39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2034 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_2034  outer membrane protein  100 
 
 		 465 aa  928    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.549347  normal  0.451307 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1524  outer membrane protein  71.24 
 
 		 777 aa  600  1e-170  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.312083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4342  outer membrane protein  69.6 
 
 		 790 aa  593  1e-168  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.302573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4139  outer membrane protein  67.74 
 
 		 764 aa  578  1e-164  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.609816  normal  0.559542 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1978  outer membrane protein  68.63 
 
 		 770 aa  579  1e-164  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.206942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1980  outer membrane protein  67.17 
 
 		 768 aa  568  1e-161  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1357  outer membrane protein  64.52 
 
 		 4830 aa  534  1e-150  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.381537 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1976  outer membrane protein  63.56 
 
 		 1196 aa  533  1e-150  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.839593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4143  outer membrane protein  64.01 
 
 		 3864 aa  531  1e-149  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1130  hypothetical protein  64.07 
 
 		 768 aa  526  1e-148  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.541884 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2587  outer membrane protein  63.18 
 
 		 889 aa  524  1e-147  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00407649 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0378  outer membrane protein  62.53 
 
 		 860 aa  520  1e-146  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.906993  normal  0.228365 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4987  outer membrane protein  64.9 
 
 		 763 aa  506  9.999999999999999e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4145  hypothetical protein  63.85 
 
 		 756 aa  505  9.999999999999999e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.686732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3205  hypothetical protein  59.91 
 
 		 873 aa  479  1e-134  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1974  hypothetical protein  59.09 
 
 		 7434 aa  472  1e-132  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4144  hypothetical protein  58.64 
 
 		 781 aa  474  1e-132  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.612931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4141  hypothetical protein  58.76 
 
 		 819 aa  466  9.999999999999999e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.166079  normal  0.580525 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3203  outer membrane protein  78.33 
 
 		 954 aa  307  3e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4344  hypothetical protein  66.52 
 
 		 846 aa  296  7e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000873034  normal  0.549716 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2038  outer membrane protein  72.28 
 
 		 479 aa  286  5.999999999999999e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.476107 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4997  outer membrane protein  40.08 
 
 		 4428 aa  271  2e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3607  hypothetical protein  88.97 
 
 		 145 aa  250  4e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.615518  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4242  outer membrane protein  43.33 
 
 		 3340 aa  238  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2861  outer membrane protein  43.32 
 
 		 1641 aa  231  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4431  outer membrane protein  43.37 
 
 		 2796 aa  225  1e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.876357  normal  0.690174 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3608  hypothetical protein  50.44 
 
 		 918 aa  191  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.886331  normal  0.889402 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4433  outer membrane protein  47.67 
 
 		 1099 aa  154  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.200125 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0160  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  45.13 
 
 		 2156 aa  77  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0675  Pyrrolo-quinoline quinone  42.86 
 
 		 3066 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895028 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1919  hypothetical protein  42.48 
 
 		 1526 aa  73.2  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.369591  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2273  FG-GAP repeat protein  37.8 
 
 		 1827 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  45.13 
 
 		 5442 aa  64.3  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4328  cadherin domain-containing protein  37.72 
 
 		 2193 aa  56.6  0.0000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.859375  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  36.3 
 
 		 2768 aa  53.9  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  38.74 
 
 		 2927 aa  53.1  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1733  hypothetical protein  28.29 
 
 		 746 aa  49.3  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.658961  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0529  hypothetical protein  38.78 
 
 		 4697 aa  48.1  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1994  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1321 aa  47.4  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0311677  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>