidyltransferase family protein  37 
 
 		 232 aa  107  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2814  nucleotidyl transferase  35 
 
 		 226 aa  107  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.164974  normal  0.604361 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1652  nucleotidyl transferase  33.48 
 
 		 232 aa  107  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3110  nucleotidyl transferase  35.17 
 
 		 222 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.133152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3307  Nucleotidyl transferase  35.4 
 
 		 225 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.276059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2073  nucleotidyl transferase  31.88 
 
 		 220 aa  107  3e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1019  nucleotidyl transferase  36.28 
 
 		 229 aa  106  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.176753  normal  0.0292468 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46780  nucleotidyl transferase  39.04 
 
 		 222 aa  105  5e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0263  Nucleotidyl transferase  30.7 
 
 		 310 aa  105  7e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3512  nucleotidyl transferase  34.67 
 
 		 228 aa  104  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0982  nucleotidyl transferase  34.96 
 
 		 225 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0968395  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2007  mannose-1-phosphate guanylyltransferase, putative  33.48 
 
 		 324 aa  105  1e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2147  nucleotidyl transferase  35.47 
 
 		 221 aa  105  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1051  nucleotidyl transferase  33.61 
 
 		 225 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00300889  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0348  hypothetical protein  30.3 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4622  nucleotidyl transferase  34.75 
 
 		 240 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0978754  normal  0.426238 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0884  nucleotidyl transferase  33.33 
 
 		 249 aa  103  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000795934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0127  nucleotidyl transferase  34.17 
 
 		 234 aa  103  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3661  nucleotidyl transferase  36.12 
 
 		 223 aa  103  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3416  nucleotidyl transferase  29.08 
 
 		 250 aa  103  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.307515  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0373  hypothetical protein  31.9 
 
 		 220 aa  102  4e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0234  Nucleotidyl transferase  32 
 
 		 319 aa  102  4e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1018  nucleotidyl transferase  36.16 
 
 		 228 aa  102  5e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.352994  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0742  transaldolase AB  35.5 
 
 		 230 aa  102  5e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1084  nucleotidyl transferase  34.51 
 
 		 225 aa  102  5e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.166383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2143  putative guanyltransferase  31.97 
 
 		 240 aa  101  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.187528  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0910  nucleotidyl transferase  33.47 
 
 		 222 aa  98.6  8e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00048093  normal  0.372808 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1919  Nucleotidyl transferase  33.48 
 
 		 303 aa  98.6  9e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134563 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0193  mannose-1-phosphate guanylyltransferase, putative  33.03 
 
 		 315 aa  97.8  1e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2883  nucleotidyl transferase  32.93 
 
 		 239 aa  98.2  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000245528  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0937  nucleotidyl transferase  35.89 
 
 		 272 aa  97.8  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0204  nucleotidyl transferase  30.49 
 
 		 311 aa  98.2  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6040  nucleotidyl transferase  35.78 
 
 		 239 aa  97.1  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1752  nucleotidyl transferase  34.02 
 
 		 251 aa  97.1  3e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000589238 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3317  Nucleotidyl transferase  32.5 
 
 		 243 aa  96.3  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138857  normal  0.937142 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4057  nucleotidyl transferase  33.06 
 
 		 245 aa  95.5  7e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0586  nucleotidyl transferase  35.78 
 
 		 240 aa  95.1  9e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>