More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0761 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 748 aa  1539    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0518  family 2 glycosyl transferase  36.19 
 
 		 754 aa  147  1e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00714685  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  27.58 
 
 		 413 aa  135  3.9999999999999996e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 408 aa  126  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  28.98 
 
 		 396 aa  124  9e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  24.7 
 
 		 536 aa  123  9.999999999999999e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2766  glycosyl transferase group 1  31.49 
 
 		 413 aa  122  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.36427 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  27.43 
 
 		 417 aa  122  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  24.82 
 
 		 395 aa  122  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  27.08 
 
 		 446 aa  119  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  28.64 
 
 		 415 aa  114  8.000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2159  glycosyl transferase group 1  32.08 
 
 		 420 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  29.43 
 
 		 453 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2889  glycosyl transferase, group 1  34.04 
 
 		 389 aa  112  3e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.228881  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  30.56 
 
 		 383 aa  112  3e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  26.73 
 
 		 410 aa  112  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3576  glycosyl transferase  32.19 
 
 		 410 aa  111  4.0000000000000004e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0285  glycosyl transferase group 1  36.81 
 
 		 389 aa  109  1e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  25.06 
 
 		 419 aa  109  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5195  glycosyl transferase group 1  25.69 
 
 		 396 aa  109  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.3048e-16 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  27.95 
 
 		 435 aa  108  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  28.51 
 
 		 373 aa  108  4e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  31.52 
 
 		 392 aa  108  4e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  27.8 
 
 		 414 aa  108  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  26.95 
 
 		 388 aa  107  8e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  28.48 
 
 		 404 aa  107  9e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  28.95 
 
 		 438 aa  106  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  30.28 
 
 		 414 aa  106  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0562  glycosyltransferase  28.99 
 
 		 416 aa  106  2e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.841887  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4043  glycosyl transferase, group 1  24.4 
 
 		 396 aa  105  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.121484  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.61 
 
 		 360 aa  105  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2685  glycosyl transferase group 1  29.01 
 
 		 412 aa  105  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.481855  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1194  glycosyl transferase group 1  34.72 
 
 		 355 aa  105  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  29.08 
 
 		 353 aa  105  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06690  glycosyltransferase  30.19 
 
 		 406 aa  105  4e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  26.27 
 
 		 935 aa  105  4e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  28.53 
 
 		 438 aa  104  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  28.53 
 
 		 438 aa  104  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  28.53 
 
 		 439 aa  103  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  24.88 
 
 		 390 aa  103  1e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1673  glycosyl transferase group 1  29.49 
 
 		 411 aa  103  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.272276 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1977  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.33 
 
 		 443 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.26927  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2341  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 		 345 aa  102  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.220594 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3562  glycosyl transferase group 1  30.61 
 
 		 304 aa  102  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.658872 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  30.5 
 
 		 423 aa  102  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1287  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.33 
 
 		 443 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  30.57 
 
 		 375 aa  102  2e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  28.93 
 
 		 422 aa  102  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.33 
 
 		 443 aa  102  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0998  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.33 
 
 		 499 aa  102  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3157  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.33 
 
 		 443 aa  102  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2262  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.33 
 
 		 495 aa  102  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333753  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4262  glycosyl transferase, group 1  27.21 
 
 		 410 aa  102  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  29.49 
 
 		 419 aa  102  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3028  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.33 
 
 		 498 aa  102  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0495  glycosyl transferase group 1  34.43 
 
 		 383 aa  101  5e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  28.21 
 
 		 439 aa  101  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  28.21 
 
 		 439 aa  101  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2096  glycosyl transferase, group 1  28.27 
 
 		 410 aa  100  7e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0428  glycogen synthase  28.88 
 
 		 404 aa  100  8e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.743156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3263  glycosyl transferase group 1  26.37 
 
 		 425 aa  100  9e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0991  glycosyl transferase group 1  31.21 
 
 		 346 aa  100  9e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00704021  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21730  glycogen synthase  29.91 
 
 		 404 aa  100  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  24.88 
 
 		 391 aa  100  1e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  29.83 
 
 		 421 aa  99.8  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  25.06 
 
 		 369 aa  99.4  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5430  glycosyl transferase group 1  33.87 
 
 		 378 aa  99  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3874  glycosyl transferase family protein  31.76 
 
 		 313 aa  98.2  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0495804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2457  glycosyl transferase, group 1  30.57 
 
 		 386 aa  98.2  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3800  glycosyl transferase group 1  30.19 
 
 		 402 aa  97.8  6e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17673  normal  0.211423 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4999  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.62 
 
 		 367 aa  97.4  9e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4579  glycosyl transferase, group 1  34.84 
 
 		 398 aa  97.4  9e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0122865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  30.4 
 
 		 376 aa  97.1  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0775  glycosyltransferase-like protein  34.53 
 
 		 371 aa  96.7  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  25.47 
 
 		 410 aa  97.1  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  34.31 
 
 		 423 aa  96.7  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2082  glycosyl transferase group 1  33.87 
 
 		 378 aa  97.1  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2912  glycosyl transferase group 1  28.54 
 
 		 412 aa  96.7  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.341746  normal  0.205284 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  35.68 
 
 		 373 aa  97.1  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  27.18 
 
 		 434 aa  97.1  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1978  glycogen synthase  28.35 
 
 		 406 aa  96.3  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.215698 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  34.05 
 
 		 364 aa  96.3  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  31.96 
 
 		 924 aa  96.3  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  37.16 
 
 		 382 aa  95.5  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  28.51 
 
 		 365 aa  95.5  3e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  31.63 
 
 		 426 aa  95.5  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  34.26 
 
 		 383 aa  95.5  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3447  group 1 glycosyl transferase  24.36 
 
 		 395 aa  95.1  4e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1867  glycosyl transferase, group 1  30.29 
 
 		 412 aa  95.1  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2470  glycosyl transferase, group 1  29.83 
 
 		 345 aa  95.1  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1913  glycosyl transferase, group 1  30.29 
 
 		 412 aa  95.1  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.434704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4083  glycosyl transferase group 1  25.48 
 
 		 399 aa  95.1  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1847  glycosyl transferase, group 1  30.29 
 
 		 412 aa  95.1  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.469612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3604  glycosyl transferase group 1  39.1 
 
 		 387 aa  95.1  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.592965  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0439  glycosyl transferase, group 1  24 
 
 		 395 aa  94.7  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.63616  normal  0.246841 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2376  glycosyl transferase group 1  31.43 
 
 		 372 aa  94.7  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0253  glycosyl transferase, group 1  32.06 
 
 		 358 aa  94.7  5e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1184  glycosyl transferase, group 1  26.94 
 
 		 412 aa  94.7  6e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2865  glycosyl transferase group 1  28.47 
 
 		 347 aa  94.7  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1022  hypothetical protein  35.94 
 
 		 417 aa  94.7  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>