66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1093 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1093  ATPase  100 
 
 
457 aa  904    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2649  ATPase  35.79 
 
 
461 aa  258  1e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2641  ATPase  34.09 
 
 
458 aa  253  7e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.337326  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2821  ATPase  31.8 
 
 
474 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000929757  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2436  ATPase  32.81 
 
 
460 aa  242  9e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2684  ATPase  32.66 
 
 
463 aa  240  4e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2362  ATPase  30.8 
 
 
464 aa  238  2e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4044  ATPase  34.54 
 
 
463 aa  237  3e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2063  ATPase  32.8 
 
 
464 aa  235  1.0000000000000001e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1821  ATPase  35.54 
 
 
450 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4501  ATPase  31.39 
 
 
462 aa  232  1e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1512  putative AAA+ superfamily ATPase  30.6 
 
 
470 aa  224  2e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.406409  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2275  ATPase  34.87 
 
 
496 aa  218  2e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4199  ATPase  32.29 
 
 
471 aa  216  5e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.593601  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1051  ATPase  32.94 
 
 
431 aa  216  5.9999999999999996e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.709814  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0736  ATPase  34.43 
 
 
443 aa  215  9.999999999999999e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.299447  normal  0.251724 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0175  ATPase  32.06 
 
 
469 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.231845 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1429  putative AAA+ superfamily ATPase  30.41 
 
 
473 aa  211  3e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.541066  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2804  ATPase  30.43 
 
 
463 aa  208  1e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4809  ATPase  29.75 
 
 
460 aa  200  6e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0133  DUF234 DEXX-box ATPase  30.02 
 
 
462 aa  199  1.0000000000000001e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0812652  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0485  ATPase  32.35 
 
 
454 aa  197  3e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2719  ATPase  33.63 
 
 
420 aa  195  2e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0484066  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1083  ATPase  28.6 
 
 
469 aa  191  2e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1193  ATPase  29.61 
 
 
457 aa  187  3e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.460644  normal  0.228765 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2218  ATPase  33.04 
 
 
463 aa  186  6e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.747327 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0874  ATPase  29.29 
 
 
456 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0559719  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0533  ATPase  29.87 
 
 
439 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.543241  normal  0.111274 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1537  ATPase  31.6 
 
 
464 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.479678  normal  0.0536722 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2620  ATPase  26.03 
 
 
487 aa  169  7e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1446  ATPase  31.39 
 
 
439 aa  169  7e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.239907 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10540  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  23.79 
 
 
509 aa  154  4e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000147633  hitchhiker  0.0000000237286 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1683  ATPase  29.69 
 
 
456 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0421559  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1767  ATPase  28.01 
 
 
456 aa  153  7e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.53247  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1345  ATPase  30.97 
 
 
456 aa  152  1e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2667  DUF234 DEXX-box ATPase  27.29 
 
 
478 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.578936 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1424  ATPase  24.5 
 
 
472 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846928  normal  0.285417 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2329  hypothetical protein  23.58 
 
 
472 aa  126  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3408  ATPase  25.48 
 
 
498 aa  122  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1281  hypothetical protein  25.11 
 
 
475 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02740  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  23.74 
 
 
474 aa  103  7e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1025  ATPase  26.54 
 
 
454 aa  103  9e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.656086  normal  0.0180232 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1177  ATPase  24.92 
 
 
407 aa  96.3  1e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0919322 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0415  ATPase  26.68 
 
 
476 aa  87.8  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.336627  normal  0.189156 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2557  ATPase  23.76 
 
 
485 aa  87  6e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.928709  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4522  ATPase  19.71 
 
 
480 aa  81.6  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0310  ATPase  21.09 
 
 
472 aa  77.8  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.568965  hitchhiker  0.000284685 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1841  DUF234 DEXX-box ATPase  28.79 
 
 
313 aa  76.6  0.0000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2879  ATPase  21.81 
 
 
470 aa  75.5  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8891  hypothetical protein  20.98 
 
 
501 aa  74.3  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1219  hypothetical protein  28.78 
 
 
273 aa  72  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0883  hypothetical protein  33.1 
 
 
292 aa  71.2  0.00000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2114  DUF234 DEXX-box ATPase  31.01 
 
 
304 aa  70.1  0.00000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0813  hypothetical protein  28.78 
 
 
292 aa  70.1  0.00000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.287694  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1237  ATPase  31.58 
 
 
261 aa  65.1  0.000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0500  ATPase  33.09 
 
 
279 aa  64.7  0.000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0136  hypothetical protein  22.93 
 
 
304 aa  64.3  0.000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0397  ATPase  34.92 
 
 
277 aa  63.2  0.00000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0594  conserved hypothetical protein (DUF234 domain protein)  31.01 
 
 
283 aa  60.1  0.00000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000231419  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0081  ATPase  33.08 
 
 
307 aa  59.7  0.0000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00107547  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1130  ATPase  22.47 
 
 
421 aa  58.5  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0498  hypothetical protein  31.73 
 
 
105 aa  53.9  0.000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2379  ATPase  26.81 
 
 
356 aa  51.2  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1207  ATPase  24.94 
 
 
408 aa  50.1  0.00008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1739  ATPase  24.9 
 
 
383 aa  48.5  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1794  ATPase  24.12 
 
 
365 aa  47.8  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0171546  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>