More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0766 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_0766  translation initiation factor IF-3  100 
 
 		 181 aa  366  1e-101  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4639  translation initiation factor IF-3  52.46 
 
 		 219 aa  203  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000486529  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1032  translation initiation factor IF-3  53.01 
 
 		 238 aa  202  3e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1090  hypothetical protein  56.95 
 
 		 179 aa  192  2e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000129093  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1434  translation initiation factor IF-3  57.14 
 
 		 225 aa  192  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0842222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2400  translation initiation factor IF-3  54.9 
 
 		 164 aa  189  2e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00646191  normal  0.390668 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1383  translation initiation factor IF-3  57.89 
 
 		 187 aa  187  5e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111233  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0798  translation initiation factor IF-3  55.19 
 
 		 202 aa  187  8e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3163  translation initiation factor IF-3  58 
 
 		 252 aa  187  9e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0170352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2172  translation initiation factor IF-3  57.79 
 
 		 154 aa  186  1e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000864988  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0534  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 165 aa  185  2e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000758155  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1758  translation initiation factor 3  54.97 
 
 		 154 aa  183  1.0000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000120038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1301  translation initiation factor 3  55.13 
 
 		 175 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.444006  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2660  translation initiation factor IF-3  55.56 
 
 		 190 aa  181  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000648528  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0215  translation initiation factor IF-3  54.61 
 
 		 198 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.62616e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05720  translation initiation factor 3  52.83 
 
 		 207 aa  176  1e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000188671  normal  0.0169059 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2307  translation initiation factor IF-3  53.64 
 
 		 154 aa  176  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00282878  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0221  translation initiation factor IF-3  53.33 
 
 		 186 aa  176  2e-43  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.00015702  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4819  translation initiation factor IF-3  53.59 
 
 		 186 aa  176  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000690292  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1204  translation initiation factor IF-3  54.25 
 
 		 171 aa  176  2e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000244125  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4706  translation initiation factor IF-3  53.59 
 
 		 195 aa  175  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000432272  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4471  translation initiation factor IF-3  53.59 
 
 		 195 aa  175  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000220658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4306  translation initiation factor IF-3  53.59 
 
 		 195 aa  175  3e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000145665  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4317  translation initiation factor IF-3  53.59 
 
 		 195 aa  175  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000117232  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4699  translation initiation factor IF-3  53.59 
 
 		 166 aa  175  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000260309  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4690  translation initiation factor IF-3  53.59 
 
 		 166 aa  175  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.37112e-62 
 
 
-
 
NC_002936  DET0752  translation initiation factor IF-3  53.89 
 
 		 168 aa  175  4e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000893397  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4683  translation initiation factor IF-3  52.94 
 
 		 166 aa  174  4e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000101645  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0554  translation initiation factor IF-3  52.94 
 
 		 166 aa  174  4e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000012216  unclonable  2.53125e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4406  translation initiation factor IF-3  53.59 
 
 		 166 aa  174  5e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000111711  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15200  translation initiation factor 3  50.31 
 
 		 197 aa  173  9.999999999999999e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000028162  normal  0.0802518 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3182  translation initiation factor IF-3  52.15 
 
 		 205 aa  173  9.999999999999999e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0466683  normal  0.175076 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1613  translation initiation factor IF-3  57.66 
 
 		 145 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000306668  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3261  translation initiation factor IF-3  52.29 
 
 		 195 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000125648  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1233  translation initiation factor IF-3  52.67 
 
 		 198 aa  172  2.9999999999999996e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000135112  normal  0.0984034 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2054  translation initiation factor IF-3  49.34 
 
 		 152 aa  171  3.9999999999999995e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000423398  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1823  translation initiation factor 3 (bIF-3)  56.21 
 
 		 153 aa  171  5e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000272282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3622  translation initiation factor IF-3  46.7 
 
 		 357 aa  170  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0913675  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2418  translation initiation factor IF-3  52.73 
 
 		 196 aa  169  1e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0428  translation initiation factor IF-3  50.66 
 
 		 156 aa  170  1e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1419  translation initiation factor IF-3  52.08 
 
 		 146 aa  169  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000288109  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1269  translation initiation factor 3  53.55 
 
 		 225 aa  169  3e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.628011  normal  0.508823 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2996  translation initiation factor IF-3  51.68 
 
 		 173 aa  168  4e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1225  translation initiation factor 3  50.99 
 
 		 164 aa  168  4e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000314962  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3071  translation initiation factor IF-3  51.27 
 
 		 182 aa  168  4e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.427548  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1149  translation initiation factor IF-3  48.67 
 
 		 202 aa  168  4e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2139  translation initiation factor IF-3  52.29 
 
 		 177 aa  167  6e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0045601  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12250  translation initiation factor 3  48.85 
 
 		 195 aa  167  8e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.109497  normal  0.154931 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1319  translation initiation factor IF-3  50.65 
 
 		 190 aa  166  1e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0918782  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1516  translation initiation factor IF-3  50.99 
 
 		 172 aa  165  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.027432  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4742  translation initiation factor IF-3  49.67 
 
 		 176 aa  166  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.676759  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1311  translation initiation factor IF-3  49.67 
 
 		 164 aa  165  2.9999999999999998e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000644552  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2042  translation initiation factor IF-3  49.37 
 
 		 199 aa  165  2.9999999999999998e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0708817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1241  translation initiation factor 3  48.08 
 
 		 170 aa  165  2.9999999999999998e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000256408  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3328  translation initiation factor IF-3  48.33 
 
 		 243 aa  165  4e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.825238  normal  0.390058 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0044  translation initiation factor IF-3  48 
 
 		 173 aa  164  5e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1728  initiation factor 3  55.94 
 
 		 149 aa  164  5e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00351932  hitchhiker  0.00163995 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3158  translation initiation factor IF-3  49.67 
 
 		 173 aa  164  5e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0522  translation initiation factor IF-3  47.37 
 
 		 193 aa  164  5e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.0000000692532  hitchhiker  0.000000579185 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0660  translation initiation factor IF-3  47.68 
 
 		 176 aa  164  6.9999999999999995e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000367528  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25690  translation initiation factor 3  50.31 
 
 		 168 aa  164  6.9999999999999995e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11658  translation initiation factor IF-3  53.29 
 
 		 201 aa  164  8e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4144  translation initiation factor IF-3  49.7 
 
 		 227 aa  164  8e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0415962  hitchhiker  0.000102893 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1103  translation initiation factor IF-3  43.46 
 
 		 233 aa  164  8e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0433779  normal  0.928932 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1249  translation initiation factor IF-3  48.67 
 
 		 174 aa  164  8e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.246001 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0671  translation initiation factor IF-3  49.01 
 
 		 192 aa  163  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.395911  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2747  translation initiation factor IF-3  48.34 
 
 		 169 aa  163  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.128829 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1937  translation initiation factor IF-3  47.68 
 
 		 174 aa  162  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.0464847 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0065  translation initiation factor IF-3  47.74 
 
 		 184 aa  162  2.0000000000000002e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0680  translation initiation factor 3  53.21 
 
 		 157 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000916638  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6087  Translation initiation factor 3 (IF-3)-like protein  51.33 
 
 		 222 aa  162  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5473  translation initiation factor IF-3  51.3 
 
 		 204 aa  162  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1624  translation initiation factor IF-3  48.34 
 
 		 176 aa  162  3e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101313 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1906  translation initiation factor IF-3  48.34 
 
 		 173 aa  162  3e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2459  translation initiation factor 3  46.71 
 
 		 243 aa  162  3e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1316  translation initiation factor IF-3  45.99 
 
 		 351 aa  161  4.0000000000000004e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4232  translation initiation factor IF-3  48.34 
 
 		 173 aa  161  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00738998 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2996  translation initiation factor 3  48.3 
 
 		 238 aa  161  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.171641  normal  0.0309942 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1612  translation initiation factor IF-3  48.34 
 
 		 173 aa  161  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252676 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0713  translation initiation factor 3  48.75 
 
 		 249 aa  161  4.0000000000000004e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.814826 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2981  translation initiation factor 3  48.3 
 
 		 238 aa  161  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3025  translation initiation factor 3  48.3 
 
 		 238 aa  161  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.335133 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3052  translation initiation factor IF-3  49.7 
 
 		 182 aa  161  5.0000000000000005e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0425  translation initiation factor IF-3  49.01 
 
 		 171 aa  161  6e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00000964088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1412  translation initiation factor IF-3  54.07 
 
 		 143 aa  160  7e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000852308  normal  0.493061 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0333  translation initiation factor IF-3  47.71 
 
 		 194 aa  160  7e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.392305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2066  translation initiation factor 3  51.32 
 
 		 179 aa  159  1e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.383221  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0641  translation initiation factor IF-3  49.01 
 
 		 175 aa  160  1e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129727 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0588  translation initiation factor IF-3  47.06 
 
 		 194 aa  159  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.954262  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4675  translation initiation factor IF-3  49.34 
 
 		 177 aa  159  2e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.361003  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1937  translation initiation factor IF-3  47.06 
 
 		 194 aa  159  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0510424  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1882  translation initiation factor IF-3  52.67 
 
 		 204 aa  159  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0284235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0265  translation initiation factor IF-3  48.34 
 
 		 173 aa  159  2e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.910814  normal  0.332641 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3039  translation initiation factor IF-3  45.98 
 
 		 212 aa  159  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.271102  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1875  translation initiation factor IF-3  52.67 
 
 		 239 aa  159  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.384688 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14590  translation initiation factor 3  43.09 
 
 		 401 aa  159  3e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0069  translation initiation factor IF-3  45.7 
 
 		 171 aa  158  4e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.097761 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0488  translation initiation factor IF-3  44.75 
 
 		 184 aa  158  4e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.270402  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2538  translation initiation factor IF-3  47.68 
 
 		 173 aa  158  4e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.838605  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3169  translation initiation factor IF-3  49.33 
 
 		 277 aa  158  4e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>