More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1239 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1239  phenylacetic acid degradation protein PaaY  100 
 
 		 200 aa  406  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.55157  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0983  transferase  73.87 
 
 		 200 aa  305  2.0000000000000002e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2406  phenylacetic acid degradation protein PaaY  74.37 
 
 		 208 aa  305  4.0000000000000004e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.572897 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1515  phenylacetic acid degradation protein PaaY  66.84 
 
 		 205 aa  273  1.0000000000000001e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.443467  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0385  phenylacetic acid degradation protein PaaY  63.27 
 
 		 203 aa  259  2e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00144851  normal  0.0147726 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2474  phenylacetic acid degradation protein PaaY  65.1 
 
 		 199 aa  254  6e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.29781  normal  0.884241 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3285  phenylacetic acid degradation protein PaaY  64.58 
 
 		 199 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.521801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3084  phenylacetic acid degradation protein PaaY  63.44 
 
 		 198 aa  251  4.0000000000000004e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.264252 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2998  phenylacetic acid degradation protein PaaY  63.82 
 
 		 202 aa  251  5.000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2611  phenylacetic acid degradation protein PaaY  63.02 
 
 		 199 aa  249  3e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.178031  normal  0.0643205 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1586  phenylacetic acid degradation protein PaaY  62.11 
 
 		 196 aa  248  5e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2245  phenylacetic acid degradation protein PaaY  61.58 
 
 		 196 aa  244  6e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.3221  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2255  phenylacetic acid degradation protein PaaY  61.58 
 
 		 196 aa  244  6e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.438675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1487  phenylacetic acid degradation protein PaaY  61.58 
 
 		 196 aa  244  6e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2624  phenylacetic acid degradation protein PaaY  61.29 
 
 		 199 aa  239  2e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0766069 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0076  carnitine operon protein CaiE  58.2 
 
 		 198 aa  234  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0075  carnitine operon protein CaiE  58.2 
 
 		 198 aa  234  6e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.903191 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0077  carnitine operon protein CaiE  58.2 
 
 		 198 aa  234  7e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.81711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0073  carnitine operon protein CaiE  58.2 
 
 		 198 aa  234  7e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0073  carnitine operon protein CaiE  58.2 
 
 		 198 aa  234  7e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0039  carnitine operon protein CaiE  58.2 
 
 		 196 aa  234  9e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00039  predicted acyl transferase  58.2 
 
 		 196 aa  233  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00038  hypothetical protein  58.2 
 
 		 196 aa  233  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0037  carnitine operon protein CaiE  58.2 
 
 		 196 aa  232  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0039  carnitine operon protein CaiE  58.2 
 
 		 196 aa  232  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0036  carnitine operon protein CaiE  58.2 
 
 		 196 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.89509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3620  carnitine operon protein CaiE  57.67 
 
 		 196 aa  232  3e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.29388 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3564  transferase hexapeptide repeat containing protein  57.67 
 
 		 196 aa  231  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3223  carnitine operon protein CaiE  58.03 
 
 		 196 aa  231  6e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.143313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4032  carnitine operon protein CaiE  57.51 
 
 		 222 aa  230  1e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3102  regulatory PhaM protein  55.85 
 
 		 195 aa  226  1e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0237996  decreased coverage  0.0000286211 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0225  regulatory PhaM protein  51.31 
 
 		 199 aa  211  5.999999999999999e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.436924 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0662  hexapeptide repeat-containing acetyltransferase  48.97 
 
 		 196 aa  202  2e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05255  phenylacetic acid degradation protein  48.35 
 
 		 204 aa  194  7e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.524726  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3897  carbonic anhydrase  54.91 
 
 		 176 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.731828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4358  hexapaptide repeat-containing transferase  54.97 
 
 		 171 aa  185  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1467  carbonic anhydrase  53.18 
 
 		 175 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0618569  normal  0.711294 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1555  phenyl acetic acid degradation protein  43.43 
 
 		 205 aa  175  5e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0917  hexapaptide repeat-containing transferase  47.34 
 
 		 175 aa  154  8e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000456928  normal  0.0606057 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1750  carbonic anhydrase  43.89 
 
 		 183 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.293502  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0861  transferase hexapeptide repeat protein  43.48 
 
 		 173 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35750  isoleucine patch superfamily enzyme, carbonic anhydrase/acetyltransferase  39.52 
 
 		 172 aa  122  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.457573  normal  0.431311 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1069  hypothetical protein  39.47 
 
 		 173 aa  123  2e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28200  isoleucine patch superfamily enzyme, carbonic anhydrase/acetyltransferase  43.64 
 
 		 172 aa  121  8e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3189  hexapaptide repeat-containing transferase  40.25 
 
 		 175 aa  121  9e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.876706  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2918  ferripyochelin binding protein  41.18 
 
 		 172 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1562  ferripyochelin binding protein  41.18 
 
 		 172 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.190855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2268  hypothetical protein  39.31 
 
 		 174 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2851  hypothetical protein  39.1 
 
 		 173 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1105  carbonic anhydrase  39.41 
 
 		 172 aa  115  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.519901  normal  0.0228348 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0535  transferase hexapeptide repeat containing protein  41.38 
 
 		 166 aa  114  7.999999999999999e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000389901  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3452  hypothetical protein  36.78 
 
 		 174 aa  114  7.999999999999999e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0926  ferripyochelin-binding protein  40.46 
 
 		 234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.24931 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1541  hexapaptide repeat-containing transferase  41.83 
 
 		 189 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.113499  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0880  isoleucine cluster protein  43.84 
 
 		 166 aa  114  1.0000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.684257  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2209  hypothetical protein  43.23 
 
 		 172 aa  114  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.804393  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13558  siderophore-binding protein  39.88 
 
 		 174 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000353278 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2015  hypothetical protein  41.38 
 
 		 174 aa  112  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.755225  normal  0.649207 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1461  carbonic anhydrase  34.12 
 
 		 185 aa  111  6e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000178452  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1064  carbonic anhydrase  37.75 
 
 		 162 aa  111  7.000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0980  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.87 
 
 		 163 aa  111  9e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.535757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0660  transferase hexapeptide repeat containing protein  34.94 
 
 		 182 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2439  transferase hexapeptide protein  39.41 
 
 		 172 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0020264 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0598  hexapaptide repeat-containing transferase  38.82 
 
 		 171 aa  110  2.0000000000000002e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.815519  hitchhiker  0.000000000000309138 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4038  carbonic anhydrase  42.14 
 
 		 180 aa  108  5e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.820028  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2773  hypothetical protein  32.35 
 
 		 172 aa  108  6e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000332346  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1599  acetyltransferase/acyltransferase  35.59 
 
 		 173 aa  108  6e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1187  siderophore binding protein  38.95 
 
 		 172 aa  108  7.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000944308 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1203  putative regulator  34.18 
 
 		 175 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00319738  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0500  transferase hexapeptide protein  35.68 
 
 		 191 aa  107  8.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6433  transferase hexapeptide repeat containing protein  38.27 
 
 		 174 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0175522 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1854  hypothetical protein  35.48 
 
 		 175 aa  107  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0466742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1242  hypothetical protein  37.91 
 
 		 174 aa  106  2e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18170  isoleucine patch superfamily enzyme, carbonic anhydrase/acetyltransferase  43.36 
 
 		 177 aa  107  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.814927 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1727  ferripyochelin binding protein-like  38.33 
 
 		 177 aa  106  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2729  transferase  46.48 
 
 		 179 aa  105  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0370  transferase family protein  36.96 
 
 		 170 aa  105  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5198  hypothetical protein  39.73 
 
 		 178 aa  105  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.614683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0435  hexapaptide repeat-containing transferase  38.36 
 
 		 174 aa  105  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1164  hexapaptide repeat-containing transferase  39.74 
 
 		 171 aa  105  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4655  transferase family protein  36.96 
 
 		 170 aa  105  5e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4493  transferase; acetyltransferase/acyltransferase  36.96 
 
 		 170 aa  105  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4511  transferase; acetyltransferase/acyltransferase  36.96 
 
 		 170 aa  105  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.104112  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4896  transferase family protein  36.96 
 
 		 170 aa  105  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5010  transferase family protein  36.96 
 
 		 170 aa  105  5e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4879  transferase family protein  36.96 
 
 		 170 aa  105  5e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4905  transferase family protein  36.96 
 
 		 170 aa  105  6e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1618  carbonic anhydrase  35.76 
 
 		 172 aa  105  6e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0246  carbonic anhydrase  37.71 
 
 		 182 aa  105  6e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4306  carbonic anhydrase  40.79 
 
 		 170 aa  104  7e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.571818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2121  carbonic anhydrase  37.34 
 
 		 175 aa  104  7e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.551825  normal  0.249053 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4076  carbonic anhydrase  40.79 
 
 		 170 aa  104  7e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.834557  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4152  carbonic anhydrase  40.79 
 
 		 170 aa  104  7e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.719958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3431  putative acetyltransferase/acyltransferase  35.17 
 
 		 170 aa  104  8e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1607  Carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily  34.09 
 
 		 232 aa  104  9e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.78593 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0768  ferripyochelin binding protein (fbp)  39.35 
 
 		 178 aa  104  9e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0993  transferase hexapeptide protein  34.48 
 
 		 174 aa  104  9e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1111  siderophore binding protein  37.27 
 
 		 173 aa  104  9e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.791842  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4587  acetyltransferase/acyltransferase  36.23 
 
 		 170 aa  104  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1838  carbonic anhydrase  37.93 
 
 		 162 aa  103  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.222248  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>