140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_0906 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0985  hypothetical protein  99.08 
 
 
325 aa  657    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0915  hypothetical protein  99.38 
 
 
325 aa  658    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000355062  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0906  hypothetical protein  100 
 
 
325 aa  660    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000558879  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1135  hypothetical protein  64 
 
 
323 aa  438  9.999999999999999e-123  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0922  putative periplasmic protein  46.91 
 
 
321 aa  312  5.999999999999999e-84  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000017161  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0873  60 kDa chaperonin (protein Cpn60; groEL protein)  48 
 
 
321 aa  308  6.999999999999999e-83  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1582  putative periplasmic protein  47.38 
 
 
322 aa  306  3e-82  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0370  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.32 
 
 
365 aa  242  7e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1379  hypothetical protein  38.73 
 
 
321 aa  211  1e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000144326  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2461  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.04 
 
 
304 aa  105  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0181605 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0498  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  30.83 
 
 
404 aa  103  4e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410538  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2318  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  31.87 
 
 
437 aa  93.2  6e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.537187  hitchhiker  0.0010338 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0917  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  30.94 
 
 
431 aa  90.9  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1883  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  29.41 
 
 
413 aa  90.9  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1470  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.57 
 
 
432 aa  89.7  6e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0424  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.38 
 
 
429 aa  89.4  8e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.388514  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3013  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.14 
 
 
442 aa  88.2  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.411366  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1347  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  28.49 
 
 
414 aa  86.3  7e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3104  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.64 
 
 
409 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0097  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.63 
 
 
822 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2084  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  36.05 
 
 
499 aa  76.6  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0824261 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2204  hypothetical protein  28.49 
 
 
466 aa  75.5  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1752  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  37.8 
 
 
375 aa  70.9  0.00000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4441  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.8 
 
 
374 aa  70.9  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1669  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.66 
 
 
642 aa  67.8  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3494  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37 
 
 
166 aa  63.9  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.903579  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3005  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  25.24 
 
 
415 aa  57.8  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1046  hypothetical protein  31.58 
 
 
397 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3441  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.78 
 
 
244 aa  58.2  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2569  hypothetical protein  46.77 
 
 
481 aa  56.6  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0734  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.51 
 
 
247 aa  56.2  0.0000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7577  transcriptional regulatory protein  34.88 
 
 
494 aa  56.2  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.92103  normal  0.550503 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0527  hypothetical protein  33.71 
 
 
477 aa  55.8  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.163811 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0372  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.33 
 
 
247 aa  55.8  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.364004  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0926  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.8 
 
 
249 aa  54.7  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.7057  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0391  hypothetical protein  34.78 
 
 
492 aa  54.7  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.672589 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3294  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.76 
 
 
244 aa  54.3  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0531  hypothetical protein  34.88 
 
 
485 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0298  hypothetical protein  34.88 
 
 
487 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.187511 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0486  hypothetical protein  37.04 
 
 
502 aa  54.7  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.511704  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3169  protein of unknown function DUF949  34.07 
 
 
415 aa  55.1  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3411  hypothetical protein  36 
 
 
167 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.69027 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0510  protein of unknown function DUF949  34.78 
 
 
478 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5418  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.36 
 
 
252 aa  54.3  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.221879 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0952  hypothetical protein  35.11 
 
 
256 aa  54.3  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.740863  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2917  hypothetical protein  29.47 
 
 
545 aa  53.5  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.183325 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4043  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.85 
 
 
169 aa  53.1  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2896  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  26.63 
 
 
162 aa  52.8  0.000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.805979  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0166  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.53 
 
 
449 aa  52.4  0.000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1461  hypothetical protein  35 
 
 
208 aa  52  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2684  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  29.41 
 
 
167 aa  52.4  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4971  protein of unknown function DUF949  34.78 
 
 
400 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.778266  normal  0.0128256 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4116  hypothetical protein  31.58 
 
 
335 aa  51.6  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.547792  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2282  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.77 
 
 
171 aa  51.6  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.273788  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4193  hypothetical protein  26.67 
 
 
364 aa  51.6  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.939474  normal  0.682921 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1094  protein of unknown function DUF949  30.53 
 
 
357 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0542977  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4457  hypothetical protein  33.33 
 
 
396 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.821802 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4921  hypothetical protein  33.33 
 
 
406 aa  52  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.596783  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1859  hypothetical protein  30.53 
 
 
504 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.286252 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0893  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.22 
 
 
241 aa  52  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1211  2-dehydro-3-deoxyphosphooctonate aldolase  28.72 
 
 
238 aa  50.8  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0542  hypothetical protein  29.47 
 
 
407 aa  50.8  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0582  protein of unknown function DUF949  31.63 
 
 
244 aa  51.2  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.380158  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39640  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG-related protein  33.66 
 
 
168 aa  50.4  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2033  putative lipoprotein  31.45 
 
 
403 aa  50.1  0.00005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.34888  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4074  hypothetical protein  31.65 
 
 
171 aa  50.1  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000682616  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1955  putative lipoprotein  31.45 
 
 
403 aa  50.1  0.00005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1362  hypothetical protein  30.41 
 
 
166 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0818746  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3169  hypothetical protein  29.41 
 
 
246 aa  50.1  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3306  hypothetical protein  29.41 
 
 
246 aa  50.1  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.635289  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5200  hypothetical protein  28.42 
 
 
462 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.86249 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3600  protein of unknown function DUF949  41.94 
 
 
409 aa  50.1  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1823  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.04 
 
 
188 aa  50.1  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.110296  normal  0.290144 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0041  putative lipoprotein  30.53 
 
 
247 aa  50.1  0.00006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2528  hypothetical protein  34.04 
 
 
188 aa  50.1  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2521  hypothetical protein  34.04 
 
 
188 aa  50.1  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0905  hypothetical protein  38.71 
 
 
412 aa  49.7  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3632  2-dehydro-3-deoxyphosphooctonate aldolase  30 
 
 
239 aa  50.1  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2641  hypothetical protein  34.04 
 
 
188 aa  50.1  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.749921  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3319  hypothetical protein  29.41 
 
 
246 aa  50.1  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000442152 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4733  hypothetical protein  28.42 
 
 
462 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2505  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.35 
 
 
171 aa  49.7  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.384075  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15840  hypothetical protein  30.41 
 
 
166 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0326425 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0610  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.57 
 
 
388 aa  49.7  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0696  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.14 
 
 
244 aa  49.3  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5272  protein of unknown function DUF949  28.42 
 
 
475 aa  49.7  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.910314 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00219  hypothetical protein  31.31 
 
 
246 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3383  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.31 
 
 
246 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1271  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  33 
 
 
187 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0272  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  35.79 
 
 
160 aa  48.9  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0839501 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3464  2-dehydro-3-deoxyphosphooctonate aldolase  33.33 
 
 
239 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3060  hypothetical protein  27.37 
 
 
439 aa  48.9  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3893  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.32 
 
 
408 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00297495 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00223  hypothetical protein  31.31 
 
 
246 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0267  hypothetical protein  31.31 
 
 
246 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.816642 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0252  hypothetical protein  31.31 
 
 
246 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0256  hypothetical protein  31.31 
 
 
246 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3396  hypothetical protein  31.31 
 
 
246 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0235  hypothetical protein  31.31 
 
 
246 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.480121  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0219  hypothetical protein  31.31 
 
 
246 aa  48.9  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>