150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1572 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1572  universal stress protein UspE  100 
 
 		 314 aa  646    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.322555  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1044  universal stress protein UspE  61.34 
 
 		 315 aa  397  1e-109  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.106711  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02294  universal stress protein UspE  60.06 
 
 		 315 aa  386  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1800  universal stress protein UspE  52.26 
 
 		 310 aa  332  4e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.846071  normal  0.320472 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1943  universal stress protein UspE  50.96 
 
 		 318 aa  326  4.0000000000000003e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.361169  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1832  universal stress protein UspE  50.96 
 
 		 318 aa  326  4.0000000000000003e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2416  universal stress protein UspE  50.8 
 
 		 310 aa  325  7e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.268854  decreased coverage  0.000000187412 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1842  universal stress protein UspE  50.65 
 
 		 309 aa  322  7e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000992679  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1851  universal stress protein UspE  50.96 
 
 		 316 aa  320  1.9999999999999998e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.749942 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2220  universal stress protein UspE  49.84 
 
 		 310 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.875118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2583  universal stress protein UspE  51.45 
 
 		 320 aa  318  7e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1672  universal stress protein UspE  50.64 
 
 		 315 aa  315  6e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0632813 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1786  universal stress protein UspE  50.64 
 
 		 315 aa  315  8e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.144508 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1784  universal stress protein UspE  50.64 
 
 		 315 aa  315  8e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.334213  normal  0.266242 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1846  universal stress protein UspE  50.64 
 
 		 315 aa  315  8e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1490  universal stress protein UspE  50.64 
 
 		 315 aa  315  8e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0578551  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1545  universal stress protein UspE  50.64 
 
 		 316 aa  315  9e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003476  universal stress protein E  59.92 
 
 		 254 aa  314  9.999999999999999e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.181718  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01310  stress-induced protein  50.32 
 
 		 316 aa  313  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2312  UspA domain protein  50.32 
 
 		 316 aa  313  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.172993  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1980  universal stress protein UspE  50.32 
 
 		 316 aa  313  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.420697 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1986  universal stress protein UspE  48.73 
 
 		 316 aa  313  1.9999999999999998e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.652994  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1789  universal stress protein UspE  50.32 
 
 		 316 aa  313  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2292  universal stress protein UspE  50.32 
 
 		 316 aa  313  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1449  universal stress protein UspE  50.32 
 
 		 316 aa  313  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01320  hypothetical protein  50.32 
 
 		 316 aa  313  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2355  universal stress protein UspE  48.87 
 
 		 310 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2015  universal stress protein UspE  48.87 
 
 		 310 aa  312  3.9999999999999997e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000455059 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1960  universal stress protein UspE  48.87 
 
 		 310 aa  312  3.9999999999999997e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00778314 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2116  universal stress protein UspE  48.87 
 
 		 310 aa  312  3.9999999999999997e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.673331  normal  0.0394292 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2019  universal stress protein UspE  49.2 
 
 		 309 aa  312  5.999999999999999e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.865134  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0930  universal stress protein UspE  47.91 
 
 		 311 aa  311  6.999999999999999e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1994  universal stress protein UspE  48.87 
 
 		 310 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.436901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1950  universal stress protein UspE  48.55 
 
 		 310 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2223  universal stress protein UspE  48.23 
 
 		 310 aa  309  4e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000145957  normal  0.12873 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4496  universal stress protein UspE  48.23 
 
 		 310 aa  309  4e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2210  universal stress protein UspE  48.23 
 
 		 310 aa  309  4e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000689351  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2211  universal stress protein UspE  48.23 
 
 		 310 aa  309  4e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00209938  normal  0.266977 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2161  universal stress protein UspE  48.23 
 
 		 310 aa  309  4e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0882327  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2223  universal stress protein UspE  48.87 
 
 		 310 aa  308  5.9999999999999995e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0502569  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2080  universal stress protein UspE  49.52 
 
 		 323 aa  306  4.0000000000000004e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.108307  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1863  universal stress protein UspE  49.84 
 
 		 319 aa  305  8.000000000000001e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.809514  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2399  universal stress protein UspE  48.23 
 
 		 316 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2106  universal stress protein UspE  48.23 
 
 		 316 aa  301  8.000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.107549  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2065  universal stress protein UspE  46.95 
 
 		 311 aa  294  1e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02064  universal stress protein UspE  46.77 
 
 		 307 aa  287  2e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00593148  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0879  universal stress protein UspE  42.76 
 
 		 307 aa  245  6e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0349688  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2938  universal stress protein  29.57 
 
 		 297 aa  133  5e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0629  UspA domain-containing protein  28.9 
 
 		 271 aa  132  5e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2576  UspA domain-containing protein  33.61 
 
 		 287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.140838  hitchhiker  0.00089263 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2187  universal stress protein  34.56 
 
 		 287 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3514  hypothetical protein  33.77 
 
 		 287 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.306404  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3550  UspA domain-containing protein  34.1 
 
 		 287 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41440  hypothetical protein  32.89 
 
 		 287 aa  124  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3432  UspA domain-containing protein  34.1 
 
 		 287 aa  122  8e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.85473  normal  0.743493 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2103  hypothetical protein  27.87 
 
 		 293 aa  122  8e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0483069  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3393  hypothetical protein  28.62 
 
 		 287 aa  120  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1811  UspA domain-containing protein  33.49 
 
 		 287 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1258  universal stress protein UspA  28.86 
 
 		 320 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1041  UspA domain-containing protein  26.97 
 
 		 298 aa  116  6e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2951  universal stress protein UspA  27.3 
 
 		 318 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.70353  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0988  UspA domain-containing protein  26.73 
 
 		 296 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3260  UspA domain-containing protein  27.65 
 
 		 302 aa  107  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38400  universal stress protein family  28.75 
 
 		 310 aa  107  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3296  universal stress protein  25.63 
 
 		 307 aa  107  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.249085  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1103  UspA domain-containing protein  26.98 
 
 		 291 aa  107  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.384617  normal  0.477468 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1103  hypothetical protein  25.93 
 
 		 291 aa  106  6e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.21994  normal  0.105 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1288  universal stress protein UspA  27.57 
 
 		 310 aa  105  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3342  hypothetical protein  26.06 
 
 		 305 aa  104  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.662627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2285  hypothetical protein  29.28 
 
 		 323 aa  104  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1169  UspA domain-containing protein  26.51 
 
 		 291 aa  104  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0512262  normal  0.061235 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2169  hypothetical protein  25.24 
 
 		 309 aa  103  4e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.199565 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2095  UspA domain-containing protein  26.97 
 
 		 320 aa  103  4e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0722  hypothetical protein  24.52 
 
 		 294 aa  100  4e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.483462 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0929  UspA domain protein  28.62 
 
 		 326 aa  99.4  8e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3008  UspA domain-containing protein  25.9 
 
 		 298 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0884  UspA domain-containing protein  23.95 
 
 		 294 aa  95.9  9e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3340  universal stress protein  27.1 
 
 		 315 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2623  putative universal stress protein  25.55 
 
 		 308 aa  94.7  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25790  universal stress protein, UspA family  26.38 
 
 		 311 aa  93.6  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1391  universal stress protein, UspA  27.11 
 
 		 327 aa  92.4  9e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2745  universal stress protein  25.25 
 
 		 298 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.712229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1915  UspA domain-containing protein  24.68 
 
 		 289 aa  88.2  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3216  hypothetical protein  24.61 
 
 		 299 aa  87.4  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2453  UspA domain-containing protein  24.1 
 
 		 296 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.740896 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000419  universal stress protein family 1  25.23 
 
 		 311 aa  81.6  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3237  universal stress protein  24.1 
 
 		 296 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0566  hypothetical protein  24.38 
 
 		 311 aa  80.9  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0834  UspA domain protein  26.22 
 
 		 315 aa  80.5  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.652975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1066  GGDEF  25.12 
 
 		 271 aa  80.5  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3031  UspA domain-containing protein  25.82 
 
 		 308 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.497745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56220  hypothetical protein  25.8 
 
 		 304 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2558  UspA domain-containing protein  23.38 
 
 		 296 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3156  universal stress protein  23.38 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.318164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4897  hypothetical protein  27.69 
 
 		 304 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2765  UspA domain-containing protein  26.4 
 
 		 318 aa  77  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2734  hypothetical protein  24.33 
 
 		 293 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1615  UspA domain protein  27.05 
 
 		 315 aa  75.9  0.0000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3344  hypothetical protein  25 
 
 		 307 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2699  UspA domain-containing protein  22.73 
 
 		 296 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>