166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2956 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2956  peptidase S16 lon domain protein  100 
 
 
200 aa  397  9.999999999999999e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.087431  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0737  peptidase S16, lon domain-containing protein  44.12 
 
 
210 aa  161  6e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0170  peptidase S16, lon domain-containing protein  45.1 
 
 
210 aa  160  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0575  peptidase S16, lon-like protein  43.84 
 
 
203 aa  149  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.739506  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0587  peptidase S16, lon domain-containing protein  43.84 
 
 
203 aa  149  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00769973 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0565  peptidase S16, lon domain-containing protein  43.84 
 
 
203 aa  149  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.544319 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10439  hypothetical protein  43 
 
 
217 aa  147  8e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.292057  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0959  peptidase S16 lon domain protein  43.14 
 
 
206 aa  132  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.61655  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3703  peptidase S16 lon domain-containing protein  35.38 
 
 
213 aa  100  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.597101  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2321  peptidase S16 lon domain protein  33.83 
 
 
222 aa  90.1  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0249432 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2427  peptidase S16, lon domain-containing protein  34.03 
 
 
190 aa  89  5e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.350159  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1414  peptidase S16 lon domain protein  42.59 
 
 
213 aa  86.7  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5731  peptidase S16 lon domain protein  35.11 
 
 
221 aa  87  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0885  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.34 
 
 
232 aa  80.1  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.465483  hitchhiker  0.0012634 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0444  peptidase S16 lon domain protein  43.07 
 
 
200 aa  78.6  0.00000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4088  peptidase S16 lon domain-containing protein  29.49 
 
 
233 aa  78.2  0.00000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.211402 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3340  peptidase S16 lon domain protein  34.3 
 
 
225 aa  76.6  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000299764  hitchhiker  0.0073566 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1793  peptidase S16 lon domain protein  40.74 
 
 
213 aa  77  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4864  peptidase S16, lon domain-containing protein  42.31 
 
 
209 aa  74.7  0.0000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2898  peptidase S16 lon domain protein  35.14 
 
 
220 aa  73.2  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000438482  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0066  peptidase S16, lon N-terminal  28.43 
 
 
210 aa  73.2  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.394074  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0664  peptidase S16 lon domain-containing protein  33.13 
 
 
216 aa  70.9  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0795384  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4979  peptidase S16, lon-like  28.57 
 
 
196 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.043652  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1487  peptidase S16, lon-like protein  39.82 
 
 
203 aa  69.3  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1149  peptidase S16, lon N-terminal  32.34 
 
 
225 aa  68.9  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0047  peptidase S16 lon domain protein  34.34 
 
 
213 aa  68.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3046  peptidase S16, lon domain-containing protein  32.82 
 
 
221 aa  68.6  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307779  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5080  peptidase S16 lon domain-containing protein  34.57 
 
 
224 aa  68.6  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.207681  hitchhiker  0.00573263 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1072  ATP-dependent protease La (LON) domain  31.36 
 
 
220 aa  67.8  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.281275  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1285  peptidase S16, lon  32.53 
 
 
216 aa  67.4  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00129165  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1828  peptidase S16, lon-like  38 
 
 
230 aa  67.4  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19471  ATP-dependent protease La  31.36 
 
 
220 aa  67.4  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0302  peptidase S16 lon domain protein  33.33 
 
 
196 aa  67.4  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0602  peptidase S16, lon domain-containing protein  43.02 
 
 
196 aa  67  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.607878  hitchhiker  0.0000000000989941 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1097  peptidase S16 lon domain protein  30.67 
 
 
212 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1068  peptidase S16 lon domain protein  30.67 
 
 
212 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16291  ATP-dependent protease La  32.76 
 
 
220 aa  66.2  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16861  ATP-dependent protease La  29.34 
 
 
218 aa  66.2  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0638  peptidase S16, lon N-terminal  28.78 
 
 
196 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00383335  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0525  peptidase S16  39.08 
 
 
194 aa  65.9  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.198265  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2421  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.25 
 
 
193 aa  65.9  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5732  peptidase S16 lon domain protein  38.26 
 
 
226 aa  65.9  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3182  peptidase S16 lon domain protein  32.82 
 
 
226 aa  65.9  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0464244  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0882  peptidase S16, lon-like  30.86 
 
 
218 aa  64.7  0.0000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000972451 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2009  peptidase S16, lon domain-containing protein  28.57 
 
 
191 aa  64.7  0.0000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0966504  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0284  peptidase S16 lon domain protein  46.43 
 
 
217 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5247  peptidase S16 lon domain-containing protein  40.66 
 
 
224 aa  64.3  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.469364  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3619  peptidase S16, lon-like  37.37 
 
 
229 aa  64.3  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2596  peptidase S16 lon domain protein  41.24 
 
 
215 aa  63.2  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1650  peptidase S16, lon domain-containing protein  27.75 
 
 
214 aa  63.5  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1411  peptidase S16 lon domain protein  40.66 
 
 
223 aa  62.8  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3049  peptidase S16, lon domain-containing protein  36.89 
 
 
234 aa  62.8  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3243  peptidase S16, lon domain-containing protein  41.24 
 
 
215 aa  62.8  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1598  ATP-dependent protease La (LON) domain  28.24 
 
 
218 aa  62.4  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0737  ATP-dependent protease La domain protein  27.45 
 
 
196 aa  62  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.825638  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0257  peptidase S16 lon domain protein  45.24 
 
 
217 aa  61.2  0.000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575451  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3197  peptidase S16, lon domain-containing protein  32.26 
 
 
232 aa  61.2  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.643868  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0349  peptidase S16, lon N-terminal  37.96 
 
 
220 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0706  peptidase S16 lon domain protein  31.74 
 
 
216 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.383851  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08320  Peptidase S16, lon N-terminal  43.18 
 
 
196 aa  60.8  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0361  peptidase S16 lon domain protein  38.46 
 
 
202 aa  60.8  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.18902 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0519  peptidase S16 lon domain-containing protein  30.3 
 
 
211 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23671  ATP-dependent protease La  30.83 
 
 
220 aa  60.5  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0556069 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1892  hypothetical protein  30.56 
 
 
193 aa  60.5  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16971  ATP-dependent protease La  29.52 
 
 
218 aa  59.7  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1097  hypothetical protein  41.38 
 
 
197 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.000805098  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2024  peptidase S16, lon-like  30.92 
 
 
217 aa  59.3  0.00000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.835929  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2856  peptidase S16, lon domain-containing protein  30.81 
 
 
211 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11940  hypothetical protein  40.23 
 
 
197 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000538  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1211  peptidase S16, lon domain-containing protein  40 
 
 
222 aa  58.9  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0186807 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17091  ATP-dependent protease La  28.24 
 
 
218 aa  58.9  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3807  peptidase S16, lon domain-containing protein  35.45 
 
 
194 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2714  peptidase S16 lon domain-containing protein  30.81 
 
 
211 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.17765 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0402  hypothetical protein  42.86 
 
 
216 aa  58.9  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0318  peptidase S16, lon-like  27.75 
 
 
211 aa  58.5  0.00000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0927048  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03286  hypothetical protein  36.36 
 
 
198 aa  58.5  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002698  hypothetical protein  37.08 
 
 
198 aa  58.2  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.268731  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2182  peptidase S16, lon-like  35.45 
 
 
211 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0235961  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2807  peptidase S16 lon domain-containing protein  35.45 
 
 
211 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.885555 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2796  peptidase S16, lon domain-containing protein  35.45 
 
 
211 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.549382  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3113  ATP-dependent protease La  42.86 
 
 
210 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0760  ATP-dependent protease La  42.86 
 
 
210 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0081  ATP-dependent protease La  42.86 
 
 
210 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1509  ATP-dependent protease La  42.86 
 
 
210 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0576  ATP-dependent protease La  42.86 
 
 
210 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0592  ATP-dependent protease La  42.86 
 
 
210 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2937  ATP-dependent protease La  42.86 
 
 
210 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0607  peptidase S16 lon domain-containing protein  28.49 
 
 
196 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6126  peptidase S16, lon-like  34.55 
 
 
211 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0230092  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0478  peptidase S16, lon-like  31.14 
 
 
212 aa  56.6  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.06422  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0321  peptidase S16 lon domain-containing protein  37.93 
 
 
211 aa  57  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02586  ATP-dependent protease La (LON) domain subfamily  29.1 
 
 
194 aa  56.2  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4689  peptidase S16, lon domain-containing protein  35.96 
 
 
196 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4867  peptidase S16 lon domain-containing protein  28.5 
 
 
196 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.39375  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4814  ATP-dependent protease La  35.96 
 
 
197 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.344958  normal  0.796434 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0481  ATP-dependent protease La  40.26 
 
 
210 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1639  peptidase S16, lon-like protein  30.1 
 
 
111 aa  55.5  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.194614  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3423  peptidase S16 lon domain-containing protein  32.18 
 
 
233 aa  55.5  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.327413  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1432  peptidase S16, lon-like  33.16 
 
 
224 aa  54.7  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.103336  normal  0.140978 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0296  peptidase S16, lon-like protein  36.11 
 
 
217 aa  54.3  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>