More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1693 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1693  formyltetrahydrofolate deformylase  100 
 
 		 290 aa  603  9.999999999999999e-173  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1367  formyltetrahydrofolate deformylase  72.24 
 
 		 283 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0129513  normal  0.181813 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4447  formyltetrahydrofolate deformylase  72.24 
 
 		 283 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000794151  decreased coverage  0.00000544491 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1007  formyltetrahydrofolate deformylase  71.89 
 
 		 283 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000029138  hitchhiker  0.000000000000593821 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4436  formyltetrahydrofolate deformylase  72.86 
 
 		 282 aa  436  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00849533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4356  formyltetrahydrofolate deformylase  72.24 
 
 		 283 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000805788  normal  0.0308915 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56060  formyltetrahydrofolate deformylase  71.89 
 
 		 283 aa  434  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4882  formyltetrahydrofolate deformylase  71.89 
 
 		 283 aa  432  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.784471  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3312  formyltetrahydrofolate deformylase  71.89 
 
 		 283 aa  432  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.929874  normal  0.815852 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4314  formyltetrahydrofolate deformylase  71.89 
 
 		 283 aa  428  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000262425  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4018  formyltetrahydrofolate deformylase  71.79 
 
 		 283 aa  426  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0329939  normal  0.0297352 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2073  formyltetrahydrofolate deformylase  72.24 
 
 		 288 aa  426  1e-118  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0345334  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38280  formyltetrahydrofolate deformylase  69.64 
 
 		 283 aa  423  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1020  formyltetrahydrofolate deformylase  66.31 
 
 		 284 aa  410  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5913  formyltetrahydrofolate deformylase  67.26 
 
 		 296 aa  402  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.779943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2051  formyltetrahydrofolate deformylase  66.19 
 
 		 285 aa  399  9.999999999999999e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000424508  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0584  formyltetrahydrofolate deformylase  64.79 
 
 		 291 aa  394  1e-109  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4033  formyltetrahydrofolate deformylase  65.95 
 
 		 287 aa  391  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.971472  hitchhiker  0.00329385 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1789  formyltetrahydrofolate deformylase  63.8 
 
 		 283 aa  391  1e-108  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0174  formyltetrahydrofolate deformylase  65.96 
 
 		 287 aa  394  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0056  formyltetrahydrofolate deformylase  64.64 
 
 		 289 aa  390  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.333172  normal  0.573023 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1352  formyltetrahydrofolate deformylase  64.64 
 
 		 282 aa  390  1e-107  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000782528  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1740  formyltetrahydrofolate deformylase  62.14 
 
 		 286 aa  368  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0486  formyltetrahydrofolate deformylase  56.07 
 
 		 284 aa  352  5e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6765  formyltetrahydrofolate deformylase  58.8 
 
 		 291 aa  351  8.999999999999999e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0786  formyltetrahydrofolate deformylase  59.93 
 
 		 316 aa  345  6e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02600  formyltetrahydrofolate deformylase  58.04 
 
 		 292 aa  339  2.9999999999999998e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.304695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2552  formyltetrahydrofolate deformylase  55.87 
 
 		 284 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445829 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3654  formyltetrahydrofolate deformylase  58.3 
 
 		 290 aa  332  4e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4965  formyltetrahydrofolate deformylase  57.45 
 
 		 289 aa  321  9.000000000000001e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2543  formyltetrahydrofolate deformylase  55.56 
 
 		 300 aa  318  7.999999999999999e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1631  formyltetrahydrofolate deformylase  54.12 
 
 		 300 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043119  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0375  formyltetrahydrofolate deformylase  51.77 
 
 		 283 aa  312  3.9999999999999997e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1522  formyltetrahydrofolate deformylase  55.87 
 
 		 287 aa  312  4.999999999999999e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0556  formyltetrahydrofolate deformylase  53.24 
 
 		 297 aa  311  7.999999999999999e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00467  formyltetrahydrofolate deformylase  53.01 
 
 		 267 aa  310  1e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5709  formyltetrahydrofolate deformylase  53.33 
 
 		 287 aa  307  1.0000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.506805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2434  formyltetrahydrofolate deformylase  51.77 
 
 		 296 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1488  formyltetrahydrofolate deformylase  56.18 
 
 		 296 aa  306  4.0000000000000004e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.973322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1110  formyltetrahydrofolate deformylase  55.71 
 
 		 303 aa  305  7e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.344472  normal  0.241232 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0323  formyltetrahydrofolate deformylase  55.79 
 
 		 286 aa  304  1.0000000000000001e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0419  formyltetrahydrofolate deformylase  53.02 
 
 		 282 aa  304  1.0000000000000001e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0700542  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0428  formyltetrahydrofolate deformylase  53.02 
 
 		 282 aa  304  1.0000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2544  formyltetrahydrofolate deformylase  55.56 
 
 		 282 aa  302  4.0000000000000003e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.553017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0297  formyltetrahydrofolate deformylase  52.84 
 
 		 282 aa  301  1e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.338729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0127  formyltetrahydrofolate deformylase  53.43 
 
 		 282 aa  298  7e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0534  formyltetrahydrofolate deformylase  51.9 
 
 		 294 aa  297  1e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0336  formyltetrahydrofolate deformylase  52.46 
 
 		 287 aa  298  1e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7341  formyltetrahydrofolate deformylase  55.2 
 
 		 284 aa  297  1e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0997377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0706  formyltetrahydrofolate deformylase  53.02 
 
 		 282 aa  296  2e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2099  formyltetrahydrofolate deformylase  53.1 
 
 		 289 aa  296  2e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.810337  normal  0.272125 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0606  formyltetrahydrofolate deformylase  52.11 
 
 		 289 aa  296  3e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930988 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1837  formyltetrahydrofolate deformylase  51.55 
 
 		 290 aa  295  5e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.457824  normal  0.78955 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2993  formyltetrahydrofolate deformylase  53.43 
 
 		 280 aa  294  1e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2699  formyltetrahydrofolate deformylase  50.87 
 
 		 294 aa  294  1e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.622702  normal  0.252245 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2012  formyltetrahydrofolate deformylase  51.77 
 
 		 287 aa  294  1e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0750038 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0438  formyltetrahydrofolate deformylase  51.77 
 
 		 282 aa  294  1e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2167  formyltetrahydrofolate deformylase  50.87 
 
 		 294 aa  294  1e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2841  formyltetrahydrofolate deformylase  50.87 
 
 		 294 aa  294  1e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2781  formyltetrahydrofolate deformylase  50.87 
 
 		 294 aa  294  1e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.184484  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3853  formyltetrahydrofolate deformylase  53.33 
 
 		 287 aa  293  2e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.565594  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2792  formyltetrahydrofolate deformylase  50.87 
 
 		 294 aa  293  2e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.329734 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4352  formyltetrahydrofolate deformylase  52.74 
 
 		 299 aa  293  2e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.157663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1577  formyltetrahydrofolate deformylase  52.65 
 
 		 287 aa  293  2e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.621505 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0189  formyltetrahydrofolate deformylase  50.71 
 
 		 284 aa  293  2e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00979575 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0523  formyltetrahydrofolate deformylase  53.19 
 
 		 289 aa  293  2e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6111  formyltetrahydrofolate deformylase  51.21 
 
 		 294 aa  293  3e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.481987  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2382  formyltetrahydrofolate deformylase  52.98 
 
 		 285 aa  292  4e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4164  formyltetrahydrofolate deformylase  52.28 
 
 		 287 aa  292  4e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.500211  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4789  formyltetrahydrofolate deformylase  52.33 
 
 		 285 aa  292  4e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4562  formyltetrahydrofolate deformylase  51.94 
 
 		 287 aa  291  6e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307485  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2419  formyltetrahydrofolate deformylase  52.33 
 
 		 287 aa  292  6e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0648  formyltetrahydrofolate deformylase  51.25 
 
 		 282 aa  292  6e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.101006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4112  formyltetrahydrofolate deformylase  51.41 
 
 		 289 aa  291  8e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2012  formyltetrahydrofolate deformylase  53.05 
 
 		 299 aa  291  9e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.436066  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0154  formyltetrahydrofolate deformylase  52.71 
 
 		 283 aa  291  9e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00603763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0609  formyltetrahydrofolate deformylase  51.61 
 
 		 282 aa  291  1e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1951  formyltetrahydrofolate deformylase  52.69 
 
 		 286 aa  290  2e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1583  formyltetrahydrofolate deformylase  52.3 
 
 		 287 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1866  formyltetrahydrofolate deformylase  52.69 
 
 		 286 aa  290  2e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1695  formyltetrahydrofolate deformylase  54.64 
 
 		 295 aa  290  3e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0684131  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3457  formyltetrahydrofolate deformylase  51.79 
 
 		 284 aa  289  3e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0496  formyltetrahydrofolate deformylase  52.08 
 
 		 293 aa  289  4e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.275042  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0643  formyltetrahydrofolate deformylase  52.52 
 
 		 284 aa  289  4e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1883  formyltetrahydrofolate deformylase  52.23 
 
 		 291 aa  288  6e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0189555 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6004  formyltetrahydrofolate deformylase  51.25 
 
 		 293 aa  288  7e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.91162  normal  0.0315018 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0467  formyltetrahydrofolate deformylase  49.28 
 
 		 293 aa  287  1e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2094  formyltetrahydrofolate deformylase  50.35 
 
 		 298 aa  287  1e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0689957  normal  0.0344586 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2971  formyltetrahydrofolate deformylase  51.61 
 
 		 294 aa  286  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.266607 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28050  formyltetrahydrofolate deformylase  51.99 
 
 		 302 aa  286  2e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0961827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1591  formyltetrahydrofolate deformylase  50.35 
 
 		 284 aa  285  4e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1153  formyltetrahydrofolate deformylase  49.82 
 
 		 284 aa  286  4e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.677496  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1114  formyltetrahydrofolate deformylase  50.36 
 
 		 286 aa  285  4e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.851375  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4374  formyltetrahydrofolate deformylase  47.89 
 
 		 284 aa  285  5e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1873  formyltetrahydrofolate deformylase  50.17 
 
 		 288 aa  285  5e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00824927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4436  formyltetrahydrofolate deformylase  47.89 
 
 		 284 aa  285  5e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.180137 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1795  formyltetrahydrofolate deformylase  52.14 
 
 		 286 aa  285  5e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2613  formyltetrahydrofolate deformylase  52.14 
 
 		 294 aa  285  5e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.705504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4904  formyltetrahydrofolate deformylase  52.14 
 
 		 294 aa  285  5e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1628  formyltetrahydrofolate deformylase  51.97 
 
 		 298 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0459247  normal  0.542854 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>