138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4441 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4441  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  100 
 
 		 374 aa  765    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1347  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  56.79 
 
 		 414 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2318  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  54.4 
 
 		 437 aa  408  1e-113  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.537187  hitchhiker  0.0010338 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1669  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  45.38 
 
 		 642 aa  306  4.0000000000000004e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2084  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  39.11 
 
 		 499 aa  259  4e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0824261 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0917  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  37.17 
 
 		 431 aa  248  8e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0498  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  36.39 
 
 		 404 aa  237  3e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1883  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  35.97 
 
 		 413 aa  231  2e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3005  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  35.03 
 
 		 415 aa  210  3e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1752  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  36.69 
 
 		 375 aa  179  1e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3104  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.33 
 
 		 409 aa  125  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0370  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.48 
 
 		 365 aa  106  5e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3013  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  38.16 
 
 		 442 aa  95.1  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.411366  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1379  hypothetical protein  30.46 
 
 		 321 aa  91.7  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000144326  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1582  putative periplasmic protein  33.16 
 
 		 322 aa  88.6  2e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2204  hypothetical protein  28.88 
 
 		 466 aa  87  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1470  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.21 
 
 		 432 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0922  putative periplasmic protein  32.07 
 
 		 321 aa  84  0.000000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000017161  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2461  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.39 
 
 		 304 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0181605 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0097  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.68 
 
 		 822 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0873  60 kDa chaperonin (protein Cpn60; groEL protein)  30.43 
 
 		 321 aa  79  0.0000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0424  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.98 
 
 		 429 aa  73.9  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.388514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0906  hypothetical protein  28.8 
 
 		 325 aa  70.9  0.00000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000558879  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0985  hypothetical protein  28.8 
 
 		 325 aa  70.9  0.00000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0915  hypothetical protein  28.8 
 
 		 325 aa  70.9  0.00000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000355062  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1135  hypothetical protein  29.5 
 
 		 323 aa  63.2  0.000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2505  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.67 
 
 		 171 aa  62  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.384075  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2998  hypothetical protein  38 
 
 		 175 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2912  hypothetical protein  40 
 
 		 175 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3411  hypothetical protein  31.85 
 
 		 167 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.69027 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06766  hypothetical protein  30 
 
 		 146 aa  61.2  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3104  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.33 
 
 		 175 aa  60.8  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1056  hypothetical protein  33.58 
 
 		 184 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1451  hypothetical protein  33.58 
 
 		 184 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.239641 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3390  hypothetical protein  30.97 
 
 		 157 aa  60.1  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4270  hypothetical protein  33.58 
 
 		 184 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0547672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3062  hypothetical protein  35.86 
 
 		 158 aa  58.9  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00586635  hitchhiker  0.0000428896 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3246  hypothetical protein  31.13 
 
 		 160 aa  57.8  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1461  hypothetical protein  32.84 
 
 		 208 aa  57  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15840  hypothetical protein  31.65 
 
 		 166 aa  57  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0326425 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1820  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.65 
 
 		 179 aa  57  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1362  hypothetical protein  31.65 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0818746  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1113  hypothetical protein  30.94 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4168  hypothetical protein  32.54 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.620785 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1271  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  32.09 
 
 		 187 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1008  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  29.81 
 
 		 171 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.471796  normal  0.572357 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1849  hypothetical protein  31.97 
 
 		 166 aa  55.1  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.414472  normal  0.218406 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000854  hypothetical protein  29.37 
 
 		 153 aa  54.7  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39640  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG-related protein  32.37 
 
 		 168 aa  54.7  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4043  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.85 
 
 		 169 aa  53.5  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0840  hypothetical protein  29.45 
 
 		 187 aa  52.4  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0272  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  28.57 
 
 		 160 aa  52  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0839501 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3509  hypothetical protein  35.48 
 
 		 171 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3771  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  30.14 
 
 		 174 aa  50.4  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.18169 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3666  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.48 
 
 		 171 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2376  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  26.88 
 
 		 181 aa  50.4  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2420  hypothetical protein  28.99 
 
 		 186 aa  50.4  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1556  hypothetical protein  27.22 
 
 		 171 aa  50.4  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2287  hypothetical protein  28.99 
 
 		 171 aa  50.4  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.147762  normal  0.376498 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0121  hypothetical protein  30.82 
 
 		 185 aa  50.1  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6003  hypothetical protein  31.08 
 
 		 179 aa  50.1  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.19604 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0707  hypothetical protein  31.61 
 
 		 178 aa  50.1  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2210  hypothetical protein  28.99 
 
 		 171 aa  50.1  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.40768 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2183  hypothetical protein  28.99 
 
 		 171 aa  48.9  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2896  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  29.5 
 
 		 162 aa  48.5  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.805979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1589  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.57 
 
 		 167 aa  48.1  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0610  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.68 
 
 		 388 aa  48.1  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2578  hypothetical protein  26.57 
 
 		 171 aa  48.5  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.633059  normal  0.401653 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2113  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  30.77 
 
 		 165 aa  48.9  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3148  hypothetical protein  30.82 
 
 		 182 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0696  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.1 
 
 		 244 aa  48.9  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3597  hypothetical protein  34.41 
 
 		 171 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0935961  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1201  hypothetical protein  27.46 
 
 		 166 aa  47.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.98306  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2862  hypothetical protein  27.46 
 
 		 164 aa  47.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2639  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.76 
 
 		 164 aa  47.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.374361  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4083  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.78 
 
 		 331 aa  47.4  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0734  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.04 
 
 		 247 aa  47.4  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1490  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.45 
 
 		 194 aa  47  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2505  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  28.91 
 
 		 175 aa  47  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.84705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4074  hypothetical protein  27.11 
 
 		 171 aa  46.6  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000682616  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0044  hypothetical protein  25.15 
 
 		 188 aa  46.6  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.421013  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2067  hypothetical protein  28.91 
 
 		 162 aa  45.4  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1823  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.25 
 
 		 188 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.110296  normal  0.290144 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1978  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.33 
 
 		 223 aa  45.8  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0041  putative lipoprotein  29.36 
 
 		 247 aa  45.8  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2528  hypothetical protein  29.25 
 
 		 188 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0926  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.51 
 
 		 249 aa  45.8  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.7057  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0524  hypothetical protein  29.88 
 
 		 180 aa  45.4  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.31158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2569  hypothetical protein  29.73 
 
 		 481 aa  45.8  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2521  hypothetical protein  29.25 
 
 		 188 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2641  hypothetical protein  29.25 
 
 		 188 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.749921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0342  hypothetical protein  29.37 
 
 		 246 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.360607 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0346  hypothetical protein  29.37 
 
 		 246 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2767  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.67 
 
 		 179 aa  45.8  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0972774  normal  0.277101 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0351  hypothetical protein  29.37 
 
 		 246 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.786084 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0353  hypothetical protein  29.37 
 
 		 246 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321045 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0361  hypothetical protein  29.37 
 
 		 246 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.877159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0200  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  35.57 
 
 		 172 aa  44.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.574242  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2159  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  24.11 
 
 		 337 aa  45.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7151  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.25 
 
 		 179 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>