234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3068 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3068  flavin reductase domain-containing protein  100 
 
 
176 aa  364  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.441099 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1916  putative flavin reductase-like protein  75.14 
 
 
177 aa  289  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0609748  normal  0.257395 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3722  flavin reductase domain protein FMN-binding  71.43 
 
 
176 aa  276  1e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0423931 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0519  flavin reductase domain-containing protein  70.29 
 
 
176 aa  267  5e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.348159  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0862  flavin reductase-like, FMN-binding  65.52 
 
 
178 aa  253  1.0000000000000001e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374228  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40150  Flavin reductase-like protein  61.85 
 
 
177 aa  238  2.9999999999999997e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.710187  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1925  flavin reductase-like protein  60.34 
 
 
178 aa  223  1e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.802506 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0590  hypothetical protein  52.57 
 
 
185 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.237388 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5217  flavin reductase domain-containing protein  50.86 
 
 
182 aa  192  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0124  flavin reductase domain protein FMN-binding  44.25 
 
 
186 aa  185  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3753  flavin reductase-like, FMN-binding  45.83 
 
 
186 aa  181  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.722732  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1944  flavin reductase domain protein FMN-binding  48.33 
 
 
180 aa  177  8e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.334773  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2510  flavin reductase domain protein FMN-binding  46.78 
 
 
186 aa  174  4e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.365491  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3733  hypothetical protein  54.78 
 
 
160 aa  173  9e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3128  flavin reductase domain-containing protein  47.06 
 
 
185 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7416  hypothetical protein  45.83 
 
 
188 aa  171  6.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5713  flavin reductase domain protein FMN-binding  44.44 
 
 
189 aa  170  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.483715  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2664  flavin reductase domain protein FMN-binding  49.11 
 
 
180 aa  167  7e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3226  flavin reductase domain protein FMN-binding  46.06 
 
 
185 aa  167  7e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.352328  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2498  flavin reductase domain-containing protein  45.86 
 
 
180 aa  167  8e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.198101  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1187  hypothetical protein  47.43 
 
 
180 aa  166  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1062  flavin reductase domain-containing protein  47.22 
 
 
180 aa  165  2.9999999999999998e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1739  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.43 
 
 
180 aa  156  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0524  hypothetical protein  39.29 
 
 
184 aa  152  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000000440007  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1600  hypothetical protein  39.43 
 
 
185 aa  135  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2046  hypothetical protein  39.34 
 
 
194 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.179971  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2978  flavin reductase-like, FMN-binding  32.8 
 
 
205 aa  114  6e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1289  flavin reductase domain protein FMN-binding  46.43 
 
 
123 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1145  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  36.67 
 
 
197 aa  111  5e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4083  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.33 
 
 
225 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.575581 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3970  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.33 
 
 
193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.169391  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1222  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.35 
 
 
215 aa  104  7e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.996876  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4765  flavin reductase-like, FMN-binding  32.46 
 
 
199 aa  103  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.119665 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2083  flavin reductase-like, FMN-binding  32.62 
 
 
208 aa  103  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2839  flavin reductase-like, FMN-binding  32.96 
 
 
202 aa  101  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0382  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  37.23 
 
 
160 aa  94.7  6e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.610168  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2072  flavin reductase domain-containing protein  33.15 
 
 
190 aa  94.7  6e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7131  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.89 
 
 
194 aa  93.6  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2225  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.69 
 
 
195 aa  93.2  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0249  putative flavin reductase  29.65 
 
 
195 aa  92  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.688531  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1327  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.08 
 
 
192 aa  91.7  5e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.646818  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0980  flavin reductase domain-containing protein  35.83 
 
 
194 aa  91.7  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2040  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.65 
 
 
186 aa  88.2  5e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.228084  hitchhiker  0.0000000489831 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2701  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.51 
 
 
189 aa  85.1  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4078  flavin reductase domain-containing protein  28.18 
 
 
204 aa  85.1  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01420  hypothetical protein  30.73 
 
 
189 aa  84.3  8e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1643  flavin reductase domain-containing protein  30.73 
 
 
189 aa  84.3  8e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01432  hypothetical protein  30.73 
 
 
189 aa  84.3  8e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1546  flavin reductase domain-containing protein  30.9 
 
 
189 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.917994  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2194  flavin reductase domain-containing protein  30.73 
 
 
189 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0743  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.04 
 
 
185 aa  82  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1712  flavin reductase domain-containing protein  30.51 
 
 
189 aa  82.4  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.190889  normal  0.0473113 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2185  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  30.9 
 
 
189 aa  81.6  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00717772  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0805  flavin reductase-like, FMN-binding  34.07 
 
 
188 aa  82  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2155  flavin reductase domain-containing protein  30 
 
 
192 aa  80.9  0.000000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0457399 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3881  flavin reductase domain-containing protein  32.35 
 
 
209 aa  80.1  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0014  flavin reductase domain-containing protein  34.35 
 
 
189 aa  76.6  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0343  flavin reductase-like, FMN-binding  29.46 
 
 
200 aa  76.3  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.37872  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2311  flavin reductase domain-containing protein  28.4 
 
 
180 aa  74.7  0.0000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.833881  hitchhiker  0.000888087 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1144  flavin reductase-like, FMN-binding  34.56 
 
 
189 aa  74.7  0.0000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.467484  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0126  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.31 
 
 
194 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2781  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  27.45 
 
 
167 aa  72.8  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000373643  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0347  flavin reductase domain-containing protein  30.77 
 
 
191 aa  72.4  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.643208  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0720  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.93 
 
 
195 aa  71.2  0.000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3891  flavin reductase domain-containing protein  25.95 
 
 
194 aa  71.2  0.000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824714  normal  0.0240386 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2846  flavin reductase domain-containing protein  33.08 
 
 
200 aa  70.9  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000500824  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1998  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  27.62 
 
 
201 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.172615  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1232  flavin reductase domain protein FMN-binding  28 
 
 
215 aa  70.5  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1270  flavin reductase domain-containing protein  27.46 
 
 
181 aa  70.5  0.00000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.285703  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1850  hypothetical protein  26.06 
 
 
180 aa  70.1  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.147622 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0699  hypothetical protein  27.62 
 
 
201 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0606  flavin reductase family protein  27.62 
 
 
201 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3349  flavoredoxin Flr  29.92 
 
 
188 aa  69.7  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0445888 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0078  flavoredoxin  30.14 
 
 
189 aa  69.7  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00025705  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0883  flavin reductase-like, FMN-binding  27.22 
 
 
196 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.519156  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1931  flavin reductase domain-containing protein  27.68 
 
 
197 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0605182 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1343  flavin reductase domain-containing protein  26.67 
 
 
196 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0386506 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1365  flavin reductase domain-containing protein  27.22 
 
 
196 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3444  flavin reductase domain-containing protein  28.8 
 
 
216 aa  69.7  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280033  unclonable  0.00000709652 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2549  flavin reductase domain-containing protein  28.24 
 
 
190 aa  69.7  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.355058  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3486  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.77 
 
 
192 aa  69.7  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0520  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.63 
 
 
189 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4508  flavin reductase-like, FMN-binding  27.22 
 
 
194 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.372543 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1443  flavin reductase-like, FMN-binding  29.63 
 
 
189 aa  69.3  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2210  flavin reductase domain-containing protein  29.93 
 
 
189 aa  69.3  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.09 
 
 
195 aa  68.9  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1242  flavin reductase domain-containing protein  26.67 
 
 
192 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.877507  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4577  flavin reductase domain-containing protein  26.32 
 
 
189 aa  68.6  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0359  flavin reductase domain-containing protein  29.37 
 
 
195 aa  68.6  0.00000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184245 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1524  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.48 
 
 
215 aa  68.2  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0687  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.46 
 
 
192 aa  67  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0642  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.66 
 
 
190 aa  66.2  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0563737  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02270  conserved protein of DIM6/NTAB family  27.14 
 
 
168 aa  66.2  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.759277  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0626  flavin reductase domain-containing protein  25.97 
 
 
198 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0401  flavin reductase domain-containing protein  27.54 
 
 
186 aa  66.6  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.181273 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1661  flavoredoxin  29.2 
 
 
192 aa  65.9  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.600705  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1399  flavin reductase, putative  29.2 
 
 
192 aa  65.9  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0187374  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2393  flavin reductase-like  26.76 
 
 
194 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.791312  normal  0.804831 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1050  hypothetical protein  32.09 
 
 
191 aa  64.7  0.0000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1141  flavin reductase domain-containing protein  29.01 
 
 
183 aa  64.7  0.0000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.494396  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>