More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0320 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0320  tryptophanyl-tRNA synthetase  100 
 
 
331 aa  690    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0887  tryptophanyl-tRNA synthetase  70.82 
 
 
327 aa  504  9.999999999999999e-143  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.512903  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0428  tryptophanyl-tRNA synthetase  72.87 
 
 
328 aa  502  1e-141  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0443  tryptophanyl-tRNA synthetase  72.87 
 
 
328 aa  502  1e-141  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0352  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.66 
 
 
325 aa  440  9.999999999999999e-123  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0686  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.67 
 
 
329 aa  377  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1469  tryptophanyl-tRNA synthetase  58.77 
 
 
329 aa  363  2e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0792  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.08 
 
 
325 aa  363  3e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00324527  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0682  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.44 
 
 
330 aa  362  4e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.415308  normal  0.0278863 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2171  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.6 
 
 
331 aa  356  3.9999999999999996e-97  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.44803  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2260  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.6 
 
 
330 aa  355  5e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1300  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.88 
 
 
324 aa  355  6.999999999999999e-97  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1685  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.99 
 
 
331 aa  350  2e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.26874  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2250  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.15 
 
 
327 aa  350  2e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000268792  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0775  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.62 
 
 
329 aa  350  3e-95  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.203902  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3860  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.75 
 
 
359 aa  349  3e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.968888  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1833  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.92 
 
 
327 aa  344  1e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.985699  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1925  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.31 
 
 
327 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2298  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.62 
 
 
327 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2119  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.4 
 
 
332 aa  342  5e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.926064  normal  0.0320454 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2757  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.15 
 
 
329 aa  342  5.999999999999999e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000506928  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3607  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.99 
 
 
329 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0032  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.08 
 
 
329 aa  336  2.9999999999999997e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1687  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.23 
 
 
326 aa  335  5.999999999999999e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0957395  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0765  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.68 
 
 
330 aa  335  9e-91  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.664559  normal  0.580666 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2825  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.81 
 
 
329 aa  330  3e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2336  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.77 
 
 
329 aa  328  6e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1882  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.77 
 
 
328 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0014344  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1960  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.53 
 
 
328 aa  323  2e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000535382  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1133  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.62 
 
 
330 aa  324  2e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.698787  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3426  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.07 
 
 
326 aa  313  3.9999999999999997e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2236  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.94 
 
 
340 aa  311  1e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.139935  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1201  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.3 
 
 
327 aa  306  4.0000000000000004e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0072  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.35 
 
 
354 aa  304  1.0000000000000001e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2482  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.8 
 
 
340 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2877  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.76 
 
 
348 aa  299  6e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2700  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.65 
 
 
340 aa  294  2e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1597  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.06 
 
 
404 aa  292  4e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08970  Tryptophanyl-tRNA synthetase  47.26 
 
 
333 aa  291  8e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1399  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.05 
 
 
404 aa  291  1e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2090  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.56 
 
 
342 aa  291  1e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.679306  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0720  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.2 
 
 
404 aa  290  3e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2485  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.59 
 
 
340 aa  288  1e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0895292  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0672  tryptophan--tRNA ligase  47.26 
 
 
331 aa  287  2e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0240521  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0739  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.15 
 
 
402 aa  285  5e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1081  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.95 
 
 
400 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.785266  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0985  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.95 
 
 
400 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.103287 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1143  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.95 
 
 
400 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.422783  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1919  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.34 
 
 
337 aa  281  2e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00690514  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0993  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.15 
 
 
400 aa  277  2e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498703  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0142  tryptophanyl-tRNA synthetase  44 
 
 
327 aa  276  3e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0845  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.65 
 
 
400 aa  276  4e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1837  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.56 
 
 
404 aa  275  8e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394357  normal  0.603848 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1038  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.6 
 
 
405 aa  273  3e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.548207  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0584  tryptophanyl-tRNA synthetase  40 
 
 
405 aa  273  3e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.118419  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1525  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.81 
 
 
400 aa  270  2e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0769059 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0037  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.79 
 
 
330 aa  271  2e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1154  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.48 
 
 
323 aa  268  1e-70  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1125  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.79 
 
 
323 aa  267  2e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1343  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.48 
 
 
323 aa  266  4e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163691  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1429  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.29 
 
 
400 aa  266  5e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2317  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.8 
 
 
400 aa  263  4e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1602  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.9 
 
 
333 aa  262  4.999999999999999e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.598858  normal  0.880818 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1224  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.95 
 
 
373 aa  257  2e-67  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.142423  normal  0.402373 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0385  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.95 
 
 
391 aa  257  2e-67  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.431815  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3480  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.99 
 
 
331 aa  256  5e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000674679  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1145  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.6 
 
 
352 aa  252  5.000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000761726 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2157  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.54 
 
 
335 aa  251  9.000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108936 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1456  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.24 
 
 
335 aa  249  5e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256847  normal  0.958171 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2145  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.87 
 
 
356 aa  244  1.9999999999999999e-63  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.106152  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0034  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.87 
 
 
356 aa  244  1.9999999999999999e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0450  tryptophanyl-tRNA synthetase II  41.77 
 
 
342 aa  243  3.9999999999999997e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.481954 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0058  tryptophanyl-tRNA synthetase II  44.35 
 
 
341 aa  239  2.9999999999999997e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00653714  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1608  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 
339 aa  236  3e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.342366  normal  0.0200514 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0005  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.25 
 
 
351 aa  236  5.0000000000000005e-61  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1247  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.57 
 
 
360 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.258523  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1588  tryptophanyl-tRNA synthetase II  41.55 
 
 
357 aa  234  2.0000000000000002e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00279231  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1406  tryptophanyl-tRNA synthetase II  42.26 
 
 
335 aa  234  2.0000000000000002e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0956  tryptophanyl-tRNA synthetase II  41.57 
 
 
346 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2528  tryptophanyl-tRNA synthetase II  41.57 
 
 
346 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1609  tryptophanyl-tRNA synthetase II  41.57 
 
 
346 aa  231  9e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0230  tryptophanyl-tRNA synthetase II  41.57 
 
 
346 aa  231  9e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2670  tryptophanyl-tRNA synthetase II  41.57 
 
 
346 aa  231  9e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.552159  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1413  tryptophanyl-tRNA synthetase II  41.57 
 
 
346 aa  231  9e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.718903  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0267  tryptophanyl-tRNA synthetase II  41.57 
 
 
346 aa  231  9e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0204  tryptophanyl-tRNA synthetase II  41.32 
 
 
340 aa  231  1e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2168  tryptophanyl-tRNA synthetase II  43.28 
 
 
341 aa  230  2e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00044454  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0501  tryptophanyl-tRNA synthetase II  41.28 
 
 
366 aa  229  5e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.163921  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0440  tryptophanyl-tRNA synthetase II  41.59 
 
 
342 aa  229  5e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1993  tryptophanyl-tRNA synthetase II  44.21 
 
 
340 aa  229  6e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0015923  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1138  tryptophanyl-tRNA synthetase II  40.72 
 
 
339 aa  228  2e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0656851 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0343  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.08 
 
 
392 aa  226  4e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000289554  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0201  tryptophanyl-tRNA synthetase II  42.51 
 
 
346 aa  226  6e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.231145 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1856  tryptophanyl-tRNA synthetase II  43.84 
 
 
339 aa  225  9e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3078  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 
324 aa  224  1e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0512  tryptophanyl-tRNA synthetase II  40.96 
 
 
346 aa  223  3e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0406  tryptophanyl-tRNA synthetase II  41.95 
 
 
342 aa  223  4e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175639  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7191  tryptophanyl-tRNA synthetase II  41.64 
 
 
342 aa  222  6e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0874  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.81 
 
 
346 aa  221  9.999999999999999e-57  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1686  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.54 
 
 
400 aa  221  9.999999999999999e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>