142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1053 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1053  hypothetical protein  100 
 
 		 215 aa  435  1e-121  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0459  hypothetical protein  49.5 
 
 		 212 aa  216  2e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002936  thioredoxin  47 
 
 		 209 aa  200  9.999999999999999e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000472775  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1753  hypothetical protein  46.7 
 
 		 207 aa  192  2e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.731876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2644  hypothetical protein  43.2 
 
 		 209 aa  191  1e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0075  hypothetical protein  46.19 
 
 		 206 aa  189  2e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1413  hypothetical protein  45.5 
 
 		 209 aa  189  4e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0401797  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0530  hypothetical protein  47.67 
 
 		 208 aa  185  4e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000790995  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3568  hypothetical protein  44.81 
 
 		 213 aa  184  6e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1963  DSBA oxidoreductase  41.29 
 
 		 207 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00619259  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02994  protein-disulfide isomerase  44.21 
 
 		 198 aa  176  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4446  hypothetical protein  42.93 
 
 		 208 aa  170  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0048258 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3102  protein-disulfide isomerase-like protein  37.5 
 
 		 221 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.967383  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1051  hypothetical protein  27.88 
 
 		 242 aa  106  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0212434  normal  0.0155406 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0606  putative protein-disulfide isomerase  27.88 
 
 		 238 aa  106  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872062  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2046  hypothetical protein  34.78 
 
 		 207 aa  98.2  8e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0174425  normal  0.659871 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1769  putative protein-disulfide isomerase  35.23 
 
 		 207 aa  95.5  5e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0763119  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2620  thioredoxin domain-containing protein  30.54 
 
 		 259 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0725  DSBA oxidoreductase  31.96 
 
 		 221 aa  93.2  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.246686  normal  0.929424 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0545  hypothetical protein  26.9 
 
 		 200 aa  93.2  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1366  DSBA oxidoreductase  33.66 
 
 		 210 aa  92  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.28938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1688  conserved hypothetical protein, thioredoxin-like fold  29.81 
 
 		 210 aa  91.7  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.746509  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0778  hypothetical protein  32.86 
 
 		 221 aa  90.5  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.544779  normal  0.0154482 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0795  DSBA oxidoreductase  32.08 
 
 		 221 aa  90.1  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0142876  normal  0.0910349 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4660  hypothetical protein  32.38 
 
 		 212 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4089  hypothetical protein  30.43 
 
 		 211 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53160  hypothetical protein  32.02 
 
 		 200 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3955  DSBA oxidoreductase  32.67 
 
 		 210 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0174672 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2712  dithiol-disulfide isomerase  25.13 
 
 		 223 aa  86.3  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1735  hypothetical protein  36.31 
 
 		 210 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.824558  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1694  DSBA oxidoreductase  31.88 
 
 		 210 aa  85.5  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.274727 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6744  thioredoxin-like fold  28.08 
 
 		 214 aa  85.5  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34850  DSBA oxidoreductase  33.5 
 
 		 199 aa  84.3  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2523  DSBA oxidoreductase  30.37 
 
 		 300 aa  84  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1350  DSBA oxidoreductase  31.84 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1273  DSBA oxidoreductase  29.32 
 
 		 303 aa  81.6  0.000000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3657  DSBA oxidoreductase  33.98 
 
 		 210 aa  81.3  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.381267 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6828  conserved hypothetical protein, thioredoxin-like fold protein  32.14 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.391464 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22500  protein-disulfide isomerase  24.88 
 
 		 244 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000773657  hitchhiker  0.0000178225 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3640  protein-disulfide isomerase  26.67 
 
 		 242 aa  73.9  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0336  hypothetical protein  30.32 
 
 		 209 aa  73.2  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.483638  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5215  hypothetical protein  26.64 
 
 		 336 aa  71.2  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00274094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000937  hypothetical protein  28.28 
 
 		 206 aa  68.2  0.00000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.043372  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0279  protein-disulfide isomerase  29.1 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000930867  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1625  hypothetical protein  27.12 
 
 		 297 aa  67  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0058  hypothetical protein  32.26 
 
 		 233 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2043  thioredoxin  24.88 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0950  thioredoxin  29.1 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0770  hypothetical protein  24.86 
 
 		 297 aa  65.5  0.0000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4381  thioredoxin  29.1 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.583730000000001e-23 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1759  DSBA oxidoreductase  31.28 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7778  DSBA oxidoreductase  31.09 
 
 		 215 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5479  thioredoxin  28.57 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603844 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2391  dithiol-disulfide isomerase  22.49 
 
 		 319 aa  63.2  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.20777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3237  DSBA oxidoreductase  25.65 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4159  polyketide biosynthesis dithiol-disulfide isomerase-like protein  25.14 
 
 		 328 aa  60.5  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0294  hypothetical protein  23.76 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1561  DSBA oxidoreductase  24.65 
 
 		 305 aa  58.9  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000756973  normal  0.805709 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1753  hypothetical protein  31.34 
 
 		 245 aa  57.8  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.93705  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0301  DSBA oxidoreductase  27.45 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.220851  normal  0.256868 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3841  hypothetical protein  29.65 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.782723 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1542  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  30.06 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1372  hypothetical protein  33.33 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0623516  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2460  protein-disulfide isomerase  33.33 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161957  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0358  hypothetical protein  33.33 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.496177  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0636  hypothetical protein  33.33 
 
 		 249 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1267  hypothetical protein  33.33 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.42251  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1193  hypothetical protein  33.33 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0935  hypothetical protein  33.33 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0966  hypothetical protein  25.85 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1656  DSBA oxidoreductase  21.11 
 
 		 231 aa  54.7  0.0000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000319257  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3255  hypothetical protein  25.85 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0101602  hitchhiker  0.0000000123908 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1019  hypothetical protein  25.85 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1089  putative protein-disulfide isomerase  27.69 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3039  putative protein-disulfide isomerase  27.46 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.41836 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1115  hypothetical protein  20.99 
 
 		 297 aa  53.5  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1605  DSBA oxidoreductase  27.14 
 
 		 215 aa  53.1  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1208  hypothetical protein  20.99 
 
 		 297 aa  53.5  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4092  hypothetical protein  21.23 
 
 		 297 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1249  hypothetical protein  20.79 
 
 		 297 aa  52  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2351  hypothetical protein  29.93 
 
 		 214 aa  52  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5788  DSBA oxidoreductase  27.23 
 
 		 215 aa  52  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0487063 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1564  DsbA oxidoreductase  29.41 
 
 		 212 aa  52  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0406976  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1316  hypothetical protein  21.23 
 
 		 297 aa  51.6  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.895011  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1354  hypothetical protein  21.23 
 
 		 297 aa  51.6  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1097  hypothetical protein  20.99 
 
 		 297 aa  51.2  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1091  cytosolic protein  20.99 
 
 		 297 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.726391  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0633  DSBA oxidoreductase  27.14 
 
 		 220 aa  51.6  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.218426  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0115  DSBA oxidoreductase  29.19 
 
 		 232 aa  51.2  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.133072  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1278  hypothetical protein  20.99 
 
 		 297 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22550  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  27.84 
 
 		 227 aa  51.6  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0261  DSBA oxidoreductase  27.98 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0132035 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0654  DSBA oxidoreductase  25.74 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3318  DSBA oxidoreductase  27.32 
 
 		 227 aa  50.4  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1475  DSBA oxidoreductase  21.62 
 
 		 220 aa  49.7  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1089  putative protein-disulfide isomerase  26.67 
 
 		 217 aa  48.9  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1155  putative protein-disulfide isomerase  27.18 
 
 		 217 aa  48.9  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.400146 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1677  DSBA oxidoreductase  21.08 
 
 		 229 aa  48.9  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1104  hypothetical protein  20.67 
 
 		 297 aa  48.5  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7204  DSBA oxidoreductase  26.34 
 
 		 221 aa  48.5  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>