124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1337 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1337  tyrosine-specific transport protein (tyrosine permease)  100 
 
 		 384 aa  751    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06320  hypothetical protein  64.49 
 
 		 385 aa  461  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001420  tyrosine-specific transport protein  64.23 
 
 		 385 aa  454  1.0000000000000001e-126  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3298  tyrosine-specific transport protein  36.53 
 
 		 388 aa  222  8e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0641  aromatic amino acid permease  36.17 
 
 		 399 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3188  aromatic amino acid permease  34.26 
 
 		 395 aa  203  5e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.497864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0526  aromatic amino acid transporter  37.77 
 
 		 400 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.560578  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0574  aromatic amino acid permease  34.49 
 
 		 400 aa  199  7e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2426  aromatic amino acid transporter  38.67 
 
 		 395 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.392601  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1774  tyrosine-specific transport protein (tyrosine permease)  36.09 
 
 		 390 aa  190  4e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2544  aromatic amino acid transporter  38.07 
 
 		 395 aa  190  5e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.487399  decreased coverage  0.00912111 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1925  aromatic amino acid transporter  38.4 
 
 		 395 aa  189  7e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00166231  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2433  aromatic amino acid transporter  38.4 
 
 		 395 aa  189  9e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.485869  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2186  aromatic amino acid transporter  37.97 
 
 		 395 aa  187  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.338137  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3938  aromatic amino acid permease  34.27 
 
 		 392 aa  185  9e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.176846  normal  0.472237 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3878  aromatic amino acid permease  33.42 
 
 		 391 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00957771  hitchhiker  0.00000285867 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1307  tyrosine-specific transport protein  34.72 
 
 		 422 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000107929 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0511  putative tyrosine-specific transport protein  37.9 
 
 		 400 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2099  tyrosine-specific transport protein  34.72 
 
 		 422 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.23753e-19 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2152  tyrosine-specific transport protein  34.72 
 
 		 422 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000242218 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1184  tyrosine-specific transport protein  34.72 
 
 		 422 aa  182  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.135204  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2092  tyrosine-specific transport protein  34.72 
 
 		 422 aa  182  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0842051  hitchhiker  0.0000739999 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2185  aromatic amino acid transporter  36.46 
 
 		 395 aa  182  1e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.135373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3389  aromatic amino acid permease  33.84 
 
 		 395 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2065  tyrosine-specific transport protein  35.88 
 
 		 395 aa  181  2e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1846  aromatic amino acid transporter  36.9 
 
 		 395 aa  181  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.510263 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4434  aromatic amino acid transporter  38.87 
 
 		 400 aa  180  4e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1074  tyrosine-specific transport protein, putative  34.6 
 
 		 395 aa  179  9e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1792  aromatic amino acid transporter  35.92 
 
 		 395 aa  178  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3465  aromatic amino acid permease  33.42 
 
 		 391 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.230898  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0897  aromatic amino acid permease  33.16 
 
 		 391 aa  176  7e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3026  aromatic amino acid permease  34.95 
 
 		 391 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0948  aromatic amino acid permease  34.95 
 
 		 391 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0522769 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3588  aromatic amino acid permease  33.42 
 
 		 391 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.281237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0683  aromatic amino acid permease  36.13 
 
 		 399 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.205009  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0912  aromatic amino acid permease  34.95 
 
 		 391 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.231999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1034  tyrosine-specific transport protein  34.78 
 
 		 403 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311327  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1736  aromatic amino acid transporter  34.78 
 
 		 403 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000018039  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2939  tyrosine-specific transport protein, putative  36.58 
 
 		 395 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121322  normal  0.0322125 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1276  tyrosine-specific transport protein  34.78 
 
 		 403 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00001928  hitchhiker  0.0000367731 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01875  tyrosine transporter  34.78 
 
 		 403 aa  173  5e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0104717  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01864  hypothetical protein  34.78 
 
 		 403 aa  173  5e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00693993  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2005  tyrosine-specific transport protein  34.78 
 
 		 403 aa  173  5e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000529329  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2140  tyrosine-specific transport protein  34.78 
 
 		 403 aa  173  5e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000592969  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1729  aromatic amino acid transporter  34.78 
 
 		 403 aa  173  5e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000563721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2647  tyrosine-specific transport protein  34.78 
 
 		 403 aa  173  5.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.588852  hitchhiker  0.0000000318595 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0712  tyrosine-specific transport protein  35.03 
 
 		 400 aa  172  7.999999999999999e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0916  aromatic amino acid permease  34.66 
 
 		 395 aa  169  5e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2489  aromatic amino acid transporter  34.97 
 
 		 425 aa  167  4e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1118  aromatic amino acid transporter  34.53 
 
 		 402 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0780  tyrosine-specific transport protein  34.6 
 
 		 403 aa  164  3e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000892482  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003573  tyrosine-specific transport protein  33.78 
 
 		 380 aa  160  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02530  hypothetical protein  35.06 
 
 		 361 aa  159  7e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3276  aromatic amino acid transporter  34.45 
 
 		 402 aa  159  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2774  tyrosine-specific transport protein  32.9 
 
 		 402 aa  158  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1318  tyrosine-specific transport protein  32.9 
 
 		 402 aa  158  2e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2853  aromatic amino acid transporter  32.9 
 
 		 402 aa  158  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3197  aromatic amino acid transporter  34.27 
 
 		 402 aa  158  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0692  hypothetical protein  31.43 
 
 		 396 aa  153  5e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0710  hypothetical protein  30.99 
 
 		 396 aa  152  8e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3860  aromatic amino acid transporter  29.02 
 
 		 418 aa  150  3e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3787  aromatic amino acid transporter  29.02 
 
 		 418 aa  150  5e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3987  aromatic amino acid transporter  29.02 
 
 		 418 aa  149  8e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4601  tryptophan-specific transport protein  28.5 
 
 		 414 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0691  hypothetical protein  31.71 
 
 		 398 aa  147  3e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0709  hypothetical protein  31.46 
 
 		 398 aa  147  5e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1166  tyrosine-specific transport protein  34.61 
 
 		 405 aa  145  1e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0097  aromatic amino acid transporter  28.06 
 
 		 419 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.103921  normal  0.507347 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1031  aromatic amino acid transporter  27.83 
 
 		 425 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1562  tryptophan-specific transport protein  29.77 
 
 		 416 aa  141  1.9999999999999998e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000304843  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0991  tryptophan permease  26.29 
 
 		 424 aa  140  3e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4176  aromatic amino acid transporter  28.24 
 
 		 418 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4307  aromatic amino acid transporter  28.24 
 
 		 418 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3778  aromatic amino acid transporter  27.46 
 
 		 418 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4108  aromatic amino acid transporter  28.24 
 
 		 418 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3479  aromatic amino acid transport protein  29.95 
 
 		 418 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0158  aromatic amino acid transporter  28.24 
 
 		 418 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71710  tryptophan permease  29.28 
 
 		 417 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.268423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3513  aromatic amino acid transport protein  28.09 
 
 		 417 aa  139  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6222  tryptophan permease  28.93 
 
 		 467 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2776  aromatic amino acid transporter  28.09 
 
 		 414 aa  138  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2697  tryptophan-specific transport protein  28.09 
 
 		 414 aa  138  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0182  aromatic amino acid transporter  28.24 
 
 		 418 aa  137  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0262  aromatic amino acid transporter  27.72 
 
 		 418 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0755  tryptophan permease  26.29 
 
 		 424 aa  135  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3236  aromatic amino acid transporter  28.36 
 
 		 414 aa  133  5e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000036044 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3995  aromatic amino acid transporter  28.86 
 
 		 418 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3531  aromatic amino acid transporter  28.72 
 
 		 418 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1135  aromatic amino acid transporter  27.78 
 
 		 409 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.55679  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0202  aromatic amino acid transporter  28.21 
 
 		 418 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1511  tryptophan-specific transport protein  27.58 
 
 		 412 aa  130  4.0000000000000003e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03028  tryptophan transporter of high affinity  25.68 
 
 		 414 aa  124  4e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0544  aromatic amino acid transporter  25.68 
 
 		 414 aa  124  4e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4480  tryptophan permease  25.41 
 
 		 414 aa  124  4e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02979  hypothetical protein  25.68 
 
 		 414 aa  124  4e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3598  tryptophan permease  25.41 
 
 		 414 aa  123  5e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0157208 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0448  tyrosine-specific transport protein  31.2 
 
 		 426 aa  123  5e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1723  tryptophan/tyrosine permease family protein  31.2 
 
 		 424 aa  123  6e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3353  tryptophan permease  25.41 
 
 		 414 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3611  tryptophan permease  25.41 
 
 		 414 aa  122  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>