More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002804 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_03174  flagellin  98.41 
 
 
377 aa  748  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002804  flagellin protein FlaF  100 
 
 
377 aa  758  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1728  flagellin  75.27 
 
 
378 aa  583  1e-165  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1727  flagellin  69.76 
 
 
377 aa  525  1e-148  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03173  flagellin  69.76 
 
 
377 aa  521  1e-147  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01301  flagellin  69.5 
 
 
377 aa  517  1e-145  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2325  flagellin  67.37 
 
 
377 aa  516  1e-145  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004161  flagellin protein FlaD  69.5 
 
 
377 aa  505  1e-142  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0793606  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002805  flagellin protein FlaD  69.5 
 
 
377 aa  505  1e-142  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2327  flagellin  66.67 
 
 
379 aa  500  1e-140  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2319  flagellin  65.69 
 
 
402 aa  496  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1779  flagellin  66.58 
 
 
377 aa  495  1e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000663504  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002806  flagellin protein flaA  66.58 
 
 
376 aa  491  1e-138  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.938557  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2318  flagellin  66.31 
 
 
375 aa  494  1e-138  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03171  flagellin  65.78 
 
 
376 aa  489  1e-137  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2317  flagellin  64.02 
 
 
378 aa  486  1e-136  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1780  flagellin  65.34 
 
 
379 aa  478  1e-134  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.315393  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004162  flagellin protein FlaC  64.06 
 
 
384 aa  476  1e-133  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.930757  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01300  flagellin  63.28 
 
 
384 aa  470  1e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1726  flagellin  64.46 
 
 
376 aa  457  1e-127  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2517  flagellin  58.51 
 
 
385 aa  438  1e-122  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0895913  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004160  flagellin protein flaE  46.79 
 
 
374 aa  346  5e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  7.39786e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01302  flagellin  45.99 
 
 
374 aa  337  1e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4279  A-type flagellin  46.67 
 
 
387 aa  315  9e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1352  flagellin domain-containing protein  46.46 
 
 
393 aa  312  5e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1351  flagellin domain-containing protein  47.1 
 
 
394 aa  311  1e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1895  flagellin  42.47 
 
 
405 aa  272  7e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.226617  normal  0.0800037 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1894  flagellin  41.63 
 
 
395 aa  270  2e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0808801 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1893  flagellin  40.55 
 
 
392 aa  259  7e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.081721 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02916  flagellin  43.83 
 
 
319 aa  257  3e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11854  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02917  flagellin  42.71 
 
 
319 aa  254  2e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.459128  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06165  flagellin  41.28 
 
 
390 aa  245  1e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.750692  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01001  flagellin  41.28 
 
 
390 aa  245  1e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.157876  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1294  flagellin  37.53 
 
 
475 aa  243  3e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2867  flagellin-related hook-associated protein  38.96 
 
 
404 aa  239  5e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1337  flagellin-like  38.94 
 
 
388 aa  235  1e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1400  flagellin domain protein  40.21 
 
 
375 aa  234  1e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2866  flagellin-related hook-associated protein  38.24 
 
 
404 aa  234  2e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0760  flagellin-like  38.56 
 
 
380 aa  227  2e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.382669 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3223  flagellin domain protein  38.4 
 
 
327 aa  227  2e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0766  flagellin domain-containing protein  39.74 
 
 
376 aa  226  4e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1273  flagellin domain-containing protein  64.44 
 
 
484 aa  223  6e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.560654 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1270  flagellin domain-containing protein  63.89 
 
 
485 aa  222  1e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.712359 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1448  flagellin domain protein  35.89 
 
 
437 aa  221  1e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.424798  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1985  flagellin-like protein  37.01 
 
 
356 aa  221  2e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2835  flagellin domain-containing protein  49.25 
 
 
492 aa  219  6e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00759619 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1340  flagellin domain-containing protein  66.47 
 
 
468 aa  216  7e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2354  flagellin domain protein  37.31 
 
 
386 aa  214  2e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50290  flagellin type B  49.15 
 
 
488 aa  214  3e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00503074  decreased coverage  0.000184596 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1341  flagellin domain-containing protein  64.67 
 
 
467 aa  214  3e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2381  flagellin  36.32 
 
 
369 aa  213  6e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2281  flagellin  36.32 
 
 
369 aa  213  6e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1173  flagellin domain-containing protein  62.13 
 
 
481 aa  211  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000144043  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1172  flagellin domain-containing protein  60.36 
 
 
482 aa  209  5e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.503015  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2935  flagellin domain-containing protein  38.03 
 
 
274 aa  209  6e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2231  flagellin domain protein  35.96 
 
 
383 aa  209  6e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  1.59197e-07 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1490  flagellin  66.26 
 
 
516 aa  208  1e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1554  flagellin domain protein  34.61 
 
 
379 aa  207  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1488  flagellin  47.02 
 
 
517 aa  206  5e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4378  flagellin FliC  62.35 
 
 
687 aa  206  8e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2940  flagellin domain-containing protein  38.52 
 
 
412 aa  205  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1428  flagellin domain protein  37.5 
 
 
274 aa  205  1e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31290  flagellin/flagellar hook associated protein  37.12 
 
 
390 aa  201  1e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0355405  normal  0.263807 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0456  flagellin domain-containing protein  36.57 
 
 
404 aa  201  2e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3196  flagellin  36.41 
 
 
383 aa  201  2e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1293  flagellin  34.03 
 
 
475 aa  200  4e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3448  flagellin  35.92 
 
 
388 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0953619  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0090  flagellin  35.92 
 
 
388 aa  199  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2873  flagellin  35.92 
 
 
388 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3870  flagellin  35.92 
 
 
388 aa  199  5e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1671  flagellin  35.92 
 
 
388 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3952  flagellin  35.92 
 
 
388 aa  199  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3102  flagellin  35.92 
 
 
388 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.586879  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2866  flagellin  35.62 
 
 
384 aa  198  1e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0241  flagellin  35.62 
 
 
384 aa  198  1e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0170  flagellin domain-containing protein  34.77 
 
 
387 aa  197  2e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2592  flagellin domain-containing protein  44.64 
 
 
494 aa  196  8e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.539107  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2202  adenylate kinase  54.05 
 
 
580 aa  195  1e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1896  flagellin domain protein  35.7 
 
 
422 aa  193  3e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0514  flagellin domain-containing protein  34.86 
 
 
386 aa  192  6e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04961  hypothetical protein  36.7 
 
 
289 aa  192  1e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1479  flagellin domain-containing protein  35.43 
 
 
389 aa  191  2e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1115  flagellin/flagellar hook-associated protein  51.79 
 
 
276 aa  190  3e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0539  flagellin domain-containing protein  35.03 
 
 
387 aa  190  4e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3939  flagellin domain-containing protein  44.9 
 
 
483 aa  189  6e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.484456  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3571  flagellin domain-containing protein  54.89 
 
 
294 aa  189  6e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1811  flagellin domain-containing protein  35.86 
 
 
388 aa  189  7e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.340499  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2945  flagellin domain-containing protein  59.63 
 
 
271 aa  189  9e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3237  flagellin  57.29 
 
 
272 aa  189  9e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3077  flagellin domain-containing protein  59.63 
 
 
271 aa  189  9e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.100619  normal  0.484151 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2950  flagellin domain-containing protein  55.68 
 
 
271 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2948  flagellin domain-containing protein  52.08 
 
 
271 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3088  flagellin domain-containing protein  55.68 
 
 
271 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3084  flagellin domain-containing protein  52.08 
 
 
271 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.469407  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2951  flagellin domain-containing protein  57.76 
 
 
272 aa  186  5e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3089  flagellin domain-containing protein  57.76 
 
 
272 aa  186  5e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3086  flagellin domain protein  57.49 
 
 
490 aa  184  3e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4398  flagellin domain-containing protein  56.63 
 
 
506 aa  184  3e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.308154  normal  0.749909 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1478  flagellin domain-containing protein  34.75 
 
 
372 aa  183  5e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2367  flagellin  56.02 
 
 
492 aa  183  5e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.912497  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>