107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1379 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1379  hypothetical protein  100 
 
 		 321 aa  655    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000144326  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0370  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.14 
 
 		 365 aa  241  1e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0915  hypothetical protein  39.2 
 
 		 325 aa  226  3e-58  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000355062  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0985  hypothetical protein  39.2 
 
 		 325 aa  226  4e-58  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0906  hypothetical protein  38.73 
 
 		 325 aa  218  7.999999999999999e-56  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000558879  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1135  hypothetical protein  38.6 
 
 		 323 aa  208  1e-52  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1582  putative periplasmic protein  35.26 
 
 		 322 aa  204  2e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0922  putative periplasmic protein  36.48 
 
 		 321 aa  201  9.999999999999999e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000017161  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0873  60 kDa chaperonin (protein Cpn60; groEL protein)  35.19 
 
 		 321 aa  191  1e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0498  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  29.47 
 
 		 404 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2461  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.07 
 
 		 304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0181605 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1883  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  30.21 
 
 		 413 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2318  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  31.13 
 
 		 437 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.537187  hitchhiker  0.0010338 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0917  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  28.14 
 
 		 431 aa  110  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3013  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.38 
 
 		 442 aa  110  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.411366  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0424  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.32 
 
 		 429 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.388514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1347  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  29.96 
 
 		 414 aa  105  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2204  hypothetical protein  32.22 
 
 		 466 aa  98.6  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1470  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  25 
 
 		 432 aa  96.7  5e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4441  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.69 
 
 		 374 aa  94.4  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2084  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  28.72 
 
 		 499 aa  90.1  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0824261 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1669  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.57 
 
 		 642 aa  89.7  6e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1752  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  32.52 
 
 		 375 aa  88.2  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3005  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  27.23 
 
 		 415 aa  88.2  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0097  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.07 
 
 		 822 aa  84  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3104  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.36 
 
 		 409 aa  75.9  0.0000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1211  2-dehydro-3-deoxyphosphooctonate aldolase  30.17 
 
 		 238 aa  55.1  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0582  protein of unknown function DUF949  35.24 
 
 		 244 aa  55.5  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.380158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7577  transcriptional regulatory protein  29.91 
 
 		 494 aa  54.3  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.92103  normal  0.550503 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0527  hypothetical protein  34.52 
 
 		 477 aa  53.5  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.163811 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1820  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.29 
 
 		 179 aa  53.5  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0510  protein of unknown function DUF949  30.77 
 
 		 478 aa  53.9  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2569  hypothetical protein  28.24 
 
 		 481 aa  53.1  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0391  hypothetical protein  30.77 
 
 		 492 aa  52.8  0.000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.672589 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0298  hypothetical protein  29.91 
 
 		 487 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.187511 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0166  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.95 
 
 		 449 aa  52  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0531  hypothetical protein  29.91 
 
 		 485 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2528  hypothetical protein  33.57 
 
 		 188 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2521  hypothetical protein  33.57 
 
 		 188 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2641  hypothetical protein  33.57 
 
 		 188 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.749921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1823  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.57 
 
 		 188 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.110296  normal  0.290144 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0486  hypothetical protein  33.33 
 
 		 502 aa  49.7  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.511704  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2505  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  31.15 
 
 		 175 aa  49.7  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.84705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1008  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  35.64 
 
 		 171 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.471796  normal  0.572357 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0840  hypothetical protein  31.94 
 
 		 187 aa  49.3  0.00008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2917  hypothetical protein  27.12 
 
 		 545 aa  49.3  0.00009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.183325 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3632  2-dehydro-3-deoxyphosphooctonate aldolase  26.46 
 
 		 239 aa  49.3  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1589  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.61 
 
 		 167 aa  48.9  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2767  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.65 
 
 		 179 aa  49.3  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0972774  normal  0.277101 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1271  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  34.26 
 
 		 187 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15840  hypothetical protein  35.19 
 
 		 166 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0326425 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3411  hypothetical protein  35.19 
 
 		 167 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.69027 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1362  hypothetical protein  35.19 
 
 		 166 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0818746  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1046  hypothetical protein  28.89 
 
 		 397 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0071  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.36 
 
 		 192 aa  48.1  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.867511  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3893  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.85 
 
 		 408 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00297495 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2183  hypothetical protein  31.43 
 
 		 171 aa  47.8  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3390  hypothetical protein  30.32 
 
 		 157 aa  47.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0649  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  25.83 
 
 		 209 aa  47.4  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3464  2-dehydro-3-deoxyphosphooctonate aldolase  27.27 
 
 		 239 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1201  hypothetical protein  30.83 
 
 		 166 aa  47  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.98306  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3600  protein of unknown function DUF949  30.85 
 
 		 409 aa  47.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2862  hypothetical protein  30.83 
 
 		 164 aa  47  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1094  protein of unknown function DUF949  28.33 
 
 		 357 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0542977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2282  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.17 
 
 		 171 aa  46.6  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.273788  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1461  hypothetical protein  33.33 
 
 		 208 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4971  protein of unknown function DUF949  29.55 
 
 		 400 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.778266  normal  0.0128256 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4457  hypothetical protein  29.55 
 
 		 396 aa  46.2  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.821802 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3246  hypothetical protein  33.08 
 
 		 160 aa  46.2  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4921  hypothetical protein  29.55 
 
 		 406 aa  46.2  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.596783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3494  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.52 
 
 		 166 aa  45.8  0.0009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.903579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2113  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  36.36 
 
 		 165 aa  45.8  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3169  protein of unknown function DUF949  24.79 
 
 		 415 aa  45.8  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4058  hypothetical protein  32.97 
 
 		 445 aa  45.8  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0926  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.53 
 
 		 249 aa  45.4  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.7057  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1451  hypothetical protein  36.45 
 
 		 184 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.239641 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2505  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.96 
 
 		 171 aa  45.1  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.384075  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2420  hypothetical protein  30.71 
 
 		 186 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0571  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.66 
 
 		 334 aa  44.3  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0044  hypothetical protein  32.29 
 
 		 188 aa  44.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.421013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0041  putative lipoprotein  28.89 
 
 		 247 aa  45.1  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4270  hypothetical protein  33.64 
 
 		 184 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0547672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4733  hypothetical protein  32.14 
 
 		 462 aa  44.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1056  hypothetical protein  33.64 
 
 		 184 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4168  hypothetical protein  33.64 
 
 		 184 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.620785 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4119  protein of unknown function DUF949  27.35 
 
 		 355 aa  44.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5898  hypothetical protein  29.27 
 
 		 378 aa  45.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.494834  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1472  secretion system protein A  24.18 
 
 		 243 aa  44.3  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1511  secretion system protein A  24.18 
 
 		 243 aa  44.3  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0272  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  33.71 
 
 		 160 aa  44.3  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0839501 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2376  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  33.94 
 
 		 181 aa  44.3  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2287  hypothetical protein  30.71 
 
 		 171 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.147762  normal  0.376498 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1490  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.29 
 
 		 194 aa  44.3  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5272  protein of unknown function DUF949  32.14 
 
 		 475 aa  44.3  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.910314 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5200  hypothetical protein  32.14 
 
 		 462 aa  44.3  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.86249 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4595  hypothetical protein  29.76 
 
 		 524 aa  44.3  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3771  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  26.15 
 
 		 174 aa  43.9  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.18169 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2210  hypothetical protein  30.71 
 
 		 171 aa  43.9  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.40768 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2578  hypothetical protein  34.07 
 
 		 171 aa  43.5  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.633059  normal  0.401653 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0734  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  38.89 
 
 		 247 aa  43.5  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>